RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348333.7

TNFRSF25-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF25, Length 1,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM129BQ96TA1 746 aa23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 SIK3Q9Y2K2 1263 aa23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 CNTN5O94779 1100 aa23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 CHRNB2P17787 502 aa23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 CXCR3P49682 368 aa23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 METAP1P53582 386 aa23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 JAM2P57087 298 aa23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZBTB16Q05516 673 aa23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 ARID5BQ14865 1188 aa23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 CST6Q15828 149 aa23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 RAB6CQ53S08 254 aa23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 ARTNQ5T4W7 220 aa23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 STK40Q8N2I9 435 aa23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 KDM1BQ8NB78 822 aa23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 NT5C3BQ969T7 300 aa23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 BIRC7Q96CA5 298 aa23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 BTBD1Q9H0C5 482 aa23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 TKTL2Q9H0I9 626 aa23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 RAB6CQ9H0N0 254 aa23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 WASF3Q9UPY6 502 aa23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 FRYQ5TBA9 3013 aa23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 EPG5Q9HCE0 2579 aa23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 A0A1W2PP55 124 aa23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 FSBPO95073 299 aa23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 PSMD8P48556 350 aa23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 PLK1P53350 603 aa23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 COPB1P53618 953 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 SNX16P57768 344 aa23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 SHC2P98077 582 aa23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 ALFQ53S48 1182 aa23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF683Q8IZ20 524 aa23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 ORAI3Q9BRQ5 295 aa23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 HSD3B7Q9H2F3 369 aa23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 FBXL12Q9NXK8 326 aa23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR51B4Q9Y5P0 310 aa23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 A0A1B0GVT2 93 aa23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 LSM8O95777 96 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 IGHV4-34P06331 123 aa23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 FMO1Q01740 532 aa23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 DEUP1Q05D60 604 aa23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 AADATQ8N5Z0 425 aa23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 EMC1Q8N766 993 aa23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 GANCQ8TET4 914 aa23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 FRS2Q8WU20 508 aa23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 CFAP57Q96MR6 1250 aa23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 PCED1AQ9H1Q7 454 aa23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 NEUROG2Q9H2A3 272 aa23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 WDCPQ9H6R7 721 aa23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMEM59LQ9UK28 342 aa23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 STAP1Q9ULZ2 295 aa23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 KNL1Q8NG31 2342 aa23.39■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 CEP295Q9C0D2 2601 aa23.39■■□□□ 1.34
TNFRSF25-201ENST00000348333 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM47DPA6NHR8 397 aa23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 UPK3BL1B0FP48 263 aa23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 UPK3BL2E5RIL1 263 aa23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 PLK4O00444 970 aa23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 SH3BP5O60239 455 aa23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 GJB6O95452 261 aa23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC8A1P32418 973 aa23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 SCNN1AP37088 669 aa23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC12A1Q13621 1099 aa23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 NCAPHQ15003 741 aa23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 SYCP1Q15431 976 aa23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC25A52Q3SY17 297 aa23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 C5orf22Q49AR2 442 aa23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 SASS6Q6UVJ0 657 aa23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 FEM1AQ9BSK4 669 aa23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 SGK2Q9HBY8 427 aa23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 TM9SF3Q9HD45 589 aa23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 AKAP13Q12802 2813 aa23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 SOX5P35711 763 aa23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 GALCP54803 685 aa23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 CDR2Q01850 454 aa23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 MYL5Q02045 173 aa23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 STX1AQ16623 288 aa23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 BRMS1LQ5PSV4 323 aa23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 USP30Q70CQ3 517 aa23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 BNIPLQ7Z465 357 aa23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC30A5Q8TAD4 765 aa23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 PCDHB18PQ96TA0 734 aa23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 PSMB7Q99436 277 aa23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC32A1Q9H598 525 aa23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 EBF2Q9HAK2 575 aa23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms