RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 SAC3D1A6NKF1 404 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 SEPT4O43236 478 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 TNFSF14O43557 240 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 TSPAN3O60637 253 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 USP12O75317 370 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 MT-CO3P00414 261 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 CYP4B1P13584 511 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 PKMP14618 531 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 MATN1P21941 496 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 TGM1P22735 817 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 DUSP1P28562 367 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 PBX3P40426 434 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 PAFAH1B1P43034 410 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 MTNR1AP48039 350 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 EIF5P55010 431 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 MZT2BQ6NZ67 158 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 ANKRD16Q6P6B7 361 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 RANBP10Q6VN20 620 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRIM72Q6ZMU5 477 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 MOB3CQ70IA8 216 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC29A4Q7RTT9 530 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 PXKQ7Z7A4 578 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 CPLX4Q7Z7G2 160 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 Q8N1X5 172 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 RFWD2Q8NHY2 731 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 KAT2AQ92830 837 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 RITA1Q96K30 269 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 C7orf26Q96N11 449 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 TM2D2Q9BX73 214 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 EPHX3Q9H6B9 360 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 SYNPO2LQ9H987 977 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 Q9N2J8 555 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 RXFP3Q9NSD7 469 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 TBC1D22BQ9NU19 505 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMLHEQ9NVH6 421 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM248Q9NWD8 314 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 ALKBH4Q9NXW9 302 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 SEMA5BQ9P283 1151 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 CD207Q9UJ71 328 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 SARDHQ9UL12 918 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 MKLN1Q9UL63 735 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 A0A087X0M5 115 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 A0A1B0GX30 115 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 PI4KAP2A4QPH2 592 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 MATN3O15232 486 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 CEP104O60308 925 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 PTP4A3O75365 173 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 TACC1O75410 805 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 CBX6O95503 412 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 PEX11BO96011 259 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 UBL4AP11441 157 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 HOXD12P35452 270 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 ACTN2P35609 894 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 HADHAP40939 763 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 SOX2P48431 317 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 MCM2P49736 904 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 DRG2P55039 364 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 UFM1P61960 85 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 EFNB1P98172 346 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 MTA1Q13330 715 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 MED22Q15528 200 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 BAK1Q16611 211 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 MEA1Q16626 185 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 TBC1D25Q3MII6 688 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPATS1Q496A3 300 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF766Q5HY98 468 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARHGEF25Q86VW2 580 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 CHSY1Q86X52 802 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARMC8Q8IUR7 673 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 TSPYL6Q8N831 410 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 SCAIQ8N9R8 606 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 USP38Q8NB14 1042 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 SETD9Q8NE22 299 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms