RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320225.9

RNPS1-202, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RNPS1, Length 2,241 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-202ENST00000320225 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 NAB1Q13506 487 aa18.09■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 C16orf72Q14CZ0 275 aa18.09■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 TMEM198Q66K66 360 aa18.09■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa18.09■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 CLEC14AQ86T13 490 aa18.09■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 FIBCD1Q8N539 461 aa18.09■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 SLCO4A1Q96BD0 722 aa18.09■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 PPP1R36Q96LQ0 422 aa18.09■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 OSBPL11Q9BXB4 747 aa18.09■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 MAGEB5Q9BZ81 275 aa18.09■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa18.09■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 CAAP1Q9H8G2 361 aa18.09■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 ACSS2Q9NR19 701 aa18.09■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 MYRFQ9Y2G1 1151 aa18.09■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 WDR37Q9Y2I8 494 aa18.09■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 TCAF2A6NFQ2 919 aa18.08■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 F5H423 210 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa18.08■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 MAFGO15525 162 aa18.08■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 MSCO60682 206 aa18.08■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 TFPTP0C1Z6 253 aa18.08■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa18.08■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 ERVK-10P10266 1014 aa18.08■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 MLNP12872 115 aa18.08■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 NAA20P61599 178 aa18.08■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP18.08■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa18.08■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 BOLA3Q53S33 107 aa18.08■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa18.08■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 XRRA1Q6P2D8 792 aa18.08■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 ZPBP2Q6X784 338 aa18.08■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 CPNE9Q8IYJ1 553 aa18.08■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 DCLK2Q8N568 766 aa18.08■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 UBA3Q8TBC4 463 aa18.08■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 TRPC4APQ8TEL6 797 aa18.08■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 GIPC3Q8TF64 312 aa18.08■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 LRTOMTQ8WZ04 291 aa18.08■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 CDKL2Q92772 493 aa18.08■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 EME1Q96AY2 570 aa18.08■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 RIPK3Q9Y572 518 aa18.08■□□□□ 0.49
RNPS1-202ENST00000320225 CROCCQ5TZA2 2017 aa18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 C9IYK1 514 aa18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 M0QYV0 167 aa18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 SLC22A2O15244 555 aa18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 SERPINB7O75635 380 aa18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 ALDH2P05091 517 aa18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 C8BP07358 591 aa18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 F7P08709 466 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 COL6A2P12110 1019 aa18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 IDO1P14902 403 aa18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 RPL10P27635 214 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 NUP107P57740 925 aa18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 IRF9Q00978 393 aa18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 GSTM4Q03013 218 aa18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 ITGA7Q13683 1181 aa18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 HERC3Q15034 1050 aa18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 TGFBIQ15582 683 aa18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 SMYD5Q6GMV2 418 aa18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 CASC4Q6P4E1 433 aa18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 KRT27Q7Z3Y8 459 aa18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 GPR180Q86V85 440 aa18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 ISOC1Q96CN7 298 aa18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 PGLYRP2Q96PD5 576 aa18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 GMLQ99445 158 aa18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 SLC38A7Q9NVC3 462 aa18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 PGAP2Q9UHJ9 254 aa18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 SIX4Q9UIU6 781 aa18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 CDH7Q9ULB5 785 aa18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 HES2Q9Y543 173 aa18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 PSME4Q14997 1843 aa18.08■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 RAD17O75943 681 aa18.07■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 JUNP05412 331 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 CYP2F1P24903 491 aa18.07■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 SCYL2Q6P3W7 929 aa18.07■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 KCNT2Q6UVM3 1135 aa18.07■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 MYO1HQ8N1T3 1032 aa18.07■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 ZNF670Q9BS34 389 aa18.07■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 TMEM79Q9BSE2 394 aa18.07■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 ZBTB26Q9HCK0 441 aa18.07■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 PNPLA3Q9NST1 481 aa18.07■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 MORF4L1Q9UBU8 362 aa18.07■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 WDR46O15213 610 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 OGTO15294 1046 aa18.07■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 HDAC3O15379 428 aa18.07■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 TRIM13O60858 407 aa18.07■□□□□ 0.48
RNPS1-202ENST00000320225 TADA2AO75478 443 aa18.07■□□□□ 0.48
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