RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 RGL3Q3MIN7 710 aa12.4□□□□□ -0.42
EFTUD2-222ENST00000592408 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
EFTUD2-222ENST00000592408 INSRP06213 1382 aa12.4□□□□□ -0.42
EFTUD2-222ENST00000592408 CLTCL1P53675 1640 aa12.4□□□□□ -0.42
EFTUD2-222ENST00000592408 EFCAB6Q5THR3 1501 aa12.39□□□□□ -0.43
EFTUD2-222ENST00000592408 LMTK2Q8IWU2 1503 aa12.39□□□□□ -0.43
EFTUD2-222ENST00000592408 CDCA8Q53HL2 280 aa12.39□□□□□ -0.43
EFTUD2-222ENST00000592408 PARD3Q8TEW0 1356 aa12.39□□□□□ -0.43
EFTUD2-222ENST00000592408 MYOM2P54296 1465 aa12.39□□□□□ -0.43
EFTUD2-222ENST00000592408 NLRP13Q86W25 1043 aa12.38□□□□□ -0.43
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP4R2Q9NY27 417 aa12.38□□□□□ -0.43
EFTUD2-222ENST00000592408 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
EFTUD2-222ENST00000592408 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
EFTUD2-222ENST00000592408 NUDCQ9Y266 331 aa12.37□□□□□ -0.43
EFTUD2-222ENST00000592408 SYNMO15061 1565 aa12.37□□□□□ -0.43
EFTUD2-222ENST00000592408 MROH1Q8NDA8 1641 aa12.37□□□□□ -0.43
EFTUD2-222ENST00000592408 AFAP1Q8N556 730 aa12.36□□□□□ -0.43
EFTUD2-222ENST00000592408 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa12.36□□□□□ -0.43
EFTUD2-222ENST00000592408 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
EFTUD2-222ENST00000592408 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
EFTUD2-222ENST00000592408 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa12.35□□□□□ -0.43
EFTUD2-222ENST00000592408 DISP3Q9P2K9 1392 aa12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-222ENST00000592408 PBX2P40425 430 aa12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-222ENST00000592408 NBPF1Q3BBV0 1214 aa12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-222ENST00000592408 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-222ENST00000592408 POGZQ7Z3K3 1410 aa12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-222ENST00000592408 HECW2Q9P2P5 1572 aa12.34□□□□□ -0.43
EFTUD2-222ENST00000592408 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa12.33□□□□□ -0.44
EFTUD2-222ENST00000592408 KIF1BO60333 1816 aa12.33□□□□□ -0.44
EFTUD2-222ENST00000592408 PSEN2P49810 448 aa12.33□□□□□ -0.44
EFTUD2-222ENST00000592408 DMRTA1Q5VZB9 504 aa12.33□□□□□ -0.44
EFTUD2-222ENST00000592408 TESK2Q96S53 571 aa12.33□□□□□ -0.44
EFTUD2-222ENST00000592408 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-222ENST00000592408 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-222ENST00000592408 MLH3Q9UHC1 1453 aa12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-222ENST00000592408 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-222ENST00000592408 KIF3BO15066 747 aa12.31□□□□□ -0.44
EFTUD2-222ENST00000592408 PDE3BQ13370 1112 aa12.31□□□□□ -0.44
EFTUD2-222ENST00000592408 NEO1Q92859 1461 aa12.31□□□□□ -0.44
EFTUD2-222ENST00000592408 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
EFTUD2-222ENST00000592408 CD109Q6YHK3 1445 aa12.3□□□□□ -0.44
EFTUD2-222ENST00000592408 OXER1Q8TDS5 423 aa12.3□□□□□ -0.44
EFTUD2-222ENST00000592408 IFT172Q9UG01 1749 aa12.3□□□□□ -0.44
EFTUD2-222ENST00000592408 ABCA6Q8N139 1617 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-222ENST00000592408 ADGRB3O60242 1522 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGAP33O14559 1287 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-222ENST00000592408 PTGER2P43116 358 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-222ENST00000592408 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-222ENST00000592408 CFAP44Q96MT7 982 aa12.29□□□□□ -0.44
EFTUD2-222ENST00000592408 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-222ENST00000592408 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-222ENST00000592408 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-222ENST00000592408 RNF123Q5XPI4 1314 aa12.28□□□□□ -0.44
EFTUD2-222ENST00000592408 NRXN1Q9ULB1 1477 aa12.27□□□□□ -0.44
EFTUD2-222ENST00000592408 MYO3AQ8NEV4 1616 aa12.27□□□□□ -0.44
EFTUD2-222ENST00000592408 ADGRD1Q6QNK2 874 aa12.27□□□□□ -0.45
EFTUD2-222ENST00000592408 PANK3Q9H999 370 aa12.27□□□□□ -0.45
EFTUD2-222ENST00000592408 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa12.27□□□□□ -0.45
EFTUD2-222ENST00000592408 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa12.27□□□□□ -0.45
EFTUD2-222ENST00000592408 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
EFTUD2-222ENST00000592408 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
EFTUD2-222ENST00000592408 KNSTRNQ9Y448 316 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-222ENST00000592408 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-222ENST00000592408 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-222ENST00000592408 MROH2AA6NES4 1674 aa12.25□□□□□ -0.45
EFTUD2-222ENST00000592408 MYOM1P52179 1685 aa12.24□□□□□ -0.45
EFTUD2-222ENST00000592408 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-222ENST00000592408 ABCC3O15438 1527 aa12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-222ENST00000592408 PIK3C2GO75747 1445 aa12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-222ENST00000592408 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-222ENST00000592408 TBC1D12O60347 775 aa12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM69CQ0P6D2 419 aa12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-222ENST00000592408 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-222ENST00000592408 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-222ENST00000592408 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-222ENST00000592408 UGGT1Q9NYU2 1555 aa12.22□□□□□ -0.45
EFTUD2-222ENST00000592408 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa12.22□□□□□ -0.45
EFTUD2-222ENST00000592408 CADPS2Q86UW7 1296 aa12.22□□□□□ -0.45
EFTUD2-222ENST00000592408 PPLO60437 1756 aa12.21□□□□□ -0.45
EFTUD2-222ENST00000592408 HRO43593 1189 aa12.21□□□□□ -0.45
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa12.21□□□□□ -0.45
EFTUD2-222ENST00000592408 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
EFTUD2-222ENST00000592408 NPATQ14207 1427 aa12.2□□□□□ -0.46
EFTUD2-222ENST00000592408 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP12.2□□□□□ -0.46
EFTUD2-222ENST00000592408 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa12.2□□□□□ -0.46
EFTUD2-222ENST00000592408 FANCIQ9NVI1 1328 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-222ENST00000592408 PDE4AP27815 886 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-222ENST00000592408 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC136Q96JN2 1154 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNK17Q96T54 332 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-222ENST00000592408 ERVK-7P63135 1459 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-222ENST00000592408 NOS1P29475 1434 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-222ENST00000592408 GLI2P10070 1586 aa12.18□□□□□ -0.46
EFTUD2-222ENST00000592408 RRP1P56182 461 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa12.18□□□□□ -0.46
EFTUD2-222ENST00000592408 PIK3C2BO00750 1634 aa12.18□□□□□ -0.46
EFTUD2-222ENST00000592408 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa12.17□□□□□ -0.46
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF454Q8N9F8 522 aa12.17□□□□□ -0.46
EFTUD2-222ENST00000592408 RCAN3Q9UKA8 241 aa12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms