RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297661.8

UBAP1-201, Transcript of ubiquitin associated protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBAP1, Length 2,735 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP1-201ENST00000297661 LCP1P13796 627 aa15.96■□□□□ 0.15
UBAP1-201ENST00000297661 ADORA2AP29274 412 aa15.96■□□□□ 0.15
UBAP1-201ENST00000297661 ADORA2BP29275 332 aa15.96■□□□□ 0.15
UBAP1-201ENST00000297661 CTGFP29279 349 aa15.96■□□□□ 0.15
UBAP1-201ENST00000297661 PHEXP78562 749 aa15.96■□□□□ 0.15
UBAP1-201ENST00000297661 ACAP1Q15027 740 aa15.96■□□□□ 0.15
UBAP1-201ENST00000297661 CNGA3Q16281 694 aa15.96■□□□□ 0.15
UBAP1-201ENST00000297661 C16orf46Q6P387 395 aa15.96■□□□□ 0.15
UBAP1-201ENST00000297661 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
UBAP1-201ENST00000297661 ZNF410Q86VK4 478 aa15.96■□□□□ 0.15
UBAP1-201ENST00000297661 HPS6Q86YV9 775 aa15.96■□□□□ 0.15
UBAP1-201ENST00000297661 CNBD2Q96M20 576 aa15.96■□□□□ 0.15
UBAP1-201ENST00000297661 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
UBAP1-201ENST00000297661 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa15.96■□□□□ 0.15
UBAP1-201ENST00000297661 Q9H521 79 aa15.96■□□□□ 0.15
UBAP1-201ENST00000297661 CYP3A43Q9HB55 503 aa15.96■□□□□ 0.15
UBAP1-201ENST00000297661 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa15.96■□□□□ 0.15
UBAP1-201ENST00000297661 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa15.96■□□□□ 0.15
UBAP1-201ENST00000297661 FAIMQ9NVQ4 179 aa15.96■□□□□ 0.15
UBAP1-201ENST00000297661 COX16Q9P0S2 106 aa15.96■□□□□ 0.15
UBAP1-201ENST00000297661 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.147e-7■■■■■ 68.5
UBAP1-201ENST00000297661 HMX2A2RU54 273 aa15.96■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 CA12O43570 354 aa15.96■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 TNFAIP8O95379 198 aa15.96■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 COPAP53621 1224 aa15.96■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 RBP5P82980 135 aa15.96■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 MYBPC1Q00872 1141 aa15.96■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 GK3PQ14409 553 aa15.96■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 CASC4Q6P4E1 433 aa15.96■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 ZNF534Q76KX8 674 aa15.96■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 NUDCD3Q8IVD9 361 aa15.96■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 NDUFAF2Q8N183 169 aa15.96■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 SMYD1Q8NB12 490 aa15.96■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 AFG1LQ8WV93 481 aa15.96■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 APOL6Q9BWW8 343 aa15.96■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 PLLPQ9Y342 182 aa15.96■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 KRT37O76014 449 aa15.95■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 CCDC130P13994 396 aa15.95■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 KIZQ2M2Z5 673 aa15.95■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 AHI1Q8N157 1196 aa15.95■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 OR6B3Q8NGW1 331 aa15.95■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 RIN3Q8TB24 985 aa15.95■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa15.95■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 INIPQ9NRY2 104 aa15.95■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 SIRPGQ9P1W8 387 aa15.95■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 TSPAN1O60635 241 aa15.95■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 APOEP02649 317 aa15.95■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 SRGAP2BP0DMP2 458 aa15.95■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 ATICP31939 592 aa15.95■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 SLC6A3Q01959 620 aa15.95■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 CDK18Q07002 472 aa15.95■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 INCA1Q0VD86 236 aa15.95■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 CCDC185Q8N715 623 aa15.95■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 ACTRT2Q8TDY3 377 aa15.95■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 ASB7Q9H672 318 aa15.95■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 ZNF696Q9H7X3 374 aa15.95■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 TBCCD1Q9NVR7 557 aa15.95■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 SNTG2Q9NY99 539 aa15.95■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 SORCS3Q9UPU3 1222 aa15.95■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 AP4B1Q9Y6B7 739 aa15.95■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 AK5Q9Y6K8 562 aa15.95■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 E9PBE3 544 aa15.94■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 CRTAMO95727 393 aa15.94■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 TTLL4Q14679 1199 aa15.94■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 BOLA3Q53S33 107 aa15.94■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 BORAQ6PGQ7 559 aa15.94■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 KCNT2Q6UVM3 1135 aa15.94■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 KBTBD6Q86V97 674 aa15.94■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 EXOC8Q8IYI6 725 aa15.94■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 BBS5Q8N3I7 341 aa15.94■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 LGMNQ99538 433 aa15.94■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 CEPT1Q9Y6K0 416 aa15.94■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 TNFAIP2Q03169 654 aa15.94■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 ARHGAP1Q07960 439 aa15.94■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 WASHC5Q12768 1159 aa15.94■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 APOFQ13790 326 aa15.94■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 SOWAHAQ2M3V2 549 aa15.94■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 ZNF618Q5T7W0 954 aa15.94■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 SLC9A4Q6AI14 798 aa15.94■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 ARMCX2Q7L311 632 aa15.94■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 DEFB107AQ8IZN7 70 aa15.94■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 RMI1Q9H9A7 625 aa15.94■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 THEGQ9P2T0 379 aa15.94■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 GJD2Q9UKL4 321 aa15.94■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 WDR27A2RRH5 827 aa15.93■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 OLIG2Q13516 323 aa15.93■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 PDK2Q15119 407 aa15.93■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 CES3Q6UWW8 571 aa15.93■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 PQLC1Q8N2U9 271 aa15.93■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 DDI1Q8WTU0 396 aa15.93■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa15.93■□□□□ 0.14
UBAP1-201ENST00000297661 SIGLEC10Q96LC7 697 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms