RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598020.3

PNKP-211, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, humanhuman

TSL 3

Gene PNKP, Length 534 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKP-211ENST00000598020 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
PNKP-211ENST00000598020 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
PNKP-211ENST00000598020 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
PNKP-211ENST00000598020 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
PNKP-211ENST00000598020 A0A1W2PP64 1363 aa28.26■■■□□ 2.12
PNKP-211ENST00000598020 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.26■■■□□ 2.12
PNKP-211ENST00000598020 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
PNKP-211ENST00000598020 MYOM1P52179 1685 aa28.26■■■□□ 2.11
PNKP-211ENST00000598020 LRP6O75581 1613 aa28.25■■■□□ 2.11
PNKP-211ENST00000598020 NRKQ7Z2Y5 1582 aa28.25■■■□□ 2.11
PNKP-211ENST00000598020 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.25■■■□□ 2.11
PNKP-211ENST00000598020 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa28.24■■■□□ 2.11
PNKP-211ENST00000598020 TTC21AQ8NDW8 1320 aa28.23■■■□□ 2.11
PNKP-211ENST00000598020 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
PNKP-211ENST00000598020 ABTB2Q8N961 1025 aa28.22■■■□□ 2.11
PNKP-211ENST00000598020 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
PNKP-211ENST00000598020 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
PNKP-211ENST00000598020 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
PNKP-211ENST00000598020 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.19■■■□□ 2.1
PNKP-211ENST00000598020 ABCA3Q99758 1704 aa28.18■■■□□ 2.1
PNKP-211ENST00000598020 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa28.18■■■□□ 2.1
PNKP-211ENST00000598020 PIK3C2AO00443 1686 aa28.17■■■□□ 2.1
PNKP-211ENST00000598020 NLRP13Q86W25 1043 aa28.17■■■□□ 2.1
PNKP-211ENST00000598020 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.17■■■□□ 2.1
PNKP-211ENST00000598020 CABLES1Q8TDN4 633 aa28.16■■■□□ 2.1
PNKP-211ENST00000598020 USP19O94966 1318 aa28.16■■■□□ 2.1
PNKP-211ENST00000598020 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.14■■■□□ 2.1
PNKP-211ENST00000598020 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
PNKP-211ENST00000598020 USP31Q70CQ4 1352 aa28.13■■■□□ 2.09
PNKP-211ENST00000598020 CCDC7Q96M83 1385 aa28.13■■■□□ 2.09
PNKP-211ENST00000598020 NLRP6P59044 892 aa28.13■■■□□ 2.09
PNKP-211ENST00000598020 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
PNKP-211ENST00000598020 ADAMTS2O95450 1211 aa28.12■■■□□ 2.09
PNKP-211ENST00000598020 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP28.12■■■□□ 2.09
PNKP-211ENST00000598020 USP54Q70EL1 1684 aa28.12■■■□□ 2.09
PNKP-211ENST00000598020 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
PNKP-211ENST00000598020 CARD14Q9BXL6 1004 aa28.11■■■□□ 2.09
PNKP-211ENST00000598020 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.11■■■□□ 2.09
PNKP-211ENST00000598020 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
PNKP-211ENST00000598020 SLIT3O75094 1523 aa28.09■■■□□ 2.09
PNKP-211ENST00000598020 NME9Q86XW9 330 aa28.08■■■□□ 2.09
PNKP-211ENST00000598020 PANK3Q9H999 370 aa28.07■■■□□ 2.08
PNKP-211ENST00000598020 PLEKHG5O94827 1062 aa28.06■■■□□ 2.08
PNKP-211ENST00000598020 GCP02774 474 aa28.06■■■□□ 2.08
PNKP-211ENST00000598020 C8orf37Q96NL8 207 aa28.06■■■□□ 2.08
PNKP-211ENST00000598020 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
PNKP-211ENST00000598020 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.05■■■□□ 2.08
PNKP-211ENST00000598020 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa28.04■■■□□ 2.08
PNKP-211ENST00000598020 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.04■■■□□ 2.08
PNKP-211ENST00000598020 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
PNKP-211ENST00000598020 NGLY1Q96IV0 654 aa28.04■■■□□ 2.08
PNKP-211ENST00000598020 FYB1O15117 783 aa28.03■■■□□ 2.08
PNKP-211ENST00000598020 KCNH5Q8NCM2 988 aa28.03■■■□□ 2.08
PNKP-211ENST00000598020 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
PNKP-211ENST00000598020 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.03■■■□□ 2.08
PNKP-211ENST00000598020 CPDO75976 1380 aa28.02■■■□□ 2.08
PNKP-211ENST00000598020 AFF2P51816 1311 aa28.01■■■□□ 2.07
PNKP-211ENST00000598020 FAM83GA6ND36 823 aa28■■■□□ 2.07
PNKP-211ENST00000598020 SLIT2O94813 1529 aa28■■■□□ 2.07
PNKP-211ENST00000598020 KIAA0232Q92628 1395 aa27.99■■■□□ 2.07
PNKP-211ENST00000598020 CGNL1Q0VF96 1302 aa27.99■■■□□ 2.07
PNKP-211ENST00000598020 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
PNKP-211ENST00000598020 KIF20BQ96Q89 1820 aa27.99■■■□□ 2.07
PNKP-211ENST00000598020 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
PNKP-211ENST00000598020 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
PNKP-211ENST00000598020 COG3Q96JB2 828 aa27.98■■■□□ 2.07
PNKP-211ENST00000598020 NFAT5O94916 1531 aa27.97■■■□□ 2.07
PNKP-211ENST00000598020 PRDM11Q9NQV5 511 aa27.97■■■□□ 2.07
PNKP-211ENST00000598020 NWD2Q9ULI1 1742 aa27.96■■■□□ 2.07
PNKP-211ENST00000598020 BCL9LQ86UU0 1499 aa27.95■■■□□ 2.07
PNKP-211ENST00000598020 GGNBP2Q9H3C7 697 aa27.95■■■□□ 2.06
PNKP-211ENST00000598020 PLCH1Q4KWH8 1693 aa27.94■■■□□ 2.06
PNKP-211ENST00000598020 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
PNKP-211ENST00000598020 USP21Q9UK80 565 aa27.94■■■□□ 2.06
PNKP-211ENST00000598020 ARHGEF25Q86VW2 580 aa27.93■■■□□ 2.06
PNKP-211ENST00000598020 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
PNKP-211ENST00000598020 UNC5CLQ8IV45 518 aa27.92■■■□□ 2.06
PNKP-211ENST00000598020 KNSTRNQ9Y448 316 aa27.92■■■□□ 2.06
PNKP-211ENST00000598020 NSD2O96028 1365 aa27.91■■■□□ 2.06
PNKP-211ENST00000598020 AATKQ6ZMQ8 1374 aa27.91■■■□□ 2.06
PNKP-211ENST00000598020 LMO7Q8WWI1 1683 aa27.9■■■□□ 2.06
PNKP-211ENST00000598020 CHRNA2Q15822 529 aa27.89■■■□□ 2.06
PNKP-211ENST00000598020 POTEAQ6S8J7 498 aa27.89■■■□□ 2.06
PNKP-211ENST00000598020 BTG4Q9NY30 223 aa27.89■■■□□ 2.06
PNKP-211ENST00000598020 COL18A1P39060 1754 aa27.88■■■□□ 2.05
PNKP-211ENST00000598020 ABCC6O95255 1503 aa27.88■■■□□ 2.05
PNKP-211ENST00000598020 SOX12O15370 315 aa27.88■■■□□ 2.05
PNKP-211ENST00000598020 NRAPQ86VF7 1730 aa27.87■■■□□ 2.05
PNKP-211ENST00000598020 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa27.87■■■□□ 2.05
PNKP-211ENST00000598020 ATRNO75882 1429 aa27.87■■■□□ 2.05
PNKP-211ENST00000598020 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
PNKP-211ENST00000598020 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
PNKP-211ENST00000598020 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
PNKP-211ENST00000598020 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa27.85■■■□□ 2.05
PNKP-211ENST00000598020 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa27.84■■■□□ 2.05
PNKP-211ENST00000598020 LTN1O94822 1766 aa27.83■■■□□ 2.05
PNKP-211ENST00000598020 VPS72Q15906 364 aa27.83■■■□□ 2.05
PNKP-211ENST00000598020 ZBTB7CA1YPR0 619 aa27.8■■■□□ 2.04
PNKP-211ENST00000598020 AXIN2Q9Y2T1 843 aa27.8■■■□□ 2.04
PNKP-211ENST00000598020 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
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