RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628044.1

PFKL-212, Transcript of phosphofructokinase, liver type, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene PFKL, Length 129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKL-212ENST00000628044 GLI3P10071 1580 aa29.56■■■□□ 2.32
PFKL-212ENST00000628044 NWD2Q9ULI1 1742 aa29.54■■■□□ 2.32
PFKL-212ENST00000628044 PLCH1Q4KWH8 1693 aa29.54■■■□□ 2.32
PFKL-212ENST00000628044 BTG4Q9NY30 223 aa29.54■■■□□ 2.32
PFKL-212ENST00000628044 ACEP12821 1306 aa29.53■■■□□ 2.32
PFKL-212ENST00000628044 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
PFKL-212ENST00000628044 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.52■■■□□ 2.32
PFKL-212ENST00000628044 CCDC125Q86Z20 511 aa29.52■■■□□ 2.32
PFKL-212ENST00000628044 PLEKHG3A1L390 1219 aa29.51■■■□□ 2.31
PFKL-212ENST00000628044 SEPT12Q8IYM1 358 aa29.51■■■□□ 2.31
PFKL-212ENST00000628044 PRDM11Q9NQV5 511 aa29.51■■■□□ 2.31
PFKL-212ENST00000628044 A0A0G2JS52 829 aa29.49■■■□□ 2.31
PFKL-212ENST00000628044 MYT1Q01538 1121 aa29.49■■■□□ 2.31
PFKL-212ENST00000628044 CABP2Q9NPB3 220 aa29.47■■■□□ 2.31
PFKL-212ENST00000628044 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa29.47■■■□□ 2.31
PFKL-212ENST00000628044 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
PFKL-212ENST00000628044 NUTM2GQ5VZR2 741 aa29.46■■■□□ 2.31
PFKL-212ENST00000628044 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
PFKL-212ENST00000628044 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa29.45■■■□□ 2.31
PFKL-212ENST00000628044 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
PFKL-212ENST00000628044 ABTB2Q8N961 1025 aa29.44■■■□□ 2.3
PFKL-212ENST00000628044 KIAA0232Q92628 1395 aa29.42■■■□□ 2.3
PFKL-212ENST00000628044 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
PFKL-212ENST00000628044 KRT27Q7Z3Y8 459 aa29.42■■■□□ 2.3
PFKL-212ENST00000628044 EVC2Q86UK5 1308 aa29.41■■■□□ 2.3
PFKL-212ENST00000628044 QRICH2Q9H0J4 1663 aa29.4■■■□□ 2.3
PFKL-212ENST00000628044 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
PFKL-212ENST00000628044 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
PFKL-212ENST00000628044 NRAPQ86VF7 1730 aa29.39■■■□□ 2.3
PFKL-212ENST00000628044 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa29.39■■■□□ 2.3
PFKL-212ENST00000628044 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29.38■■■□□ 2.29
PFKL-212ENST00000628044 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
PFKL-212ENST00000628044 CHRNA2Q15822 529 aa29.38■■■□□ 2.29
PFKL-212ENST00000628044 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa29.38■■■□□ 2.29
PFKL-212ENST00000628044 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa29.38■■■□□ 2.29
PFKL-212ENST00000628044 CABP1Q9NZU7 370 aa29.37■■■□□ 2.29
PFKL-212ENST00000628044 ZRANB1Q9UGI0 708 aa29.36■■■□□ 2.29
PFKL-212ENST00000628044 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
PFKL-212ENST00000628044 NLRP13Q86W25 1043 aa29.35■■■□□ 2.29
PFKL-212ENST00000628044 STRN4Q9NRL3 753 aa29.34■■■□□ 2.29
PFKL-212ENST00000628044 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
PFKL-212ENST00000628044 BRWD3Q6RI45 1802 aa29.32■■■□□ 2.28
PFKL-212ENST00000628044 USP19O94966 1318 aa29.31■■■□□ 2.28
PFKL-212ENST00000628044 EVA1CP58658 441 aa29.31■■■□□ 2.28
PFKL-212ENST00000628044 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa29.31■■■□□ 2.28
PFKL-212ENST00000628044 TONSLQ96HA7 1378 aa29.3■■■□□ 2.28
PFKL-212ENST00000628044 USP6P35125 1406 aa29.29■■■□□ 2.28
PFKL-212ENST00000628044 CPDO75976 1380 aa29.28■■■□□ 2.28
PFKL-212ENST00000628044 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa29.28■■■□□ 2.28
PFKL-212ENST00000628044 GCP02774 474 aa29.28■■■□□ 2.28
PFKL-212ENST00000628044 NRKQ7Z2Y5 1582 aa29.27■■■□□ 2.28
PFKL-212ENST00000628044 NLRP6P59044 892 aa29.27■■■□□ 2.28
PFKL-212ENST00000628044 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.27■■■□□ 2.28
PFKL-212ENST00000628044 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
PFKL-212ENST00000628044 DEFB132Q7Z7B7 95 aa29.24■■■□□ 2.27
PFKL-212ENST00000628044 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
PFKL-212ENST00000628044 USP35Q9P2H5 1018 aa29.24■■■□□ 2.27
PFKL-212ENST00000628044 SSH2Q76I76 1423 aa29.23■■■□□ 2.27
PFKL-212ENST00000628044 ZBTB7CA1YPR0 619 aa29.21■■■□□ 2.27
PFKL-212ENST00000628044 BAG6P46379 1132 aa29.2■■■□□ 2.26
PFKL-212ENST00000628044 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa29.19■■■□□ 2.26
PFKL-212ENST00000628044 FAM182BQ5T319 152 aa29.19■■■□□ 2.26
PFKL-212ENST00000628044 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
PFKL-212ENST00000628044 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa29.18■■■□□ 2.26
PFKL-212ENST00000628044 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa29.18■■■□□ 2.26
PFKL-212ENST00000628044 BARGINQ6ZT62 677 aa29.17■■■□□ 2.26
PFKL-212ENST00000628044 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.16■■■□□ 2.26
PFKL-212ENST00000628044 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa29.16■■■□□ 2.26
PFKL-212ENST00000628044 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
PFKL-212ENST00000628044 PDE3BQ13370 1112 aa29.14■■■□□ 2.26
PFKL-212ENST00000628044 LMO7Q8WWI1 1683 aa29.14■■■□□ 2.26
PFKL-212ENST00000628044 TTC21AQ8NDW8 1320 aa29.14■■■□□ 2.25
PFKL-212ENST00000628044 FAM196AQ6ZSG2 479 aa29.13■■■□□ 2.25
PFKL-212ENST00000628044 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
PFKL-212ENST00000628044 SLIT3O75094 1523 aa29.13■■■□□ 2.25
PFKL-212ENST00000628044 AATKQ6ZMQ8 1374 aa29.13■■■□□ 2.25
PFKL-212ENST00000628044 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
PFKL-212ENST00000628044 KCNH5Q8NCM2 988 aa29.12■■■□□ 2.25
PFKL-212ENST00000628044 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
PFKL-212ENST00000628044 PIK3C2AO00443 1686 aa29.1■■■□□ 2.25
PFKL-212ENST00000628044 TMC1Q8TDI8 760 aa29.09■■■□□ 2.25
PFKL-212ENST00000628044 SOX12O15370 315 aa29.08■■■□□ 2.25
PFKL-212ENST00000628044 CRB1P82279 1406 aa29.08■■■□□ 2.25
PFKL-212ENST00000628044 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
PFKL-212ENST00000628044 RGPD1P0DJD0 1748 aa29.06■■■□□ 2.24
PFKL-212ENST00000628044 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa29.05■■■□□ 2.24
PFKL-212ENST00000628044 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
PFKL-212ENST00000628044 AKAP12Q02952 1782 aa29.04■■■□□ 2.24
PFKL-212ENST00000628044 TRIM37O94972 964 aa29.04■■■□□ 2.24
PFKL-212ENST00000628044 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP29.04■■■□□ 2.24
PFKL-212ENST00000628044 ARHGEF25Q86VW2 580 aa29.03■■■□□ 2.24
PFKL-212ENST00000628044 TERF2IPQ9NYB0 399 aa29.02■■■□□ 2.24
PFKL-212ENST00000628044 DISP2A7MBM2 1401 aa29.01■■■□□ 2.23
PFKL-212ENST00000628044 WDR17Q8IZU2 1322 aa29■■■□□ 2.23
PFKL-212ENST00000628044 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29■■■□□ 2.23
PFKL-212ENST00000628044 SLC24A1O60721 1099 aa28.99■■■□□ 2.23
PFKL-212ENST00000628044 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa28.99■■■□□ 2.23
PFKL-212ENST00000628044 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
PFKL-212ENST00000628044 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.99■■■□□ 2.23
PFKL-212ENST00000628044 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms