RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258499.7

USP44-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 44, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP44, Length 4,022 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44-201ENST00000258499 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 F8W8V4 182 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 TIMM44O43615 452 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 CHRNGP07510 517 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 USP17L7P0C7H9 530 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 IQCF3P0C7M6 154 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 VCLP18206 1134 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 NFKB1P19838 968 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 ALDH1A3P47895 512 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 GRIA4P48058 902 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 NDUFV1P49821 464 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 KLF10Q13118 480 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 CCDC142Q17RM4 750 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 CTC1Q2NKJ3 1217 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 TMEM259Q4ZIN3 620 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 KLC3Q6P597 504 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 FRMD7Q6ZUT3 714 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 MFN1Q8IWA4 741 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 DDIASQ8IXT1 998 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 LRRC43Q8N309 656 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 ATPAF2Q8N5M1 289 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 HASPINQ8TF76 798 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 TMEM174Q8WUU8 243 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 KCTD4Q8WVF5 259 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 APBB2Q92870 758 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 MPP4Q96JB8 637 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 CPNE1Q99829 537 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 CCT7Q99832 543 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 ULBP1Q9BZM6 244 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 C20orf27Q9GZN8 174 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 EFCAB1Q9HAE3 211 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 ARHGEF4Q9NR80 690 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 CACNG4Q9UBN1 327 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 POMPQ9Y244 141 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 ACOT9Q9Y305 439 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 SNX10Q9Y5X0 201 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 NOL3O60936 208 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 ATP6AP2O75787 350 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 SUPT7LO94864 414 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 CD4P01730 458 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 SETSIPP0DME0 302 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 PRKCHP24723 683 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 L1CAMP32004 1257 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 CCR10P46092 362 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 ARPP19P56211 112 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 IRF9Q00978 393 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 FOLH1Q04609 750 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 ZNF460Q14592 562 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 CCDC153Q494R4 210 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 AGKQ53H12 422 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 PPM1LQ5SGD2 360 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 GRTP1Q5TC63 336 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 WSCD1Q658N2 575 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 FSTL4Q6MZW2 842 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 TRNP1Q6NT89 227 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 OLFML1Q6UWY5 402 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 LCA5Q86VQ0 697 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 KBTBD2Q8IY47 623 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 ZNF567Q8N184 647 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 ANKRD52Q8NB46 1076 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 DNAJB3Q8WWF6 145 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 BCO2Q9BYV7 579 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 RHBDL2Q9NX52 303 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 SIRPGQ9P1W8 387 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 LAMB2P55268 1798 aa4.84□□□□□ -1.63
USP44-201ENST00000258499 FAM159BA6NKW6 160 aa4.84□□□□□ -1.64
USP44-201ENST00000258499 MDM4O15151 490 aa4.84□□□□□ -1.64
USP44-201ENST00000258499 GCATO75600 419 aa4.84□□□□□ -1.64
USP44-201ENST00000258499 ATG7O95352 703 aa4.84□□□□□ -1.64
USP44-201ENST00000258499 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.64
USP44-201ENST00000258499 STMN1P16949 149 aa4.84□□□□□ -1.64
USP44-201ENST00000258499 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.64
USP44-201ENST00000258499 PAMP19021 973 aa4.84□□□□□ -1.64
USP44-201ENST00000258499 TPSB2P20231 275 aa4.84□□□□□ -1.64
USP44-201ENST00000258499 PIK3R1P27986 724 aa4.84□□□□□ -1.64
USP44-201ENST00000258499 PSEN1P49768 467 aa4.84□□□□□ -1.64
USP44-201ENST00000258499 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.64
USP44-201ENST00000258499 ESRRGP62508 458 aa4.84□□□□□ -1.64
USP44-201ENST00000258499 DLG1Q12959 904 aa4.84□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms