RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		20.29	■□□□□ 0.84
MUC1-222	ENST00000610468	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	20.29	■□□□□ 0.84
MUC1-222	ENST00000610468	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		20.29	■□□□□ 0.84
MUC1-222	ENST00000610468	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		20.28	■□□□□ 0.84
MUC1-222	ENST00000610468	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	20.27	■□□□□ 0.84
MUC1-222	ENST00000610468	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		20.26	■□□□□ 0.83
MUC1-222	ENST00000610468	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	20.25	■□□□□ 0.83
MUC1-222	ENST00000610468	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		20.25	■□□□□ 0.83
MUC1-222	ENST00000610468	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		20.25	■□□□□ 0.83
MUC1-222	ENST00000610468	ITSN1	Q15811	1721 aa		20.24	■□□□□ 0.83
MUC1-222	ENST00000610468	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		20.24	■□□□□ 0.83
MUC1-222	ENST00000610468	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	20.24	■□□□□ 0.83
MUC1-222	ENST00000610468	CDK19	Q9BWU1	502 aa		20.24	■□□□□ 0.83
MUC1-222	ENST00000610468	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		20.24	■□□□□ 0.83
MUC1-222	ENST00000610468	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	20.23	■□□□□ 0.83
MUC1-222	ENST00000610468	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		20.22	■□□□□ 0.83
MUC1-222	ENST00000610468	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		20.22	■□□□□ 0.83
MUC1-222	ENST00000610468	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		20.22	■□□□□ 0.83
MUC1-222	ENST00000610468	KIAA0232	Q92628	1395 aa		20.21	■□□□□ 0.83
MUC1-222	ENST00000610468	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		20.2	■□□□□ 0.82
MUC1-222	ENST00000610468		A0A0G2JS52	829 aa		20.2	■□□□□ 0.82
MUC1-222	ENST00000610468	MYT1	Q01538	1121 aa		20.2	■□□□□ 0.82
MUC1-222	ENST00000610468	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		20.2	■□□□□ 0.82
MUC1-222	ENST00000610468	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		20.2	■□□□□ 0.82
MUC1-222	ENST00000610468	ACE	P12821	1306 aa		20.2	■□□□□ 0.82
MUC1-222	ENST00000610468	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	20.18	■□□□□ 0.82
MUC1-222	ENST00000610468	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		20.18	■□□□□ 0.82
MUC1-222	ENST00000610468	USP19	O94966	1318 aa		20.16	■□□□□ 0.82
MUC1-222	ENST00000610468	CPD	O75976	1380 aa		20.16	■□□□□ 0.82
MUC1-222	ENST00000610468	BAG6	P46379	1132 aa		20.15	■□□□□ 0.82
MUC1-222	ENST00000610468	CHRNA2	Q15822	529 aa		20.15	■□□□□ 0.82
MUC1-222	ENST00000610468	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	20.15	■□□□□ 0.82
MUC1-222	ENST00000610468	DISP2	A7MBM2	1401 aa		20.15	■□□□□ 0.82
MUC1-222	ENST00000610468	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		20.14	■□□□□ 0.81
MUC1-222	ENST00000610468	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	20.13	■□□□□ 0.81
MUC1-222	ENST00000610468	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		20.13	■□□□□ 0.81
MUC1-222	ENST00000610468	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		20.12	■□□□□ 0.81
MUC1-222	ENST00000610468	SSH2	Q76I76	1423 aa		20.12	■□□□□ 0.81
MUC1-222	ENST00000610468	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	20.12	■□□□□ 0.81
MUC1-222	ENST00000610468	FAM182B	Q5T319	152 aa		20.11	■□□□□ 0.81
MUC1-222	ENST00000610468	ABTB2	Q8N961	1025 aa		20.11	■□□□□ 0.81
MUC1-222	ENST00000610468	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	20.1	■□□□□ 0.81
MUC1-222	ENST00000610468	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		20.1	■□□□□ 0.81
MUC1-222	ENST00000610468	STRN4	Q9NRL3	753 aa		20.1	■□□□□ 0.81
MUC1-222	ENST00000610468	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		20.1	■□□□□ 0.81
MUC1-222	ENST00000610468	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		20.1	■□□□□ 0.81
MUC1-222	ENST00000610468	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		20.09	■□□□□ 0.81
MUC1-222	ENST00000610468	LRP5	O75197	1615 aa		20.09	■□□□□ 0.81
MUC1-222	ENST00000610468	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		20.08	■□□□□ 0.81
MUC1-222	ENST00000610468	CABP2	Q9NPB3	220 aa		20.08	■□□□□ 0.81
MUC1-222	ENST00000610468	GC	P02774	474 aa		20.07	■□□□□ 0.8
MUC1-222	ENST00000610468	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	20.07	■□□□□ 0.8
MUC1-222	ENST00000610468	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		20.07	■□□□□ 0.8
MUC1-222	ENST00000610468	NLRP13	Q86W25	1043 aa		20.07	■□□□□ 0.8
MUC1-222	ENST00000610468	USP6	P35125	1406 aa		20.07	■□□□□ 0.8
MUC1-222	ENST00000610468	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	20.06	■□□□□ 0.8
MUC1-222	ENST00000610468	EVA1C	P58658	441 aa		20.05	■□□□□ 0.8
MUC1-222	ENST00000610468	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	20.05	■□□□□ 0.8
MUC1-222	ENST00000610468	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		20.05	■□□□□ 0.8
MUC1-222	ENST00000610468	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		20.04	■□□□□ 0.8
MUC1-222	ENST00000610468	CABP1	Q9NZU7	370 aa		20.04	■□□□□ 0.8
MUC1-222	ENST00000610468	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	20.04	■□□□□ 0.8
MUC1-222	ENST00000610468	SLIT3	O75094	1523 aa		20.03	■□□□□ 0.8
MUC1-222	ENST00000610468	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	20.03	■□□□□ 0.8
MUC1-222	ENST00000610468	USP35	Q9P2H5	1018 aa		20.03	■□□□□ 0.8
MUC1-222	ENST00000610468	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	20.03	■□□□□ 0.8
MUC1-222	ENST00000610468	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		20.03	■□□□□ 0.8
MUC1-222	ENST00000610468	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		20.02	■□□□□ 0.8
MUC1-222	ENST00000610468	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		20.01	■□□□□ 0.79
MUC1-222	ENST00000610468	TRIM37	O94972	964 aa		20.01	■□□□□ 0.79
MUC1-222	ENST00000610468	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		20.01	■□□□□ 0.79
MUC1-222	ENST00000610468	EVC2	Q86UK5	1308 aa		20.01	■□□□□ 0.79
MUC1-222	ENST00000610468	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	20	■□□□□ 0.79
MUC1-222	ENST00000610468	PDE3B	Q13370	1112 aa		19.99	■□□□□ 0.79
MUC1-222	ENST00000610468	CRB1	P82279	1406 aa		19.99	■□□□□ 0.79
MUC1-222	ENST00000610468	NLRP6	P59044	892 aa		19.98	■□□□□ 0.79
MUC1-222	ENST00000610468	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		19.98	■□□□□ 0.79
MUC1-222	ENST00000610468	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	19.97	■□□□□ 0.79
MUC1-222	ENST00000610468	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	19.97	■□□□□ 0.79
MUC1-222	ENST00000610468	APBA3	O96018	575 aa		19.96	■□□□□ 0.79
MUC1-222	ENST00000610468	PIK3C2A	O00443	1686 aa		19.96	■□□□□ 0.79
MUC1-222	ENST00000610468	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	19.95	■□□□□ 0.78
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	19.94	■□□□□ 0.78
MUC1-222	ENST00000610468	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	19.93	■□□□□ 0.78
MUC1-222	ENST00000610468	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	19.93	■□□□□ 0.78
MUC1-222	ENST00000610468	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		19.93	■□□□□ 0.78
MUC1-222	ENST00000610468	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		19.93	■□□□□ 0.78
MUC1-222	ENST00000610468	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		19.92	■□□□□ 0.78
MUC1-222	ENST00000610468	COL18A1	P39060	1754 aa		19.91	■□□□□ 0.78
MUC1-222	ENST00000610468	NEUROD1	Q13562	356 aa		19.91	■□□□□ 0.78
MUC1-222	ENST00000610468	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		19.91	■□□□□ 0.78
MUC1-222	ENST00000610468	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		19.91	■□□□□ 0.78
MUC1-222	ENST00000610468	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		19.91	■□□□□ 0.78
MUC1-222	ENST00000610468	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		19.91	■□□□□ 0.78
MUC1-222	ENST00000610468	RREB1	Q92766	1687 aa		19.91	■□□□□ 0.78
MUC1-222	ENST00000610468	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		19.9	■□□□□ 0.78
MUC1-222	ENST00000610468	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		19.9	■□□□□ 0.78
MUC1-222	ENST00000610468	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		19.9	■□□□□ 0.78
MUC1-222	ENST00000610468	PEAK1	Q9H792	1746 aa		19.9	■□□□□ 0.78
MUC1-222	ENST00000610468	LRRC37A3	O60309	1634 aa		19.88	■□□□□ 0.77

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