RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365039.1

RNU6-590P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 590, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-590P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-590P-201ENST00000365039 NUS1Q96E22 293 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 TEX13BQ9BXU2 312 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 PARLQ9H300 379 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 BRD9Q9H8M2 597 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 PDFQ9HBH1 243 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 USP29Q9HBJ7 922 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 ZNF304Q9HCX3 659 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 ABCF3Q9NUQ8 709 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 ZNF446Q9NWS9 450 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 COL6A6A6NMZ7 2263 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 BAHCC1Q9P281 2608 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 A0A0U1RQJ8 604 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 C1orf226A1L170 272 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 DPPA5A6NC42 116 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 FOXO6A8MYZ6 492 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 SMIM1B2RUZ4 78 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 PSMD9O00233 223 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 ZEB2O60315 1214 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 PAX1P15863 534 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 JAK3P52333 1124 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 MYO1EQ12965 1108 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 ZNF460Q14592 562 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 RAB39AQ14964 217 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 TERF2Q15554 542 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 NFE2L2Q16236 605 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 UGT8Q16880 541 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 FRMD7Q6ZUT3 714 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 KDELC2Q7Z4H8 507 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 SATL1Q86VE3 508 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 UEVLDQ8IX04 471 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 MIGA1Q8NAN2 632 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 ATP11CQ8NB49 1132 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 KDM1BQ8NB78 822 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 TTC14Q96N46 770 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 SENP7Q9BQF6 1050 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 ZNF670Q9BS34 389 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 TTLL2Q9BWV7 592 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 ZNF180Q9UJW8 692 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 PLAAQ9Y263 795 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 VSIG4Q9Y279 399 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 RAI2Q9Y5P3 530 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 NEBP20929 6669 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 M0R3H8 397 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 KCNN4O15554 427 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 STRNO43815 780 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 KDM4BO94953 1096 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 FAM153BP0C7A2 387 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 ERVK-10P10266 1014 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 HGFP14210 728 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 NAGAP17050 411 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 TYMPP19971 482 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 PTGDSP41222 190 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 WDR5P61964 334 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 MS4A2Q01362 244 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 FUT7Q11130 342 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 LONRF3Q496Y0 759 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 ENTPD8Q5MY95 495 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 LIPMQ5VYY2 423 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 ZNF280BQ86YH2 543 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 RHPN2Q8IUC4 686 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 RHOT1Q8IXI2 618 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 ZBED8Q8IZ13 594 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 POM121L12Q8N7R1 296 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 OR1N1Q8NGS0 311 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 RFWD2Q8NHY2 731 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 RASL10AQ92737 203 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 KAT2BQ92831 832 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 ZNF799Q96GE5 643 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 BCANQ96GW7 911 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 CLMNQ96JQ2 1002 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 ADI1Q9BV57 179 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 TANGO6Q9C0B7 1094 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 FZD8Q9H461 694 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 LRFN1Q9P244 771 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 IL36RNQ9UBH0 155 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 DISP3Q9P2K9 1392 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 ZNF587BE7ETH6 402 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 KCNQ2O43526 872 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 MARCH6O60337 910 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 IGKV1-17P01599 117 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 GP9P14770 177 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 BCL3P20749 454 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 GALNSP34059 522 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 MTHFRP42898 656 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-590P-201ENST00000365039 FMO5P49326 533 aa-0.89□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms