RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 WDR47O94967 919 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 CYP1A2P05177 515 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 THOP1P52888 689 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 METTL6Q8TCB7 284 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 TCP10LQ8TDR4 215 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 OSCP1Q8WVF1 389 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 ZYG11BQ9C0D3 744 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 MID1IP1Q9NPA3 183 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 MPP6Q9NZW5 540 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 BTBD19C9JJ37 291 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 TYMPP19971 482 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 KRT20P35900 424 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 SLC1A6P48664 564 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 IL17AQ16552 155 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 NEPROQ6NW34 567 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 NLNQ9BYT8 704 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 IL22Q9GZX6 179 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 COL1A2P08123 1366 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 ZW10O43264 779 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 ZNF682O95780 498 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 TNNI3P19429 210 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 SCUBE1Q8IWY4 988 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 CCT7Q99832 543 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 SNTNA6NMZ2 147 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 PPP2R1BP30154 601 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 CDK16Q00536 496 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 XRCC4Q13426 336 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 ITGA7Q13683 1181 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 LBX2Q6XYB7 198 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 MILR1Q7Z6M3 343 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 DENND1CQ8IV53 801 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 ZNF862O60290 1169 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 HSDL1Q3SXM5 330 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 MICU2Q8IYU8 434 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 OMDQ99983 421 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 CATSPERZQ9NTU4 200 aa20.61■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 VHLP40337 213 aa20.6■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 ABHD15Q6UXT9 468 aa20.6■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 GPR20Q99678 358 aa20.6■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 MFSD1Q9H3U5 465 aa20.6■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 C10orf88Q9H8K7 445 aa20.6■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 VTI1BQ9UEU0 232 aa20.6■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 H3BMM5 538 aa20.6■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 KRT8P05787 483 aa20.6■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 PCID2Q5JVF3 399 aa20.6■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 REPS1Q96D71 796 aa20.6■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 CAAP1Q9H8G2 361 aa20.6■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 SLC40A1Q9NP59 571 aa20.6■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 CRYL1Q9Y2S2 319 aa20.6■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 BMP10O95393 424 aa20.6■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 PSMB4P28070 264 aa20.6■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa20.6■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 TOP6BLQ8N6T0 577 aa20.6■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 SNX13Q9Y5W8 968 aa20.6■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 ZNF839A8K0R7 811 aa20.6■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 PIK3CGP48736 1102 aa20.6■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 MIIPQ5JXC2 388 aa20.6■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 M0R3G1 203 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 FNDC5Q8NAU1 212 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 SYT17Q9BSW7 474 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 KLHL28Q9NXS3 571 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 OR6C75A6NL08 312 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 MMP3P08254 477 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 ELNP15502 786 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 CD86P42081 329 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 LRRC49Q8IUZ0 686 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 THAP1Q9NVV9 213 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 FAAP100Q0VG06 881 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 TUSC3Q13454 348 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 CRY1Q16526 586 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 IYDQ6PHW0 289 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 HIPK3Q9H422 1215 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 KRT84Q9NSB2 600 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 ZNF229Q9UJW7 825 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 ATRNO75882 1429 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 ZNF541Q9H0D2 1346 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 CDK7P50613 346 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 CXorf40AQ8TE69 158 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 SNX8Q9Y5X2 465 aa20.59■□□□□ 0.89
USP25-202ENST00000285681 CHADO15335 359 aa20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms