RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
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PGGT1B-202ENST00000379615 HHIPQ96QV1 700 aa15.82■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 MUC3BQ9H195 1237 aa15.82■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa15.82■□□□□ 0.12
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PGGT1B-202ENST00000379615 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa15.82■□□□□ 0.12
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PGGT1B-202ENST00000379615 AP4E1Q9UPM8 1137 aa15.82■□□□□ 0.12
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PGGT1B-202ENST00000379615 LRCH4O75427 683 aa15.81■□□□□ 0.12
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PGGT1B-202ENST00000379615 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa15.81■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP15.81■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa15.8■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa15.8■□□□□ 0.12
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PGGT1B-202ENST00000379615 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1W2PQF6 199 aa15.79■□□□□ 0.12
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PGGT1B-202ENST00000379615 NDUFA10O95299 355 aa15.79■□□□□ 0.12
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PGGT1B-202ENST00000379615 MAN1A1P33908 653 aa15.79■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 VASPP50552 380 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 TCEAL1Q15170 157 aa15.79■□□□□ 0.12
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PGGT1B-202ENST00000379615 RASSF3Q86WH2 238 aa15.79■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM72BQ86X60 149 aa15.79■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 PYROXD2Q8N2H3 581 aa15.79■□□□□ 0.12
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PGGT1B-202ENST00000379615 DCAF4L2Q8NA75 395 aa15.79■□□□□ 0.12
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PGGT1B-202ENST00000379615 SPON2Q9BUD6 331 aa15.79■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM245Q9H330 911 aa15.79■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 HPCAL4Q9UM19 191 aa15.79■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa15.79■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 DOCK4Q8N1I0 1966 aa15.78■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM186AA6NE01 2351 aa15.78■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 GPR179Q6PRD1 2367 aa15.78■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 PROB1E7EW31 1015 aa15.78■□□□□ 0.12
PGGT1B-202ENST00000379615 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
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