RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 USP47Q96K76 1375 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-211ENST00000588374 ILDR2Q71H61 639 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-211ENST00000588374 NGLY1Q96IV0 654 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-211ENST00000588374 C8orf37Q96NL8 207 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-211ENST00000588374 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-211ENST00000588374 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-211ENST00000588374 SBNO1A3KN83 1393 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC24A1O60721 1099 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-211ENST00000588374 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-211ENST00000588374 TMF1P82094 1093 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-211ENST00000588374 ABTB2Q8N961 1025 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-211ENST00000588374 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-211ENST00000588374 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
EFTUD2-211ENST00000588374 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa9.52□□□□□ -0.88
EFTUD2-211ENST00000588374 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 TNS3Q68CZ2 1445 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 POTEAQ6S8J7 498 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 AFF2P51816 1311 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 ALS2Q96Q42 1657 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 POLR3GLQ9BT43 218 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 ARHGEF10O15013 1369 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 ATAD2Q6PL18 1390 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 AKAP12Q02952 1782 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 NLRP6P59044 892 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 NLRP13Q86W25 1043 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.898e-7■■□□□ 12.8
EFTUD2-211ENST00000588374 TERF2IPQ9NYB0 399 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 USP21Q9UK80 565 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM83GA6ND36 823 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 CDCA8Q53HL2 280 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 USP6P35125 1406 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 ZBTB7CA1YPR0 619 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 DSG3P32926 999 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 ZRANB1Q9UGI0 708 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 ABCA3Q99758 1704 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-211ENST00000588374 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 SOX12O15370 315 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 CAPN15O75808 1086 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 RXRBP28702 533 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 CHRNA2Q15822 529 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 CD163L1Q9NR16 1453 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 MON2Q7Z3U7 1717 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 GCP02774 474 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 NME9Q86XW9 330 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 PRDM11Q9NQV5 511 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 BTG4Q9NY30 223 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 TTC21AQ8NDW8 1320 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 SSH2Q76I76 1423 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 UNC5CLQ8IV45 518 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A1W2PP64 1363 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 PIK3C2AO00443 1686 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 PLCH1Q4KWH8 1693 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 BCL9LQ86UU0 1499 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 KIAA0232Q92628 1395 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 EVA1CP58658 441 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 NINLQ9Y2I6 1382 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 CARD14Q9BXL6 1004 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 STRN4Q9NRL3 753 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 NRKQ7Z2Y5 1582 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 SLIT2O94813 1529 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 USP19O94966 1318 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNH5Q8NCM2 988 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 GGNBP2Q9H3C7 697 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 RGPD5Q99666 1765 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 NWD2Q9ULI1 1742 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 MYOM1P52179 1685 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 FYB1O15117 783 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 FBLN1P23142 703 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 VPS72Q15906 364 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 COG3Q96JB2 828 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 PANK3Q9H999 370 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-211ENST00000588374 ATRNO75882 1429 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 SOCS7O14512 581 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 ARHGEF25Q86VW2 580 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-211ENST00000588374 USP31Q70CQ4 1352 aa9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.7 ms