RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377958.6

IKZF3-210, Transcript of IKAROS family zinc finger 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene IKZF3, Length 1,837 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF3-210ENST00000377958 TRIM43BA6NCK2 446 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 C2CD4BA6NLJ0 364 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 GOLGA8CPA6NN73 597 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 KPNA7A9QM74 516 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 TCP11X1B4DZS4 312 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 LSM1O15116 133 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 AP1G1O43747 822 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 DCTN3O75935 186 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 RECQL4O94761 1208 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 ADH1BP00325 375 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 APOC2P02655 101 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 LYNP07948 512 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 CCDC130P13994 396 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 DARSP14868 501 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 SSTR1P30872 391 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 GRK4P32298 578 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 STX2P32856 288 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 PTPN7P35236 360 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 ETFBP38117 255 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 SNX16P57768 344 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 SLC6A3Q01959 620 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 SLC34A1Q06495 639 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 DPYSL3Q14195 570 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 HIF1AQ16665 826 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 LRIT3Q3SXY7 679 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 FBXO47Q5MNV8 452 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 FNBP1LQ5T0N5 605 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 ZNF618Q5T7W0 954 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 ANKRD22Q5VYY1 191 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 TRNP1Q6NT89 227 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 BORAQ6PGQ7 559 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 VSTM1Q6UX27 236 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 TTC30AQ86WT1 665 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 RELL1Q8IUW5 271 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 PPIL6Q8IXY8 311 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 TTC39CQ8N584 583 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 CCDC33Q8N5R6 958 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 GPR152Q8TDT2 470 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 CLEC4CQ8WTT0 213 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 FAM172AQ8WUF8 416 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 CPT1BQ92523 772 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 TTC25Q96NG3 672 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 PCDH9Q9HC56 1237 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 SCUBE2Q9NQ36 999 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 NMRK1Q9NWW6 199 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 PLK2Q9NYY3 685 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 EFR3BQ9Y2G0 817 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 STK38LQ9Y2H1 464 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 EVPLQ92817 2033 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 REV3LO60673 3130 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 C17orf102A2RUQ5 167 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 E9PBE3 544 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 TK2O00142 265 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 APOL1O14791 398 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 ALOX15BO15296 676 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 KCNN4O15554 427 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 KLF4O43474 513 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 MGEA5O60502 916 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 CD4P01730 458 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 VARSP26640 1264 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 ARL4CP56559 192 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 ROR1Q01973 937 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 MPP2Q14168 576 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 SPCS2Q15005 226 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 SNX17Q15036 470 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 STILQ15468 1287 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 ZBTB6Q15916 424 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 CCDC6Q16204 474 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 CNGA3Q16281 694 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 BBS9Q3SYG4 887 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 BOLA3Q53S33 107 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 SNX30Q5VWJ9 437 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 TMEM53Q6P2H8 277 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 Q6ZNX1 250 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 SPATA24Q86W54 205 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 PDIK1LQ8N165 341 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 BBS5Q8N3I7 341 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 FAM13CQ8NE31 585 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 APPL2Q8NEU8 664 aa6.32□□□□□ -1.4
IKZF3-210ENST00000377958 FNDC8Q8TC99 324 aa6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms