RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586291.1

REXO1-202, Transcript of RNA exonuclease 1 homolog, humanhuman

TSL 3

Gene REXO1, Length 544 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO1-202ENST00000586291 ATP7BP35670 1465 aa23.23■■□□□ 1.31
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REXO1-202ENST00000586291 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.21■■□□□ 1.31
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REXO1-202ENST00000586291 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.19■■□□□ 1.3
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REXO1-202ENST00000586291 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa23.09■■□□□ 1.29
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REXO1-202ENST00000586291 FAM182BQ5T319 152 aa23.04■■□□□ 1.28
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REXO1-202ENST00000586291 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa23.03■■□□□ 1.28
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REXO1-202ENST00000586291 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa23■■□□□ 1.27
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REXO1-202ENST00000586291 AKAP12Q02952 1782 aa22.96■■□□□ 1.27
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REXO1-202ENST00000586291 CPDO75976 1380 aa22.89■■□□□ 1.26
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REXO1-202ENST00000586291 APBA3O96018 575 aa22.88■■□□□ 1.25
REXO1-202ENST00000586291 NLRP13Q86W25 1043 aa22.88■■□□□ 1.25
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REXO1-202ENST00000586291 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.86■■□□□ 1.25
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REXO1-202ENST00000586291 USP35Q9P2H5 1018 aa22.85■■□□□ 1.25
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REXO1-202ENST00000586291 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
REXO1-202ENST00000586291 COL18A1P39060 1754 aa22.82■■□□□ 1.24
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REXO1-202ENST00000586291 NLRP6P59044 892 aa22.8■■□□□ 1.24
REXO1-202ENST00000586291 USP54Q70EL1 1684 aa22.79■■□□□ 1.24
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REXO1-202ENST00000586291 RGPD5Q99666 1765 aa22.78■■□□□ 1.24
REXO1-202ENST00000586291 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.78■■□□□ 1.24
REXO1-202ENST00000586291 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.77■■□□□ 1.24
REXO1-202ENST00000586291 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
REXO1-202ENST00000586291 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.77■■□□□ 1.24
REXO1-202ENST00000586291 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
REXO1-202ENST00000586291 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.76■■□□□ 1.23
REXO1-202ENST00000586291 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
REXO1-202ENST00000586291 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
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