RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 GGCXP38435 758 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 AFMP43652 599 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 PSEN1P49768 467 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 RGS7P49802 495 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 ERVPABLB-1P60509 514 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 TLE1Q04724 770 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 PDE4CQ08493 712 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 STK4Q13043 487 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 FGL2Q14314 439 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 CLCA4Q14CN2 919 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 TCEA2Q15560 299 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGFBP7Q16270 282 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 CDKN3Q16667 212 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARL13BQ3SXY8 428 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADGRF1Q5T601 910 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 BROXQ5VW32 411 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 BSPRYQ5W0U4 402 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 SEL1L3Q68CR1 1132 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 PM20D1Q6GTS8 502 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 BRAPQ7Z569 592 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 MFN1Q8IWA4 741 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 RBFAQ8N0V3 343 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 CARNMT1Q8N4J0 409 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM145Q8NBT3 493 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 ENGASEQ8NFI3 743 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 UBA3Q8TBC4 463 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 IFI44Q8TCB0 444 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 FRS2Q8WU20 508 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 EEF2KMTQ96G04 330 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC46A1Q96NT5 459 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 DEPDC7Q96QD5 511 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 NT5C1AQ9BXI3 368 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 DCLK3Q9C098 648 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 TNMDQ9H2S6 317 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 KIAA1586Q9HCI6 787 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 WDR70Q9NW82 654 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 RABGEF1Q9UJ41 708 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 FZD4Q9ULV1 537 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 SMC3Q9UQE7 1217 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF510Q9Y2H8 683 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 FBN2P35556 2912 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 UBE4BO95155 1302 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 CLEC18AA5D8T8 446 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 RAD51BO15315 384 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 YKT6O15498 198 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPINT1O43278 529 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 TIMM44O43615 452 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 STX6O43752 255 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 ACSL4O60488 711 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 TNFSF15O95150 251 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 BMP15O95972 392 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 IL1BP01584 269 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 NR3C1P04150 777 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 THEGLP0DJG4 465 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 LCP1P13796 627 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 GOT1P17174 413 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 ETV5P41161 510 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 UCNP55089 124 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 DAOAP59103 153 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 CENPCQ03188 943 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 KCNMA1Q12791 1236 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC39A14Q15043 492 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 SKIDA1Q1XH10 827 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF284Q2VY69 593 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 DCAF6Q58WW2 860 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 KCTD16Q68DU8 428 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 MSANTD2Q6P1R3 559 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 CNNM4Q6P4Q7 775 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 CLEC18BQ6UXF7 455 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC81Q6ZN84 652 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 Q6ZVU0 165 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 UNC13DQ70J99 1090 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 SFTPA2Q8IWL1 248 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 CLEC18CQ8NCF0 446 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 FIBINQ8TAL6 211 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 TFAP2BQ92481 460 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 GOLGA1Q92805 767 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 C7orf25Q9BPX7 421 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 CALN1Q9BXU9 219 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-171P-201ENST00000384354 BACH2Q9BYV9 841 aa5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms