RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 KIF1AQ12756 1690 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMC1Q8TDI8 760 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 MRS2Q9HD23 443 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-210ENST00000617904 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-210ENST00000617904 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-210ENST00000617904 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-210ENST00000617904 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-210ENST00000617904 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC3-210ENST00000617904 MYOM1P52179 1685 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC3-210ENST00000617904 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC3-210ENST00000617904 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC3-210ENST00000617904 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC3-210ENST00000617904 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC3-210ENST00000617904 NLRP13Q86W25 1043 aa22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC3-210ENST00000617904 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLIT2O94813 1529 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 PSME1Q06323 249 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 CDK19Q9BWU1 502 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 CABP2Q9NPB3 220 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 USP32Q8NFA0 1604 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 SBNO1A3KN83 1393 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 ADGRB2O60241 1585 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 NSD2O96028 1365 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 GLI3P10071 1580 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-210ENST00000617904 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-210ENST00000617904 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARHGEF10O15013 1369 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-210ENST00000617904 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-210ENST00000617904 ABCA3Q99758 1704 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLEKHG5O94827 1062 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC3-210ENST00000617904 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC3-210ENST00000617904 ATP7BP35670 1465 aa22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC3-210ENST00000617904 VPS72Q15906 364 aa22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC125Q86Z20 511 aa22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 MORC1Q86VD1 984 aa22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM83GA6ND36 823 aa22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 ALS2Q96Q42 1657 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 CABP1Q9NZU7 370 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 EP400Q96L91 3159 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 A0A1W2PP64 1363 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-210ENST00000617904 PPP2R1AP30153 589 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC3-210ENST00000617904 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC184Q52MB2 194 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-210ENST00000617904 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-210ENST00000617904 CFAP53Q96M91 514 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-210ENST00000617904 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-210ENST00000617904 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-210ENST00000617904 NRAPQ86VF7 1730 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-210ENST00000617904 INSRP06213 1382 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC3-210ENST00000617904 BTG4Q9NY30 223 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC3-210ENST00000617904 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC3-210ENST00000617904 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC3-210ENST00000617904 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC3-210ENST00000617904 ITSN1Q15811 1721 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC3-210ENST00000617904 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC3-210ENST00000617904 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC3-210ENST00000617904 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC3-210ENST00000617904 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-210ENST00000617904 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC3-210ENST00000617904 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.32■■□□□ 1.16
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