RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590198.1

ROGDI-212, Transcript of rogdi homolog, human

TSL 3

Gene ROGDI, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ROGDI-212	ENST00000590198	USP6	P35125	1406 aa		42.85	■■■■■ 4.45
ROGDI-212	ENST00000590198	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		42.84	■■■■■ 4.45
ROGDI-212	ENST00000590198	ALS2	Q96Q42	1657 aa		42.84	■■■■■ 4.45
ROGDI-212	ENST00000590198	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	42.82	■■■■■ 4.45
ROGDI-212	ENST00000590198	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	42.8	■■■■■ 4.44
ROGDI-212	ENST00000590198	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	42.8	■■■■■ 4.44
ROGDI-212	ENST00000590198	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		42.79	■■■■■ 4.44
ROGDI-212	ENST00000590198	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	42.79	■■■■■ 4.44
ROGDI-212	ENST00000590198	ABTB2	Q8N961	1025 aa		42.79	■■■■■ 4.44
ROGDI-212	ENST00000590198	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	42.78	■■■■■ 4.44
ROGDI-212	ENST00000590198	C8orf37	Q96NL8	207 aa		42.77	■■■■■ 4.44
ROGDI-212	ENST00000590198	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		42.77	■■■■■ 4.44
ROGDI-212	ENST00000590198	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		42.77	■■■■■ 4.44
ROGDI-212	ENST00000590198	AKAP12	Q02952	1782 aa		42.76	■■■■■ 4.44
ROGDI-212	ENST00000590198	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		42.75	■■■■■ 4.43
ROGDI-212	ENST00000590198	SSH2	Q76I76	1423 aa		42.73	■■■■■ 4.43
ROGDI-212	ENST00000590198	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		42.72	■■■■■ 4.43
ROGDI-212	ENST00000590198	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		42.72	■■■■■ 4.43
ROGDI-212	ENST00000590198	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	42.72	■■■■■ 4.43
ROGDI-212	ENST00000590198	NGLY1	Q96IV0	654 aa		42.71	■■■■■ 4.43
ROGDI-212	ENST00000590198		A0A1W2PP64	1363 aa		42.69	■■■■■ 4.42
ROGDI-212	ENST00000590198	NLRP13	Q86W25	1043 aa		42.67	■■■■■ 4.42
ROGDI-212	ENST00000590198	AFF2	P51816	1311 aa		42.67	■■■■■ 4.42
ROGDI-212	ENST00000590198	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		42.66	■■■■■ 4.42
ROGDI-212	ENST00000590198	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		42.66	■■■■■ 4.42
ROGDI-212	ENST00000590198	NLRP6	P59044	892 aa		42.65	■■■■■ 4.42
ROGDI-212	ENST00000590198	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	42.65	■■■■■ 4.42
ROGDI-212	ENST00000590198	ABCA3	Q99758	1704 aa		42.65	■■■■■ 4.42
ROGDI-212	ENST00000590198	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		42.61	■■■■■ 4.41
ROGDI-212	ENST00000590198	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		42.61	■■■■■ 4.41
ROGDI-212	ENST00000590198	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	42.6	■■■■■ 4.41
ROGDI-212	ENST00000590198	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	42.6	■■■■■ 4.41
ROGDI-212	ENST00000590198	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	42.6	■■■■■ 4.41
ROGDI-212	ENST00000590198	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	42.6	■■■■■ 4.41
ROGDI-212	ENST00000590198	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		42.58	■■■■■ 4.41
ROGDI-212	ENST00000590198	USP19	O94966	1318 aa		42.57	■■■■■ 4.41
ROGDI-212	ENST00000590198	PIK3C2A	O00443	1686 aa		42.57	■■■■■ 4.4
ROGDI-212	ENST00000590198	POTEA	Q6S8J7	498 aa		42.56	■■■■■ 4.4
ROGDI-212	ENST00000590198	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	42.55	■■■■■ 4.4
ROGDI-212	ENST00000590198	NME9	Q86XW9	330 aa		42.54	■■■■■ 4.4
ROGDI-212	ENST00000590198	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	42.53	■■■■■ 4.4
ROGDI-212	ENST00000590198	USP21	Q9UK80	565 aa		42.53	■■■■■ 4.4
ROGDI-212	ENST00000590198	MYOM1	P52179	1685 aa		42.53	■■■■■ 4.4
ROGDI-212	ENST00000590198	FAM83G	A6ND36	823 aa		42.52	■■■■■ 4.4
ROGDI-212	ENST00000590198	GC	P02774	474 aa		42.51	■■■■■ 4.4
ROGDI-212	ENST00000590198	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	42.51	■■■■■ 4.4
ROGDI-212	ENST00000590198	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		42.51	■■■■■ 4.4
ROGDI-212	ENST00000590198	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		42.48	■■■■■ 4.39
ROGDI-212	ENST00000590198	KIAA0232	Q92628	1395 aa		42.46	■■■■■ 4.39
ROGDI-212	ENST00000590198	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		42.46	■■■■■ 4.39
ROGDI-212	ENST00000590198	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	42.45	■■■■■ 4.39
ROGDI-212	ENST00000590198	ILDR2	Q71H61	639 aa		42.45	■■■■■ 4.39
ROGDI-212	ENST00000590198	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	42.45	■■■■■ 4.39
ROGDI-212	ENST00000590198	USP31	Q70CQ4	1352 aa		42.44	■■■■■ 4.38
ROGDI-212	ENST00000590198	SLIT3	O75094	1523 aa		42.43	■■■■■ 4.38
ROGDI-212	ENST00000590198	SLIT2	O94813	1529 aa		42.43	■■■■■ 4.38
ROGDI-212	ENST00000590198	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		42.43	■■■■■ 4.38
ROGDI-212	ENST00000590198	SOX12	O15370	315 aa		42.42	■■■■■ 4.38
ROGDI-212	ENST00000590198	CHRNA2	Q15822	529 aa		42.42	■■■■■ 4.38
ROGDI-212	ENST00000590198	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		42.42	■■■■■ 4.38
ROGDI-212	ENST00000590198	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		42.4	■■■■■ 4.38
ROGDI-212	ENST00000590198	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		42.4	■■■■■ 4.38
ROGDI-212	ENST00000590198	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	42.39	■■■■■ 4.38
ROGDI-212	ENST00000590198	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	42.38	■■■■■ 4.37
ROGDI-212	ENST00000590198	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		42.38	■■■■■ 4.37
ROGDI-212	ENST00000590198	BTG4	Q9NY30	223 aa		42.38	■■■■■ 4.37
ROGDI-212	ENST00000590198	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		42.37	■■■■■ 4.37
ROGDI-212	ENST00000590198	CPD	O75976	1380 aa		42.37	■■■■■ 4.37
ROGDI-212	ENST00000590198	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		42.37	■■■■■ 4.37
ROGDI-212	ENST00000590198	PANK3	Q9H999	370 aa		42.36	■■■■■ 4.37
ROGDI-212	ENST00000590198	RXRB	P28702	533 aa		42.34	■■■■■ 4.37
ROGDI-212	ENST00000590198	FYB1	O15117	783 aa		42.33	■■■■■ 4.37
ROGDI-212	ENST00000590198	COG3	Q96JB2	828 aa		42.33	■■■■■ 4.37
ROGDI-212	ENST00000590198	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		42.32	■■■■■ 4.37
ROGDI-212	ENST00000590198	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		42.31	■■■■■ 4.36
ROGDI-212	ENST00000590198	ATRN	O75882	1429 aa		42.31	■■■■■ 4.36
ROGDI-212	ENST00000590198	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		42.31	■■■■■ 4.36
ROGDI-212	ENST00000590198	CCDC7	Q96M83	1385 aa		42.31	■■■■■ 4.36
ROGDI-212	ENST00000590198	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		42.31	■■■■■ 4.36
ROGDI-212	ENST00000590198	USP54	Q70EL1	1684 aa		42.31	■■■■■ 4.36
ROGDI-212	ENST00000590198	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		42.29	■■■■■ 4.36
ROGDI-212	ENST00000590198	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	42.28	■■■■■ 4.36
ROGDI-212	ENST00000590198	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	42.27	■■■■■ 4.36
ROGDI-212	ENST00000590198	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		42.26	■■■■■ 4.36
ROGDI-212	ENST00000590198	NFAT5	O94916	1531 aa		42.25	■■■■■ 4.35
ROGDI-212	ENST00000590198	VPS72	Q15906	364 aa		42.24	■■■■■ 4.35
ROGDI-212	ENST00000590198	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	42.24	■■■■■ 4.35
ROGDI-212	ENST00000590198	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		42.23	■■■■■ 4.35
ROGDI-212	ENST00000590198	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	42.23	■■■■■ 4.35
ROGDI-212	ENST00000590198	STRN4	Q9NRL3	753 aa		42.23	■■■■■ 4.35
ROGDI-212	ENST00000590198	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		42.22	■■■■■ 4.35
ROGDI-212	ENST00000590198	EVA1C	P58658	441 aa		42.21	■■■■■ 4.35
ROGDI-212	ENST00000590198	NRAP	Q86VF7	1730 aa		42.2	■■■■■ 4.35
ROGDI-212	ENST00000590198	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		42.2	■■■■■ 4.35
ROGDI-212	ENST00000590198	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		42.19	■■■■■ 4.34
ROGDI-212	ENST00000590198	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		42.18	■■■■■ 4.34
ROGDI-212	ENST00000590198	FBLN1	P23142	703 aa		42.14	■■■■■ 4.34
ROGDI-212	ENST00000590198	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		42.14	■■■■■ 4.34
ROGDI-212	ENST00000590198	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		42.14	■■■■■ 4.34
ROGDI-212	ENST00000590198	COL18A1	P39060	1754 aa		42.11	■■■■■ 4.33

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