RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320122.10

LMO3-202, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,759 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-202ENST00000320122 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 AKT1S1Q96B36 256 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 HPDLQ96IR7 371 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 SLC25A23Q9BV35 468 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 IL22Q9GZX6 179 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 PKD2L2Q9NZM6 624 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 IGSF9Q9P2J2 1179 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 WDR37Q9Y2I8 494 aa6.6□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 A0A096LPK6 155 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 WDR27A2RRH5 827 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 E9PBE3 544 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 CYB561D2O14569 222 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 KLHL41O60662 606 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 IDO1P14902 403 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 GAD2Q05329 585 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 NIPAL4Q0D2K0 466 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 MPP3Q13368 585 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 SQLEQ14534 574 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 TBC1D25Q3MII6 688 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 RALGPS1Q5JS13 557 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 C16orf87Q6PH81 154 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 NPNTQ6UXI9 565 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 CAMK1DQ8IU85 385 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 ADGRF2Q8IZF7 708 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 LEMD2Q8NC56 503 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 C17orf50Q8WW18 174 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 ISL2Q96A47 359 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 ITPKCQ96DU7 683 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 MAGED4Q96JG8 741 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 RBBP8Q99708 897 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 C9orf16Q9BUW7 83 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 OSBPL6Q9BZF3 934 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 RRAGCQ9HB90 399 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 PREBQ9HCU5 417 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 SNX15Q9NRS6 342 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 PNPOQ9NVS9 261 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 RRN3Q9NYV6 651 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 TMEM9Q9P0T7 183 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 LTBP1Q14766 1721 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 BBIP1A8MTZ0 92 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 GPR25O00155 361 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 NPHS1O60500 1241 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 BMP10O95393 424 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 CST3P01034 146 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 C8BP07358 591 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 CD48P09326 243 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 ETS2P15036 469 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 GPD2P43304 727 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 SOX10P56693 466 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 NAA20P61599 178 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 SLC12A1Q13621 1099 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 ARL13BQ3SXY8 428 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 IYDQ6PHW0 289 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 ZYG11AQ6WRX3 759 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 FRA10AC1Q70Z53 315 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 CXorf38Q8TB03 319 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 ASB9Q96DX5 294 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 ASB2Q96Q27 587 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 TSPAN18Q96SJ8 248 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 TRPC7Q9HCX4 862 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 CD320Q9NPF0 282 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 ZNF711Q9Y462 761 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 SCN4AP35499 1836 aa6.59□□□□□ -1.35
LMO3-202ENST00000320122 MATN2O00339 956 aa6.59□□□□□ -1.36
LMO3-202ENST00000320122 GIPC1O14908 333 aa6.59□□□□□ -1.36
LMO3-202ENST00000320122 HBP1O60381 514 aa6.59□□□□□ -1.36
LMO3-202ENST00000320122 AVILO75366 819 aa6.59□□□□□ -1.36
LMO3-202ENST00000320122 GLUD2P49448 558 aa6.59□□□□□ -1.36
LMO3-202ENST00000320122 BCAT1P54687 386 aa6.59□□□□□ -1.36
LMO3-202ENST00000320122 JAG1P78504 1218 aa6.59□□□□□ -1.36
LMO3-202ENST00000320122 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
LMO3-202ENST00000320122 BNIP2Q12982 314 aa6.59□□□□□ -1.36
LMO3-202ENST00000320122 CYTH1Q15438 398 aa6.59□□□□□ -1.36
LMO3-202ENST00000320122 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa6.59□□□□□ -1.36
LMO3-202ENST00000320122 BSPRYQ5W0U4 402 aa6.59□□□□□ -1.36
LMO3-202ENST00000320122 OLFML1Q6UWY5 402 aa6.59□□□□□ -1.36
LMO3-202ENST00000320122 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.59□□□□□ -1.36
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