RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623103.1

C9orf62-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 62, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf62, Length 1,924 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62-201ENST00000623103 ADGRB2O60241 1585 aa22.25■■□□□ 1.15
C9orf62-201ENST00000623103 TECPR2O15040 1411 aa22.24■■□□□ 1.15
C9orf62-201ENST00000623103 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
C9orf62-201ENST00000623103 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.23■■□□□ 1.15
C9orf62-201ENST00000623103 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
C9orf62-201ENST00000623103 ITSN1Q15811 1721 aa22.23■■□□□ 1.15
C9orf62-201ENST00000623103 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
C9orf62-201ENST00000623103 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
C9orf62-201ENST00000623103 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
C9orf62-201ENST00000623103 NEUROD2Q15784 382 aa22.21■■□□□ 1.15
C9orf62-201ENST00000623103 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.2■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 SIRT1Q96EB6 747 aa22.19■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.19■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.19■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 DIP2AQ14689 1571 aa22.19■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 AKAP12Q02952 1782 aa22.19■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 CCDC27Q2M243 656 aa22.19■■□□□ 1.14
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C9orf62-201ENST00000623103 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.19■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.18■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.18■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 TBX22Q9Y458 520 aa22.18■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 WDR63Q8IWG1 891 aa22.18■■□□□ 1.14
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C9orf62-201ENST00000623103 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 PTPRUQ92729 1446 aa22.16■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 PDE4AP27815 886 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 BACH2Q9BYV9 841 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 BCAR3O75815 825 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 PIK3R4Q99570 1358 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.1■■□□□ 1.13
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C9orf62-201ENST00000623103 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 NWD1Q149M9 1564 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.07■■□□□ 1.12
C9orf62-201ENST00000623103 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.06■■□□□ 1.12
C9orf62-201ENST00000623103 PDE3AQ14432 1141 aa22.06■■□□□ 1.12
C9orf62-201ENST00000623103 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
C9orf62-201ENST00000623103 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.04■■□□□ 1.12
C9orf62-201ENST00000623103 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
C9orf62-201ENST00000623103 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
C9orf62-201ENST00000623103 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
C9orf62-201ENST00000623103 POLKQ9UBT6 870 aa22.04■■□□□ 1.12
C9orf62-201ENST00000623103 NEFMP07197 916 aa22.02■■□□□ 1.12
C9orf62-201ENST00000623103 NME9Q86XW9 330 aa22.02■■□□□ 1.12
C9orf62-201ENST00000623103 COG3Q96JB2 828 aa22.02■■□□□ 1.12
C9orf62-201ENST00000623103 KCNA6P17658 529 aa22.02■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.02■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 PTCH1Q13635 1447 aa22.02■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.01■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.01■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 FCHSD2O94868 740 aa22■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 AAMPQ13685 434 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 IL16Q14005 1332 aa21.98■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 RIPK4P57078 832 aa21.98■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.98■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.96■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 FBLN1P23142 703 aa21.96■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
C9orf62-201ENST00000623103 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.95■■□□□ 1.1
C9orf62-201ENST00000623103 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.95■■□□□ 1.1
C9orf62-201ENST00000623103 PRKAR2BP31323 418 aa21.94■■□□□ 1.1
C9orf62-201ENST00000623103 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.94■■□□□ 1.1
C9orf62-201ENST00000623103 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
C9orf62-201ENST00000623103 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.94■■□□□ 1.1
C9orf62-201ENST00000623103 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.93■■□□□ 1.1
C9orf62-201ENST00000623103 PANK1Q8TE04 598 aa21.93■■□□□ 1.1
C9orf62-201ENST00000623103 ACEP12821 1306 aa21.92■■□□□ 1.1
C9orf62-201ENST00000623103 COG6Q9Y2V7 657 aa21.92■■□□□ 1.1
C9orf62-201ENST00000623103 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
C9orf62-201ENST00000623103 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.92■■□□□ 1.1
C9orf62-201ENST00000623103 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.92■■□□□ 1.1
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