RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa21.24■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 OR10T2Q8NGX3 314 aa21.24■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF778Q96MU6 729 aa21.24■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM209Q96SK2 561 aa21.24■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa21.24■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 THAP1Q9NVV9 213 aa21.24■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 ARMCX1Q9P291 453 aa21.24■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 TRHDEQ9UKU6 1024 aa21.24■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 M0QZQ0 153 aa21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 USP1O94782 785 aa21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 POMCP01189 267 aa21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 PROCP04070 461 aa21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 SERPINB6P35237 376 aa21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 SMC1BQ8NDV3 1235 aa21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 WWP1Q9H0M0 922 aa21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 RAB27AP51159 221 aa21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 INSCQ1MX18 579 aa21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 GRTP1Q5TC63 336 aa21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 RINLQ6ZS11 566 aa21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 LRRTM3Q86VH5 581 aa21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 VAT1Q99536 393 aa21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 RBBP8Q99708 897 aa21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 DCDC2Q9UHG0 476 aa21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 ADAM28Q9UKQ2 775 aa21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 MYO16Q9Y6X6 1858 aa21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 ITM2AO43736 263 aa21.22■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 ADAMTS4O75173 837 aa21.22■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 B3GAT3O94766 335 aa21.22■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 GMPRP36959 345 aa21.22■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa21.22■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 PPM1JQ5JR12 505 aa21.22■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 ARTNQ5T4W7 220 aa21.22■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa21.22■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 RFWD3Q6PCD5 774 aa21.22■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 TREML1Q86YW5 311 aa21.22■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 TEKT5Q96M29 485 aa21.22■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 BFARQ9NZS9 450 aa21.22■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 MYLKQ15746 1914 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 GSC2O15499 205 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 KITP10721 976 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 LIMK2P53671 638 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 AQP5P55064 265 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 GRIK3Q13003 919 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 CERCAMQ5T4B2 595 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 ATG14Q6ZNE5 492 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 BEND5Q7L4P6 421 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 SH3TC2Q8TF17 1288 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 HASPINQ8TF76 798 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 OSBPL2Q9H1P3 480 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 SNX15Q9NRS6 342 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A0U1RQF3 1178 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC10A3P09131 477 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 GNAZP19086 355 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 THPOP40225 353 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 CCNG1P51959 295 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 PDE1BQ01064 536 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 C4orf50Q6ZRC1 276 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 DCLK2Q8N568 766 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 TTC8Q8TAM2 541 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 NSMCE1Q8WV22 266 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 MFSD3Q96ES6 412 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 MCMBPQ9BTE3 642 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 TAS2R1Q9NYW7 299 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM216Q9P0N5 145 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 FRMPD3Q5JV73 1810 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-202ENST00000335475 IRAK2O43187 625 aa21.2■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 CACNG3O60359 315 aa21.2■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 ITGB1P05556 798 aa21.2■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 KCNA4P22459 653 aa21.2■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 LPIN1Q14693 890 aa21.2■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 RGMBQ6NW40 437 aa21.2■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 CMC1Q7Z7K0 106 aa21.2■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 METTL23Q86XA0 190 aa21.2■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 RSPH1Q8WYR4 309 aa21.2■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 ATP2A3Q93084 1043 aa21.2■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 AGAP2Q99490 1192 aa21.2■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa21.2■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 TXNDC16Q9P2K2 825 aa21.2■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 GABRQQ9UN88 632 aa21.2■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 F7P08709 466 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 TPBGLP0DKB5 382 aa21.2■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 TUSC3Q13454 348 aa21.2■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa21.2■□□□□ 0.98
KCNQ1-202ENST00000335475 CNTD1Q8N815 330 aa21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms