RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000002112.14

Trappc6a-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6a, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Rab23P35288 237 aa18.26■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 IduaP48441 634 aa18.26■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Npy2rP97295 381 aa18.26■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 NfkbidQ2TB02 327 aa18.26■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Hdgfl1Q2VPR5 283 aa18.26■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ndrg1Q62433 394 aa18.26■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Cep70Q6IQY5 616 aa18.26■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 March4Q80TE3 409 aa18.26■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ofcc1Q8BGX4 166 aa18.26■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Daam1Q8BPM0 1077 aa18.26■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Parp9Q8CAS9 866 aa18.26■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Dusp19Q8K4T5 220 aa18.26■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Il36gQ8R460 164 aa18.26■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Mlc1Q8VHK5 382 aa18.26■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Zfp617Q91WM0 559 aa18.26■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Serpina3nQ91WP6 418 aa18.26■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Macrod1Q922B1 323 aa18.26■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Cybrd1Q925G2 290 aa18.26■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Tex46Q9CPU3 165 aa18.26■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Cfap57Q9D180 1249 aa18.26■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 SrpraQ9DBG7 636 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Stk4Q9JI11 487 aa18.26■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Map3k14Q9WUL6 942 aa18.26■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Mtmr7Q9Z2C9 660 aa18.26■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Olfr742A2RTP5 311 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Usp51B1AY15 661 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Gm20671F6TVX7 576 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Gm5689F6Y2A6 97 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 E230025N22RikG5E8S3 482 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 5730507C01RikJ3QPX0 416 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Akap1O08715 857 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ltb4rO88855 351 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Rasgrf1P27671 1262 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Sipa1P46062 1037 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Mapkapk2P49138 386 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Pebp1P70296 187 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Prickle1Q3U5C7 832 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Plcl1Q3USB7 1096 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Zbtb17Q60821 794 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 GkQ64516 559 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Znf280cQ6P3Y5 742 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ints6Q6PCM2 883 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Llgl1Q80Y17 1036 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ttc16Q8C1F5 767 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Fam149aQ8CFV2 787 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Pdlim2Q8R1G6 349 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ctage5Q8R311 779 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Aco2Q99KI0 780 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Anks3Q9CZK6 655 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Efhc2Q9D485 750 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Rmi1Q9D4G9 616 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Slco6d1Q9D5W6 683 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 FastkQ9JIX9 511 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Thap11Q9JJD0 305 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ppm1dQ9QZ67 598 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Chrna6Q9R0W9 494 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Tubd1Q9R1K7 455 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ralgapa1Q6GYP7 2035 aa18.25■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Gm6685D3YYP3 228 aa18.24■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Gm42957D6RFQ2 366 aa18.24■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Gm8994E9PV04 411 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Akain1G3UWD5 69 aa18.24■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Sypl1O09117 261 aa18.24■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Cpsf2O35218 782 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 GmnnO88513 206 aa18.24■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 MlxipQ2VPU4 917 aa18.24■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Cog7Q3UM29 770 aa18.24■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 WhrnQ80VW5 918 aa18.24■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Asb14Q8C6Y6 587 aa18.24■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Fbxw7Q8VBV4 629 aa18.24■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Pcdhgb5Q91XX5 926 aa18.24■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Arfgap2Q99K28 520 aa18.24■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Trim12aQ99PQ1 284 aa18.24■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Rrp15Q9CYX7 281 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 ParvbQ9ES46 365 aa18.24■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 PnkpQ9JLV6 522 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Coro1bQ9WUM3 484 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 HephQ9Z0Z4 1157 aa18.24■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Iqcj-Schip1A0A088MLT8 559 aa18.23■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 C7D3YXF5 845 aa18.23■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Pdia4P08003 638 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Schip1P0DPB4 484 aa18.23■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 PrkchP23298 683 aa18.23■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 ZfaP23607 742 aa18.23■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Lbx1P52955 282 aa18.23■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Cd80Q00609 306 aa18.23■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Itga4Q00651 1039 aa18.23■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Trmt10cQ3UFY8 414 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Fam189bQ5HZJ5 669 aa18.23■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Sim2Q61079 657 aa18.23■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Hpcal4Q8BGZ1 191 aa18.23■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Enpp4Q8BTJ4 456 aa18.23■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Sept10Q8C650 452 aa18.23■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Stap2Q8R0L1 411 aa18.23■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Mtmr6Q8VE11 617 aa18.23■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Pomgnt1Q91X88 660 aa18.23■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Wdr6Q99ME2 1125 aa18.23■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Slc25a11Q9CR62 314 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ccdc94Q9D6J3 314 aa18.23■□□□□ 0.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Riok3Q9DBU3 519 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.5 ms