RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 CYP2R1Q6VVX0 501 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF621Q6ZSS3 439 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 DDHD1Q8NEL9 900 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 HDHD2Q9H0R4 259 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 ABCC13Q9NSE7 274 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 MARCH2Q9P0N8 246 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 HS6ST1O60243 411 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 CASP12Q6UXS9 341 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 HEATR4Q86WZ0 1026 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 TBCDQ9BTW9 1192 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 BPIFA1Q9NP55 256 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRM-201ENST00000332175 CTSEP14091 401 aa22.77■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 PTPN4P29074 926 aa22.77■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 UXS1Q8NBZ7 420 aa22.77■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 H3BN98 237 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 NUP107P57740 925 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 CRADDP78560 199 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 NSMCE2Q96MF7 247 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 ARL15Q9NXU5 204 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC167Q9P0B6 97 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 C1DQ13901 141 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 INSCQ1MX18 579 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 FAM45BPQ6NSW5 357 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 ZPBP2Q6X784 338 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 USP45Q70EL2 814 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 LPPQ93052 612 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 REPS1Q96D71 796 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM237Q96Q45 408 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 RIBC2Q9H4K1 309 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 VPS51Q9UID3 782 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 GCNT1Q02742 428 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 DHFR2Q86XF0 187 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 FASP25445 335 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 GPSM1Q86YR5 675 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 SYT12Q8IV01 421 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.238e-8■■■■□ 20.1
PTPRM-201ENST00000332175 BMP10O95393 424 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 CD86P42081 329 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 MARSP56192 900 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 EID3Q8N140 333 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 LZTR1Q8N653 840 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 FAM153BP0C7A2 387 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 FCGR1AP12314 374 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 PTPRAP18433 802 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 FAM153CQ494X1 144 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 DACT2Q5SW24 774 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 RSPH1Q8WYR4 309 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM13O60858 407 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 PGK1P00558 417 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 CAPN1P07384 714 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 C16orf46Q6P387 395 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 HDDC2Q7Z4H3 204 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 FAM126BQ8IXS8 530 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 RNF145Q96MT1 663 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 ARMCX1Q9P291 453 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 HACD1B0YJ81 288 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 RPN2P04844 631 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 CCL23P55773 120 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 ARMCX4Q5H9R4 360 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 WDR59Q6PJI9 974 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 CXorf40AQ8TE69 158 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 RNFT2Q96EX2 444 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 CORO1BQ9BR76 489 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 OPTCQ9UBM4 332 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 PSMB4P28070 264 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 HPCAL1P37235 193 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 COX10Q12887 443 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 DPYSL3Q14195 570 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 DENND1CQ8IV53 801 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 MAP4K3Q8IVH8 894 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 CLYBLQ8N0X4 340 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 C19orf18Q8NEA5 215 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 MARK4Q96L34 752 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 SH3GL2Q99962 352 aa22.75■■□□□ 1.23
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