RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 DPH5Q9H2P9 285 aa23.89■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 GARSP41250 739 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 VSNL1P62760 191 aa23.88■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 AP1B1Q10567 949 aa23.88■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 DUPD1Q68J44 220 aa23.88■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 LZTR1Q8N653 840 aa23.88■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa23.88■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 PLK2Q9NYY3 685 aa23.88■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 ZNF510Q9Y2H8 683 aa23.88■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 TBL1XO60907 577 aa23.87■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 GAS8O95995 478 aa23.87■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 KRT14P02533 472 aa23.87■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 CDH4P55283 916 aa23.87■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 HMCESQ96FZ2 354 aa23.87■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 MYADMQ96S97 322 aa23.87■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 GDE1Q9NZC3 331 aa23.87■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 WNT6Q9Y6F9 365 aa23.87■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 IVDP26440 423 aa23.87■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 LMNB2Q03252 620 aa23.87■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 PTK6Q13882 451 aa23.87■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa23.87■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 CPXM2Q8N436 756 aa23.87■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 MYLIPQ8WY64 445 aa23.87■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 SMARCD2Q92925 531 aa23.87■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 CEP41Q9BYV8 373 aa23.87■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 POMKQ9H5K3 350 aa23.87■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 GDF3Q9NR23 364 aa23.87■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 CDH7Q9ULB5 785 aa23.87■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 SNX24Q9Y343 169 aa23.87■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 RAD54BQ9Y620 910 aa23.87■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 A0A0D9SEW6 157 aa23.86■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 H3BQ06 376 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 KCNK1O00180 336 aa23.86■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 MYBL2P10244 700 aa23.86■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 WEE1P30291 646 aa23.86■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 CHKAP35790 457 aa23.86■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 RPL21P46778 160 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 TMEM25Q86YD3 366 aa23.86■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 SMRP1Q8NCR6 262 aa23.86■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 SEC14L1Q92503 715 aa23.86■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 CLEC4EQ9ULY5 219 aa23.86■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 DOCK8Q8NF50 2099 aa23.86■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 A0A1B0GVM2 712 aa23.85■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 TCAF2A6NFQ2 919 aa23.85■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 HACD1B0YJ81 288 aa23.85■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 RASA4BC9J798 803 aa23.85■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 RASA4O43374 803 aa23.85■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 CLDN11O75508 207 aa23.85■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 TCF3P15923 654 aa23.85■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 FCARP24071 287 aa23.85■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 STIP1P31948 543 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 ACVRL1P37023 503 aa23.85■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 CARSP49589 748 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 NDST2P52849 883 aa23.85■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 FSCBQ5H9T9 825 aa23.85■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 WFDC5Q8TCV5 224 aa23.85■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 HTR3CQ8WXA8 447 aa23.85■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 HDAC11Q96DB2 347 aa23.85■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 ASIC3Q9UHC3 531 aa23.85■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 NCAM2O15394 837 aa23.85■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 MAFKO60675 156 aa23.85■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 MX2P20592 715 aa23.85■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 RPL22P35268 128 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 MAPKAPK2P49137 400 aa23.85■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 CCDC89Q8N998 374 aa23.85■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 DDI1Q8WTU0 396 aa23.85■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 IFT81Q8WYA0 676 aa23.85■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 RTP4Q96DX8 246 aa23.85■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 RAMP2O60895 175 aa23.84■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 WASHC5Q12768 1159 aa23.84■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 TANGO2Q6ICL3 276 aa23.84■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 CHST9Q7L1S5 443 aa23.84■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa23.84■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 CARNMT1Q8N4J0 409 aa23.84■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 CCDC110Q8TBZ0 833 aa23.84■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 ASIC4Q96FT7 647 aa23.84■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 RAB17Q9H0T7 212 aa23.84■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 SEPT10Q9P0V9 454 aa23.84■■□□□ 1.41
CNN3-202ENST00000394202 RAB21Q9UL25 225 aa23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms