RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589057.5

APOC4-APOC2-202, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene APOC4-APOC2, Length 680 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TCP11L2Q8N4U5 519 aa15.91■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
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APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NLRP6P59044 892 aa15.9■□□□□ 0.14
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APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CRB1P82279 1406 aa15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PDE3BQ13370 1112 aa15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CAMKK2Q96RR4 588 aa15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RREB1Q92766 1687 aa15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZBTB7CA1YPR0 619 aa15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RGPD5Q99666 1765 aa15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 WNK3Q9BYP7 1800 aa15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 APBA3O96018 575 aa15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LRRC37A3O60309 1634 aa15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MON2Q7Z3U7 1717 aa15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PEAK1Q9H792 1746 aa15.85■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 AXIN2Q9Y2T1 843 aa15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NUP188Q5SRE5 1749 aa15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PARD3Q8TEW0 1356 aa15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa15.84■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ARHGEF25Q86VW2 580 aa15.83■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TTC21AQ8NDW8 1320 aa15.83■□□□□ 0.12
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