RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233330.6

RTKN-201, Transcript of rhotekin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RTKN, Length 2,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKN-201ENST00000233330 ERVK-10P10266 1014 aa20.15■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 TMEM135Q86UB9 458 aa20.15■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 COLGALT2Q8IYK4 626 aa20.15■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 DNAAF3Q8N9W5 541 aa20.15■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 TMEM51Q9NW97 253 aa20.15■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 SRRDQ9UH36 339 aa20.15■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 NUMBLQ9Y6R0 609 aa20.15■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 PLXNA3P51805 1871 aa20.15■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 TPP1O14773 563 aa20.15■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 MSI1O43347 362 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 PAGE1O75459 146 aa20.15■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 JCHAINP01591 159 aa20.15■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 KRT16P08779 473 aa20.15■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 DLDP09622 509 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 TARSP26639 723 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 HOXC13P31276 330 aa20.15■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 CCR1P32246 355 aa20.15■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 COG7P83436 770 aa20.15■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 NOMO2Q5JPE7 1267 aa20.15■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 MANEALQ5VSG8 457 aa20.15■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 E2F7Q96AV8 911 aa20.15■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa20.15■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 NMUR1Q9HB89 426 aa20.15■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 ZFP69BQ9UJL9 534 aa20.15■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 VWA8A3KMH1 1905 aa20.15■□□□□ 0.82
RTKN-201ENST00000233330 MOXD2PA6NHM9 499 aa20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 USP1O94782 785 aa20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 OAZ2O95190 189 aa20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 FAM189BP81408 668 aa20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 BST1Q10588 318 aa20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 ARTNQ5T4W7 220 aa20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 ATG16L1Q676U5 607 aa20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 URGCPQ8TCY9 931 aa20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 BIRC5O15392 142 aa20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 AOC2O75106 756 aa20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 ATP6V1G2O95670 118 aa20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 BPGMP07738 259 aa20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 T-ENOLP0DO92 83 aa20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 HTR7P34969 479 aa20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 GP5P40197 560 aa20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 ARFIP2P53365 341 aa20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 TMPRSS15P98073 1019 aa20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 STXBP5Q5T5C0 1151 aa20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 CES4AQ5XG92 561 aa20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 NUDCD3Q8IVD9 361 aa20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 SCN4BQ8IWT1 228 aa20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 CNTD1Q8N815 330 aa20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 C7orf26Q96N11 449 aa20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 TSGA13Q96PP4 275 aa20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 TBC1D13Q9NVG8 400 aa20.14■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa20.13■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 OR1G1P47890 313 aa20.13■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 NOGQ13253 232 aa20.13■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 RIPK1Q13546 671 aa20.13■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 PPP2R5DQ14738 602 aa20.13■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 CHI3L2Q15782 390 aa20.13■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa20.13■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 CLNKQ7Z7G1 428 aa20.13■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa20.13■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 CPNE1Q99829 537 aa20.13■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa20.13■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 LRMDAQ9H2I8 198 aa20.13■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 TXNDC16Q9P2K2 825 aa20.13■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 HAO1Q9UJM8 370 aa20.13■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 A0A1W2PQH9 124 aa20.12■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 DFFAO00273 331 aa20.12■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 CACNG3O60359 315 aa20.12■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 GLRA3O75311 464 aa20.12■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 CCNCP24863 283 aa20.12■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa20.12■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 CERCAMQ5T4B2 595 aa20.12■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 TBC1D31Q96DN5 1066 aa20.12■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 APOL2Q9BQE5 337 aa20.12■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa20.12■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 UBP1Q9NZI7 540 aa20.12■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 HEY2Q9UBP5 337 aa20.12■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 DNAJB4Q9UDY4 337 aa20.12■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 NUDT5Q9UKK9 219 aa20.12■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 EMCNQ9ULC0 261 aa20.12■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa20.12■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa20.12■□□□□ 0.81
RTKN-201ENST00000233330 NPY2RP49146 381 aa20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms