RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 ASIC3Q9UHC3 531 aa18.53■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa18.53■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 CPQQ9Y646 472 aa18.53■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 SMAPO00193 183 aa18.52■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 KRT14P02533 472 aa18.52■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 ITIH2P19823 946 aa18.52■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 CHKAP35790 457 aa18.52■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 MAPKAPK2P49137 400 aa18.52■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 NDST2P52849 883 aa18.52■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 CYP4F8P98187 520 aa18.52■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 SLC5A9Q2M3M2 681 aa18.52■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 CEP128Q6ZU80 1094 aa18.52■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 HTR3DQ70Z44 454 aa18.52■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 DENND1CQ8IV53 801 aa18.52■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 UBALD2Q8IYN6 164 aa18.52■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 CMTM8Q8IZV2 173 aa18.52■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 SHKBP1Q8TBC3 707 aa18.52■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 OLFM3Q96PB7 478 aa18.52■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP18.52■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 MAGEB5Q9BZ81 275 aa18.52■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 TMEM248Q9NWD8 314 aa18.52■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 VANGL2Q9ULK5 521 aa18.52■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 WEE1P30291 646 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 NTHL1P78549 312 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 GBE1Q04446 702 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 RAP1GAP2Q684P5 730 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 FBXL22Q6P050 247 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 NPNTQ6UXI9 565 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 FBXL6Q8N531 539 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 RTP4Q96DX8 246 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 TCEAL4Q96EI5 215 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 SNF8Q96H20 258 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 TMEM121Q9BTD3 319 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 KIF9Q9HAQ2 790 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 WHRNQ9P202 907 aa18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 E2F8A0AVK6 867 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 MFSD11O43934 449 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 CLDN11O75508 207 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 TCF3P15923 654 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 ADCY8P40145 1251 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 CDH4P55283 916 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 GALNT2Q10471 571 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 P3H1Q32P28 736 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 CHST9Q7L1S5 443 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF683Q8IZ20 524 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 CCNYQ8ND76 341 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 HDAC11Q96DB2 347 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 CYP2S1Q96SQ9 504 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 PNKPQ96T60 521 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 VAT1Q99536 393 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 SLC46A2Q9BY10 475 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 GKN1Q9NS71 199 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 ETNK2Q9NVF9 386 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 SMPD4Q9NXE4 827 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 PAK5Q9P286 719 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 SNX10Q9Y5X0 201 aa18.5■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 ARHGAP42A6NI28 874 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 KCNN4O15554 427 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 IFNB1P01574 187 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 IRF1P10914 325 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 ETFBP38117 255 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 VSNL1P62760 191 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 TEAD2Q15562 447 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 PARP15Q460N3 678 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 EMBQ6PCB8 327 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 LGI2Q8N0V4 545 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 CPXM2Q8N436 756 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 HTR3CQ8WXA8 447 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 IFT81Q8WYA0 676 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 ANKRD7Q92527 254 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 TSGA13Q96PP4 275 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 SLC22A12Q96S37 553 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 MYADMQ96S97 322 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 FAM118BQ9BPY3 351 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 TRIM51Q9BSJ1 452 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 FOXP3Q9BZS1 431 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 ARFGAP3Q9NP61 516 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-201ENST00000324444 TDP1Q9NUW8 608 aa18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms