RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326181.10

TRAF7-201, Transcript of TNF receptor associated factor 7, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAF7, Length 3,700 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7-201ENST00000326181 CLDN5O00501 218 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 SPRP35270 261 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 KDELC2Q7Z4H8 507 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 USP33Q8TEY7 942 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 ZFAND2BQ8WV99 257 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 JADE3Q92613 823 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 OCEL1Q9H607 264 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 TXNRD2Q9NNW7 524 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 RPS12P25398 132 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 RANBP1P43487 201 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 NDUFV1P49821 464 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 RPS6KA3P51812 740 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 CHN2P52757 468 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 GK3PQ14409 553 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 PAOXQ6QHF9 649 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 RCN3Q96D15 328 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 MPP4Q96JB8 637 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 SNX25Q9H3E2 840 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 BFARQ9NZS9 450 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 VANGL2Q9ULK5 521 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 IRF6O14896 467 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 DCUN1D1Q96GG9 259 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 TSNARE1Q96NA8 513 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 SIKE1Q9BRV8 207 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 GRIP2Q9C0E4 1043 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 NMRAL1Q9HBL8 299 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 CHRAC1Q9NRG0 131 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 CSADQ9Y600 493 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 C2P06681 752 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 NAGLUP54802 743 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 ART3Q13508 389 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 EPAS1Q99814 870 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 CENPFP49454 3210 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 TSPAN1O60635 241 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 ALDH1A2O94788 518 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 PIK3R1P27986 724 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 SERPINB8P50452 374 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 THOP1P52888 689 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 BST2Q10589 180 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 TTLL4Q14679 1199 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 TLR1Q15399 786 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 URGCPQ8TCY9 931 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 NAT14Q8WUY8 206 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 AFG1LQ8WV93 481 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 OMDQ99983 421 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 TLK1Q9UKI8 766 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 RLFQ13129 1914 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 TRIM13O60858 407 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 PIGNO95427 931 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 NELFEP18615 380 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 ZNF460Q14592 562 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 PGM2L1Q6PCE3 622 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 MOB2Q70IA6 237 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 CPNE1Q99829 537 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 ADA2Q9NZK5 511 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 KPNA7A9QM74 516 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 SOCS7O14512 581 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 ZNF195O14628 629 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 LGALS2P05162 132 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 C6orf52Q5T4I8 152 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 STEAP4Q687X5 459 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 IL31Q6EBC2 164 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 CATSPER4Q7RTX7 472 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 PQLC1Q8N2U9 271 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 APBA2Q99767 749 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 MED10Q9BTT4 135 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 VPS33BQ9H267 617 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 FAM96AQ9H5X1 160 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 MCM3APO60318 1980 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 PSME4Q14997 1843 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 BAG6P46379 1132 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 CDK18Q07002 472 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 MPP3Q13368 585 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 PDK1Q15118 436 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 CYTH1Q15438 398 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TRAF7-201ENST00000326181 GRTP1Q5TC63 336 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms