RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 DUOX2Q9NRD8 1548 aa11.97□□□□□ -0.49
GGA3-218ENST00000584243 TSPY4P0CV99 314 aa11.97□□□□□ -0.49
GGA3-218ENST00000584243 TSPY10P0CW01 314 aa11.97□□□□□ -0.49
GGA3-218ENST00000584243 CHGAP10645 457 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
GGA3-218ENST00000584243 ESCO1Q5FWF5 840 aa11.96□□□□□ -0.49
GGA3-218ENST00000584243 BTG4Q9NY30 223 aa11.96□□□□□ -0.49
GGA3-218ENST00000584243 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
GGA3-218ENST00000584243 CLSPNQ9HAW4 1339 aa11.94□□□□□ -0.5
GGA3-218ENST00000584243 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
GGA3-218ENST00000584243 PLEKHG5O94827 1062 aa11.93□□□□□ -0.5
GGA3-218ENST00000584243 ROBO2Q9HCK4 1378 aa11.92□□□□□ -0.5
GGA3-218ENST00000584243 PLSCR1O15162 318 aa11.92□□□□□ -0.5
GGA3-218ENST00000584243 GRIN3BO60391 1043 aa11.92□□□□□ -0.5
GGA3-218ENST00000584243 PTF1AQ7RTS3 328 aa11.92□□□□□ -0.5
GGA3-218ENST00000584243 TOMM70O94826 608 aa11.91□□□□□ -0.5
GGA3-218ENST00000584243 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
GGA3-218ENST00000584243 ERBINQ96RT1 1412 aa11.91□□□□□ -0.5
GGA3-218ENST00000584243 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa11.9□□□□□ -0.5
GGA3-218ENST00000584243 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
GGA3-218ENST00000584243 SLC15A2Q16348 729 aa11.9□□□□□ -0.5
GGA3-218ENST00000584243 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
GGA3-218ENST00000584243 TNS3Q68CZ2 1445 aa11.89□□□□□ -0.51
GGA3-218ENST00000584243 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
GGA3-218ENST00000584243 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
GGA3-218ENST00000584243 RGS19P49795 217 aa11.88□□□□□ -0.51
GGA3-218ENST00000584243 KLHL34Q8N239 644 aa11.88□□□□□ -0.51
GGA3-218ENST00000584243 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
GGA3-218ENST00000584243 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa11.88□□□□□ -0.51
GGA3-218ENST00000584243 TECPR2O15040 1411 aa11.87□□□□□ -0.51
GGA3-218ENST00000584243 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa11.87□□□□□ -0.51
GGA3-218ENST00000584243 PEAK1Q9H792 1746 aa11.87□□□□□ -0.51
GGA3-218ENST00000584243 KANK1Q14678 1352 aa11.87□□□□□ -0.51
GGA3-218ENST00000584243 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
GGA3-218ENST00000584243 STK32BQ9NY57 414 aa11.86□□□□□ -0.51
GGA3-218ENST00000584243 KIF15Q9NS87 1388 aa11.86□□□□□ -0.51
GGA3-218ENST00000584243 COL24A1Q17RW2 1714 aa11.86□□□□□ -0.51
GGA3-218ENST00000584243 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
GGA3-218ENST00000584243 CCDC144AA2RUR9 1427 aa11.86□□□□□ -0.51
GGA3-218ENST00000584243 KRT28Q7Z3Y7 464 aa11.84□□□□□ -0.51
GGA3-218ENST00000584243 PDE3BQ13370 1112 aa11.83□□□□□ -0.52
GGA3-218ENST00000584243 PRAG1Q86YV5 1406 aa11.83□□□□□ -0.52
GGA3-218ENST00000584243 USP19O94966 1318 aa11.83□□□□□ -0.52
GGA3-218ENST00000584243 SBF2Q86WG5 1849 aa11.82□□□□□ -0.52
GGA3-218ENST00000584243 ABHD8Q96I13 439 aa11.82□□□□□ -0.52
GGA3-218ENST00000584243 NUTM2FA1L443 756 aa11.81□□□□□ -0.52
GGA3-218ENST00000584243 TULP4Q9NRJ4 1543 aa11.81□□□□□ -0.52
GGA3-218ENST00000584243 PAPPAQ13219 1627 aa11.8□□□□□ -0.52
GGA3-218ENST00000584243 TXNRD1Q16881 649 aa11.79□□□□□ -0.52
GGA3-218ENST00000584243 BARGINQ6ZT62 677 aa11.79□□□□□ -0.52
GGA3-218ENST00000584243 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
GGA3-218ENST00000584243 NMRK2Q9NPI5 230 aa11.79□□□□□ -0.52
GGA3-218ENST00000584243 IQGAP3Q86VI3 1631 aa11.78□□□□□ -0.52
GGA3-218ENST00000584243 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
GGA3-218ENST00000584243 KIF1AQ12756 1690 aa11.78□□□□□ -0.52
GGA3-218ENST00000584243 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa11.78□□□□□ -0.52
GGA3-218ENST00000584243 SBNO1A3KN83 1393 aa11.78□□□□□ -0.52
GGA3-218ENST00000584243 HFM1A2PYH4 1435 aa11.77□□□□□ -0.53
GGA3-218ENST00000584243 FOXN1O15353 648 aa11.76□□□□□ -0.53
GGA3-218ENST00000584243 PRDM10Q9NQV6 1147 aa11.76□□□□□ -0.53
GGA3-218ENST00000584243 USP35Q9P2H5 1018 aa11.76□□□□□ -0.53
GGA3-218ENST00000584243 ARHGEF10O15013 1369 aa11.76□□□□□ -0.53
GGA3-218ENST00000584243 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
GGA3-218ENST00000584243 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-218ENST00000584243 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-218ENST00000584243 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-218ENST00000584243 NAIPQ13075 1403 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-218ENST00000584243 OVOS2Q6IE36 1432 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-218ENST00000584243 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-218ENST00000584243 FSTL1Q12841 308 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-218ENST00000584243 ZNF827Q17R98 1081 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-218ENST00000584243 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
GGA3-218ENST00000584243 ATP7BP35670 1465 aa11.73□□□□□ -0.53
GGA3-218ENST00000584243 LMOD2Q6P5Q4 547 aa11.73□□□□□ -0.53
GGA3-218ENST00000584243 STRN4Q9NRL3 753 aa11.72□□□□□ -0.53
GGA3-218ENST00000584243 CUL9Q8IWT3 2517 aa11.72□□□□□ -0.53
GGA3-218ENST00000584243 POLD1P28340 1107 aa11.71□□□□□ -0.53
GGA3-218ENST00000584243 FMN2Q9NZ56 1722 aa11.71□□□□□ -0.54
GGA3-218ENST00000584243 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
GGA3-218ENST00000584243 ADRA2BP18089 450 aa11.7□□□□□ -0.54
GGA3-218ENST00000584243 SSH2Q76I76 1423 aa11.69□□□□□ -0.54
GGA3-218ENST00000584243 PSME1Q06323 249 aa11.69□□□□□ -0.54
GGA3-218ENST00000584243 NRXN1Q9ULB1 1477 aa11.69□□□□□ -0.54
GGA3-218ENST00000584243 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
GGA3-218ENST00000584243 ALS2Q96Q42 1657 aa11.68□□□□□ -0.54
GGA3-218ENST00000584243 CCDC85CA6NKD9 419 aa11.68□□□□□ -0.54
GGA3-218ENST00000584243 CHRNA2Q15822 529 aa11.68□□□□□ -0.54
GGA3-218ENST00000584243 PRDM11Q9NQV5 511 aa11.68□□□□□ -0.54
GGA3-218ENST00000584243 LRRC37A3O60309 1634 aa11.68□□□□□ -0.54
GGA3-218ENST00000584243 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
GGA3-218ENST00000584243 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
GGA3-218ENST00000584243 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
GGA3-218ENST00000584243 E9PCH4 1651 aa11.67□□□□□ -0.54
GGA3-218ENST00000584243 KIAA0232Q92628 1395 aa11.67□□□□□ -0.54
GGA3-218ENST00000584243 TCP11L2Q8N4U5 519 aa11.66□□□□□ -0.54
GGA3-218ENST00000584243 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa11.66□□□□□ -0.54
GGA3-218ENST00000584243 SLC16A10Q8TF71 515 aa11.66□□□□□ -0.54
GGA3-218ENST00000584243 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
GGA3-218ENST00000584243 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa11.65□□□□□ -0.54
GGA3-218ENST00000584243 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
GGA3-218ENST00000584243 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 644.1 ms