RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM132BQ14DG7 1078 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ANKRD1Q15327 319 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ALG11Q2TAA5 492 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 KLHL17Q6TDP4 642 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 DPP10Q8N608 796 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 FAM71DQ8N9W8 422 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 DENND6BQ8NEG7 585 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 GAB3Q8WWW8 586 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 GTF3C6Q969F1 213 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 PGAM5Q96HS1 289 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SPXQ9BT56 116 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 TEX13BQ9BXU2 312 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 KATNBL1Q9H079 304 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 TNMDQ9H2S6 317 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 KCNF1Q9H3M0 494 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CD93Q9NPY3 652 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SUN2Q9UH99 717 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CEP83Q9Y592 693 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CHD9Q3L8U1 2897 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 KIF16BQ96L93 1317 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 TEX22C9J3V5 150 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 FCHO1O14526 889 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CXCL11O14625 94 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 STX16O14662 325 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CETN3O15182 167 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 PAGE4O60829 102 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 PNPP00491 289 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SBK3P0C264 359 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CCNA1P78396 465 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 KRT17Q04695 432 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 MGAT5Q09328 741 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 KLHL30Q0D2K2 578 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM200BQ69YZ2 307 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SEPT14Q6ZU15 432 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC186Q7Z3E2 898 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 FAM83AQ86UY5 434 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SVOPQ8N4V2 548 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 NAT16Q8N8M0 369 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CFAP57Q96MR6 1250 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 NEK1Q96PY6 1258 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ACPTQ9BZG2 426 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 KCTD5Q9NXV2 234 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 MKL2Q9ULH7 1088 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM5Q9Y2B1 443 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 NINLQ9Y2I6 1382 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 A0A0U1RQK1 487 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF320A2RRD8 509 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 KLK10O43240 276 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 GSTM1P09488 218 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 DRD2P14416 443 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 IL4RP24394 825 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 RANBP1P43487 201 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SLC11A2P49281 568 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 TIRAPP58753 221 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 KRT76Q01546 638 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 UBXN1Q04323 297 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ZBTB17Q13105 803 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SLC13A2Q13183 592 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 DUSP8Q13202 625 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SLC12A1Q13621 1099 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CSRP2Q16527 193 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SLC39A12Q504Y0 691 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 COLEC12Q5KU26 742 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 C12orf60Q5U649 245 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 RRAGBQ5VZM2 374 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 JADE1Q6IE81 842 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SLFN12LQ6IEE8 588 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 RNF44Q7L0R7 432 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 GATAD2AQ86YP4 633 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 NUP93Q8N1F7 819 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 KIF1BPQ96EK5 621 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ADI1Q9BV57 179 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF350Q9GZX5 532 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 RNF208Q9H0X6 261 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 C1orf21Q9H246 121 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 TM9SF3Q9HD45 589 aa2.63□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms