RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603448.1

AP002365.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AP002365.1, Length 772 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP002365.1-201ENST00000603448 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa41.84■■■■■ 4.29
AP002365.1-201ENST00000603448 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP41.84■■■■■ 4.29
AP002365.1-201ENST00000603448 L3MBTL2Q969R5 705 aa41.83■■■■■ 4.29
AP002365.1-201ENST00000603448 EP400Q96L91 3159 aa41.83■■■■■ 4.29
AP002365.1-201ENST00000603448 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP41.83■■■■■ 4.29
AP002365.1-201ENST00000603448 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP41.82■■■■■ 4.29
AP002365.1-201ENST00000603448 CCDC61Q9Y6R9 512 aa41.81■■■■■ 4.28
AP002365.1-201ENST00000603448 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
AP002365.1-201ENST00000603448 SIN3AQ96ST3 1273 aa41.78■■■■■ 4.28
AP002365.1-201ENST00000603448 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
AP002365.1-201ENST00000603448 ACEP12821 1306 aa41.75■■■■■ 4.27
AP002365.1-201ENST00000603448 PLEKHG3A1L390 1219 aa41.75■■■■■ 4.27
AP002365.1-201ENST00000603448 CCDC125Q86Z20 511 aa41.73■■■■■ 4.27
AP002365.1-201ENST00000603448 BTG4Q9NY30 223 aa41.73■■■■■ 4.27
AP002365.1-201ENST00000603448 SEPT12Q8IYM1 358 aa41.72■■■■■ 4.27
AP002365.1-201ENST00000603448 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP41.71■■■■■ 4.27
AP002365.1-201ENST00000603448 NBPF8Q3BBV2 869 aa41.71■■■■■ 4.27
AP002365.1-201ENST00000603448 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.26
AP002365.1-201ENST00000603448 NEUROD1Q13562 356 aa41.68■■■■■ 4.26
AP002365.1-201ENST00000603448 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa41.68■■■■■ 4.26
AP002365.1-201ENST00000603448 PRDM11Q9NQV5 511 aa41.65■■■■■ 4.26
AP002365.1-201ENST00000603448 CABP2Q9NPB3 220 aa41.63■■■■■ 4.25
AP002365.1-201ENST00000603448 NRKQ7Z2Y5 1582 aa41.63■■■■■ 4.25
AP002365.1-201ENST00000603448 KIAA0232Q92628 1395 aa41.62■■■■■ 4.25
AP002365.1-201ENST00000603448 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
AP002365.1-201ENST00000603448 NUTM2GQ5VZR2 741 aa41.6■■■■■ 4.25
AP002365.1-201ENST00000603448 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP41.6■■■■■ 4.25
AP002365.1-201ENST00000603448 KRT27Q7Z3Y8 459 aa41.58■■■■■ 4.25
AP002365.1-201ENST00000603448 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa41.56■■■■■ 4.24
AP002365.1-201ENST00000603448 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa41.56■■■■■ 4.24
AP002365.1-201ENST00000603448 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
AP002365.1-201ENST00000603448 ABTB2Q8N961 1025 aa41.56■■■■■ 4.24
AP002365.1-201ENST00000603448 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa41.55■■■■■ 4.24
AP002365.1-201ENST00000603448 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP41.55■■■■■ 4.24
AP002365.1-201ENST00000603448 A0A0G2JS52 829 aa41.54■■■■■ 4.24
AP002365.1-201ENST00000603448 MYT1Q01538 1121 aa41.54■■■■■ 4.24
AP002365.1-201ENST00000603448 EVC2Q86UK5 1308 aa41.52■■■■■ 4.24
AP002365.1-201ENST00000603448 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
AP002365.1-201ENST00000603448 CHRNA2Q15822 529 aa41.52■■■■■ 4.24
AP002365.1-201ENST00000603448 USP19O94966 1318 aa41.51■■■■■ 4.24
AP002365.1-201ENST00000603448 LMO7Q8WWI1 1683 aa41.49■■■■■ 4.23
AP002365.1-201ENST00000603448 USP6P35125 1406 aa41.49■■■■■ 4.23
AP002365.1-201ENST00000603448 CABP1Q9NZU7 370 aa41.48■■■■■ 4.23
AP002365.1-201ENST00000603448 AKAP12Q02952 1782 aa41.48■■■■■ 4.23
AP002365.1-201ENST00000603448 CPDO75976 1380 aa41.47■■■■■ 4.23
AP002365.1-201ENST00000603448 NLRP13Q86W25 1043 aa41.46■■■■■ 4.23
AP002365.1-201ENST00000603448 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
AP002365.1-201ENST00000603448 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa41.44■■■■■ 4.22
AP002365.1-201ENST00000603448 STRN4Q9NRL3 753 aa41.43■■■■■ 4.22
AP002365.1-201ENST00000603448 ZRANB1Q9UGI0 708 aa41.43■■■■■ 4.22
AP002365.1-201ENST00000603448 PIK3C2AO00443 1686 aa41.42■■■■■ 4.22
AP002365.1-201ENST00000603448 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa41.42■■■■■ 4.22
AP002365.1-201ENST00000603448 RGPD1P0DJD0 1748 aa41.41■■■■■ 4.22
AP002365.1-201ENST00000603448 SSH2Q76I76 1423 aa41.4■■■■■ 4.22
AP002365.1-201ENST00000603448 GCP02774 474 aa41.38■■■■■ 4.21
AP002365.1-201ENST00000603448 DEFB132Q7Z7B7 95 aa41.38■■■■■ 4.21
AP002365.1-201ENST00000603448 SLIT3O75094 1523 aa41.38■■■■■ 4.21
AP002365.1-201ENST00000603448 TONSLQ96HA7 1378 aa41.35■■■■■ 4.21
AP002365.1-201ENST00000603448 EVA1CP58658 441 aa41.34■■■■■ 4.21
AP002365.1-201ENST00000603448 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa41.34■■■■■ 4.21
AP002365.1-201ENST00000603448 NLRP6P59044 892 aa41.31■■■■■ 4.2
AP002365.1-201ENST00000603448 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
AP002365.1-201ENST00000603448 MON2Q7Z3U7 1717 aa41.3■■■■■ 4.2
AP002365.1-201ENST00000603448 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
AP002365.1-201ENST00000603448 CARD11Q9BXL7 1154 aa41.29■■■■■ 4.2
AP002365.1-201ENST00000603448 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
AP002365.1-201ENST00000603448 BARGINQ6ZT62 677 aa41.27■■■■■ 4.2
AP002365.1-201ENST00000603448 USP35Q9P2H5 1018 aa41.27■■■■■ 4.2
AP002365.1-201ENST00000603448 FAM182BQ5T319 152 aa41.26■■■■■ 4.2
AP002365.1-201ENST00000603448 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
AP002365.1-201ENST00000603448 COL18A1P39060 1754 aa41.26■■■■■ 4.2
AP002365.1-201ENST00000603448 BAG6P46379 1132 aa41.25■■■■■ 4.19
AP002365.1-201ENST00000603448 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
AP002365.1-201ENST00000603448 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
AP002365.1-201ENST00000603448 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa41.22■■■■■ 4.19
AP002365.1-201ENST00000603448 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
AP002365.1-201ENST00000603448 AATKQ6ZMQ8 1374 aa41.21■■■■■ 4.19
AP002365.1-201ENST00000603448 TTC21AQ8NDW8 1320 aa41.2■■■■■ 4.19
AP002365.1-201ENST00000603448 TCP11L2Q8N4U5 519 aa41.2■■■■■ 4.19
AP002365.1-201ENST00000603448 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP41.19■■■■■ 4.18
AP002365.1-201ENST00000603448 RGPD5Q99666 1765 aa41.18■■■■■ 4.18
AP002365.1-201ENST00000603448 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
AP002365.1-201ENST00000603448 CRB1P82279 1406 aa41.17■■■■■ 4.18
AP002365.1-201ENST00000603448 ZBTB7CA1YPR0 619 aa41.16■■■■■ 4.18
AP002365.1-201ENST00000603448 DISP2A7MBM2 1401 aa41.16■■■■■ 4.18
AP002365.1-201ENST00000603448 USP54Q70EL1 1684 aa41.15■■■■■ 4.18
AP002365.1-201ENST00000603448 FAM196AQ6ZSG2 479 aa41.15■■■■■ 4.18
AP002365.1-201ENST00000603448 WNK3Q9BYP7 1800 aa41.15■■■■■ 4.18
AP002365.1-201ENST00000603448 KCNH5Q8NCM2 988 aa41.12■■■■■ 4.17
AP002365.1-201ENST00000603448 PDE3BQ13370 1112 aa41.11■■■■■ 4.17
AP002365.1-201ENST00000603448 CD163L1Q9NR16 1453 aa41.1■■■■■ 4.17
AP002365.1-201ENST00000603448 NFAT5O94916 1531 aa41.1■■■■■ 4.17
AP002365.1-201ENST00000603448 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
AP002365.1-201ENST00000603448 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa41.08■■■■■ 4.17
AP002365.1-201ENST00000603448 ARHGEF25Q86VW2 580 aa41.06■■■■■ 4.16
AP002365.1-201ENST00000603448 LRRC37A3O60309 1634 aa41.06■■■■■ 4.16
AP002365.1-201ENST00000603448 TRIM37O94972 964 aa41.04■■■■■ 4.16
AP002365.1-201ENST00000603448 ABCC6O95255 1503 aa41.03■■■■■ 4.16
AP002365.1-201ENST00000603448 AXIN2Q9Y2T1 843 aa41.03■■■■■ 4.16
AP002365.1-201ENST00000603448 WDR17Q8IZU2 1322 aa41.01■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms