RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623103.1

C9orf62-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 62, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf62, Length 1,924 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62-201ENST00000623103 ADGRB2O60241 1585 aa22.25■■□□□ 1.15
C9orf62-201ENST00000623103 TECPR2O15040 1411 aa22.24■■□□□ 1.15
C9orf62-201ENST00000623103 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
C9orf62-201ENST00000623103 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.23■■□□□ 1.15
C9orf62-201ENST00000623103 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
C9orf62-201ENST00000623103 ITSN1Q15811 1721 aa22.23■■□□□ 1.15
C9orf62-201ENST00000623103 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
C9orf62-201ENST00000623103 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
C9orf62-201ENST00000623103 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
C9orf62-201ENST00000623103 NEUROD2Q15784 382 aa22.21■■□□□ 1.15
C9orf62-201ENST00000623103 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.2■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 SIRT1Q96EB6 747 aa22.19■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.19■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.19■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 DIP2AQ14689 1571 aa22.19■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 AKAP12Q02952 1782 aa22.19■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 CCDC27Q2M243 656 aa22.19■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.19■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.18■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.18■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 TBX22Q9Y458 520 aa22.18■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 WDR63Q8IWG1 891 aa22.18■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 PTPRUQ92729 1446 aa22.16■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
C9orf62-201ENST00000623103 PDE4AP27815 886 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 BACH2Q9BYV9 841 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 BCAR3O75815 825 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 PIK3R4Q99570 1358 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 NWD1Q149M9 1564 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf62-201ENST00000623103 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.07■■□□□ 1.12
C9orf62-201ENST00000623103 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.06■■□□□ 1.12
C9orf62-201ENST00000623103 PDE3AQ14432 1141 aa22.06■■□□□ 1.12
C9orf62-201ENST00000623103 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
C9orf62-201ENST00000623103 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.04■■□□□ 1.12
C9orf62-201ENST00000623103 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
C9orf62-201ENST00000623103 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
C9orf62-201ENST00000623103 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
C9orf62-201ENST00000623103 POLKQ9UBT6 870 aa22.04■■□□□ 1.12
C9orf62-201ENST00000623103 NEFMP07197 916 aa22.02■■□□□ 1.12
C9orf62-201ENST00000623103 NME9Q86XW9 330 aa22.02■■□□□ 1.12
C9orf62-201ENST00000623103 COG3Q96JB2 828 aa22.02■■□□□ 1.12
C9orf62-201ENST00000623103 KCNA6P17658 529 aa22.02■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.02■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 PTCH1Q13635 1447 aa22.02■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.01■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.01■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 FCHSD2O94868 740 aa22■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 AAMPQ13685 434 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 IL16Q14005 1332 aa21.98■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 RIPK4P57078 832 aa21.98■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.98■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.96■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 FBLN1P23142 703 aa21.96■■□□□ 1.11
C9orf62-201ENST00000623103 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
C9orf62-201ENST00000623103 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.95■■□□□ 1.1
C9orf62-201ENST00000623103 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.95■■□□□ 1.1
C9orf62-201ENST00000623103 PRKAR2BP31323 418 aa21.94■■□□□ 1.1
C9orf62-201ENST00000623103 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.94■■□□□ 1.1
C9orf62-201ENST00000623103 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
C9orf62-201ENST00000623103 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.94■■□□□ 1.1
C9orf62-201ENST00000623103 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.93■■□□□ 1.1
C9orf62-201ENST00000623103 PANK1Q8TE04 598 aa21.93■■□□□ 1.1
C9orf62-201ENST00000623103 ACEP12821 1306 aa21.92■■□□□ 1.1
C9orf62-201ENST00000623103 COG6Q9Y2V7 657 aa21.92■■□□□ 1.1
C9orf62-201ENST00000623103 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
C9orf62-201ENST00000623103 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.92■■□□□ 1.1
C9orf62-201ENST00000623103 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms