RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340535.11

MIA3-201, Transcript of MIA SH3 domain ER export factor 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MIA3, Length 2,735 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIA3-201ENST00000340535 CASP3P42574 277 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 GBE1Q04446 702 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 SNX17Q15036 470 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 CDK10Q15131 360 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 LLGL1Q15334 1064 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 CCNJQ5T5M9 372 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 CES4AQ5XG92 561 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 FAM205BPQ63HN1 556 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 IQSEC1Q6DN90 963 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 UNC5AQ6ZN44 842 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 GADL1Q6ZQY3 521 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 SLC22A16Q86VW1 577 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 FAM109AQ8N4B1 249 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 AGBL3Q8NEM8 1001 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 RAB2BQ8WUD1 216 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 PMEPA1Q969W9 287 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 SLC35C1Q96A29 364 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 VPS33AQ96AX1 596 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 VMP1Q96GC9 406 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 AGPAT1Q99943 283 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 RTKNQ9BST9 563 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 TMEM121Q9BTD3 319 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 RAD21L1Q9H4I0 556 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 ZNF408Q9H9D4 720 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 IFT122Q9HBG6 1241 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 C8orf4Q9NR00 106 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 PKD2L1Q9P0L9 805 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 SERPINB13Q9UIV8 391 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 HACL1Q9UJ83 578 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 DOCK2Q92608 1830 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 GAKO14976 1311 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 CLUHO75153 1309 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 OR5K3A6NET4 321 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 SPDYE2BA6NHP3 402 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 LRRIQ4A6NIV6 560 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 ENTPD3O75355 529 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 ZNF254O75437 659 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 NTRK1P04629 796 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 KRT8P05787 483 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 SPDYE6P0CI01 402 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 RPL10P27635 214 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 MORF4L2Q15014 288 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 TMEM119Q4V9L6 283 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 FSCBQ5H9T9 825 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 NHSL2Q5HYW2 709 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 C16orf46Q6P387 395 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 KIAA0408Q6ZU52 694 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 ZNF786Q8N393 782 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 DTX3Q8N9I9 347 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 SNX31Q8N9S9 440 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 OR13F1Q8NGS4 319 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 FIG4Q92562 907 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 SGCDQ92629 289 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 TFAP2CQ92754 450 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 CDKL2Q92772 493 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.314e-6■■□□□ 13.3
MIA3-201ENST00000340535 SLC39A13Q96H72 371 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 SERAC1Q96JX3 654 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 HERPUD2Q9BSE4 406 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 TMEM39BQ9GZU3 492 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 RNF39Q9H2S5 420 aa6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.84□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 A8MX80 341 aa6.84□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 AKAP10O43572 662 aa6.84□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 MAN1A2O60476 641 aa6.84□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 GAS7O60861 476 aa6.84□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 NADKO95544 446 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 CPNE6O95741 557 aa6.84□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 GRIK1P39086 918 aa6.84□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 CBX5P45973 191 aa6.84□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.311e-6■■□□□ 11.9
MIA3-201ENST00000340535 PRKAA2P54646 552 aa6.84□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 RACK1P63244 317 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 IRF5Q13568 498 aa6.84□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 CHI3L2Q15782 390 aa6.84□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 LETM2Q2VYF4 491 aa6.84□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 LDLRAP1Q5SW96 308 aa6.84□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
MIA3-201ENST00000340535 FKBP9P1Q75LS8 142 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms