RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 GRID2IPA4D2P6 1211 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 H3BRJ5 948 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 RPS9P46781 194 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 PITRM1Q5JRX3 1037 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 MBLAC2Q68D91 279 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 RFX8Q6ZV50 586 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 ADIPOR2Q86V24 386 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 APCDD1Q8J025 514 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 UCMAQ8WVF2 138 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 NDFIP2Q9NV92 336 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 ELOVL2Q9NXB9 296 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF212Q9UDV6 495 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 CD48P09326 243 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 MAPKAPK2P49137 400 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 SLC12A1Q13621 1099 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 PLEKHG6Q3KR16 790 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 ODF2Q5BJF6 829 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC38Q5VT99 294 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 SORCS1Q8WY21 1168 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 CALN1Q9BXU9 219 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 CHRDQ9H2X0 955 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 RETREG1Q9H6L5 497 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 VPS28Q9UK41 221 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 STARD13Q9Y3M8 1113 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 PALMO75781 387 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 MAGEA9P43362 315 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 DMC1Q14565 340 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 MAP7D3Q8IWC1 876 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC57Q8N9N7 239 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 USP33Q8TEY7 942 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 FEM1AQ9BSK4 669 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 A0A0D9SEW6 157 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 LRRD1A4D1F6 860 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 PSTPIP1O43586 416 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 TIMM44O43615 452 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 KRT1P04264 644 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 ERCC2P18074 760 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 AVPR2P30518 371 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 HCAR3P49019 387 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 ARSEP51690 589 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 MMRN1Q13201 1228 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 DPYSL3Q14195 570 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 GAS6Q14393 721 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 PDK2Q15119 407 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 PKN3Q6P5Z2 889 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF662Q6ZS27 426 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 SYCE1Q8N0S2 351 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC33Q8N5R6 958 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 ALLCQ8N6M5 410 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 RAPGEF5Q92565 580 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 CSPG4P5Q96PW8 444 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 HCN2Q9UL51 889 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 ILVBLA1L0T0 632 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 WASH4PA8MWX3 477 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 AMPD1P23109 780 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 PLK1P53350 603 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 GNA12Q03113 381 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 MTAPQ13126 283 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 DPYSQ14117 519 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 CHPFQ8IZ52 775 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 OR7D4Q8NG98 312 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 FAM71BQ8TC56 605 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 TSC1Q92574 1164 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 LRFN3Q9BTN0 628 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 SPON2Q9BUD6 331 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 DONSONQ9NYP3 566 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 PLA2G4CQ9UP65 541 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF318Q5VUA4 2279 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 SHROOM3Q8TF72 1996 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 RAMP2O60895 175 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 KDELR1P24390 212 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF783Q6ZMS7 281 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 PEX26Q7Z412 305 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 IL17RCQ8NAC3 791 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 KCNV2Q8TDN2 545 aa22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms