RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576761.5

PITPNA-211, Transcript of phosphatidylinositol transfer protein alpha, humanhuman

TSL 4

Gene PITPNA, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNA-211ENST00000576761 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa37.03■■■■□ 3.52
PITPNA-211ENST00000576761 PLEKHG3A1L390 1219 aa37.02■■■■□ 3.52
PITPNA-211ENST00000576761 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
PITPNA-211ENST00000576761 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
PITPNA-211ENST00000576761 RALGAPBQ86X10 1494 aa37.01■■■■□ 3.52
PITPNA-211ENST00000576761 ACEP12821 1306 aa37.01■■■■□ 3.52
PITPNA-211ENST00000576761 ATAD2Q6PL18 1390 aa37.01■■■■□ 3.51
PITPNA-211ENST00000576761 GLI3P10071 1580 aa37■■■■□ 3.51
PITPNA-211ENST00000576761 FAM83GA6ND36 823 aa36.99■■■■□ 3.51
PITPNA-211ENST00000576761 NBPF8Q3BBV2 869 aa36.98■■■■□ 3.51
PITPNA-211ENST00000576761 VPS72Q15906 364 aa36.97■■■■□ 3.51
PITPNA-211ENST00000576761 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
PITPNA-211ENST00000576761 CABP2Q9NPB3 220 aa36.96■■■■□ 3.51
PITPNA-211ENST00000576761 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa36.95■■■■□ 3.51
PITPNA-211ENST00000576761 NRAPQ86VF7 1730 aa36.93■■■■□ 3.5
PITPNA-211ENST00000576761 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
PITPNA-211ENST00000576761 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
PITPNA-211ENST00000576761 TONSLQ96HA7 1378 aa36.9■■■■□ 3.5
PITPNA-211ENST00000576761 EVC2Q86UK5 1308 aa36.89■■■■□ 3.5
PITPNA-211ENST00000576761 BTG4Q9NY30 223 aa36.89■■■■□ 3.5
PITPNA-211ENST00000576761 PRDM11Q9NQV5 511 aa36.85■■■■□ 3.49
PITPNA-211ENST00000576761 BRWD3Q6RI45 1802 aa36.85■■■■□ 3.49
PITPNA-211ENST00000576761 NUTM2GQ5VZR2 741 aa36.84■■■■□ 3.49
PITPNA-211ENST00000576761 ABTB2Q8N961 1025 aa36.84■■■■□ 3.49
PITPNA-211ENST00000576761 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP36.83■■■■□ 3.49
PITPNA-211ENST00000576761 CABP1Q9NZU7 370 aa36.82■■■■□ 3.48
PITPNA-211ENST00000576761 KIAA0232Q92628 1395 aa36.8■■■■□ 3.48
PITPNA-211ENST00000576761 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
PITPNA-211ENST00000576761 SEPT12Q8IYM1 358 aa36.8■■■■□ 3.48
PITPNA-211ENST00000576761 EP400Q96L91 3159 aa36.79■■■■□ 3.48
PITPNA-211ENST00000576761 CARD11Q9BXL7 1154 aa36.78■■■■□ 3.48
PITPNA-211ENST00000576761 USP6P35125 1406 aa36.76■■■■□ 3.48
PITPNA-211ENST00000576761 NRKQ7Z2Y5 1582 aa36.76■■■■□ 3.48
PITPNA-211ENST00000576761 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
PITPNA-211ENST00000576761 NLRP13Q86W25 1043 aa36.75■■■■□ 3.47
PITPNA-211ENST00000576761 CCDC125Q86Z20 511 aa36.75■■■■□ 3.47
PITPNA-211ENST00000576761 USP19O94966 1318 aa36.74■■■■□ 3.47
PITPNA-211ENST00000576761 CHRNA2Q15822 529 aa36.73■■■■□ 3.47
PITPNA-211ENST00000576761 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa36.73■■■■□ 3.47
PITPNA-211ENST00000576761 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa36.71■■■■□ 3.47
PITPNA-211ENST00000576761 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa36.71■■■■□ 3.47
PITPNA-211ENST00000576761 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
PITPNA-211ENST00000576761 A0A0G2JS52 829 aa36.69■■■■□ 3.46
PITPNA-211ENST00000576761 MYT1Q01538 1121 aa36.69■■■■□ 3.46
PITPNA-211ENST00000576761 AKAP12Q02952 1782 aa36.68■■■■□ 3.46
PITPNA-211ENST00000576761 KRT27Q7Z3Y8 459 aa36.68■■■■□ 3.46
PITPNA-211ENST00000576761 CPDO75976 1380 aa36.67■■■■□ 3.46
PITPNA-211ENST00000576761 GCP02774 474 aa36.66■■■■□ 3.46
PITPNA-211ENST00000576761 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
PITPNA-211ENST00000576761 SSH2Q76I76 1423 aa36.66■■■■□ 3.46
PITPNA-211ENST00000576761 NLRP6P59044 892 aa36.64■■■■□ 3.46
PITPNA-211ENST00000576761 STRN4Q9NRL3 753 aa36.64■■■■□ 3.46
PITPNA-211ENST00000576761 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP36.63■■■■□ 3.45
PITPNA-211ENST00000576761 PIK3C2AO00443 1686 aa36.63■■■■□ 3.45
PITPNA-211ENST00000576761 LMO7Q8WWI1 1683 aa36.62■■■■□ 3.45
PITPNA-211ENST00000576761 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa36.6■■■■□ 3.45
PITPNA-211ENST00000576761 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa36.6■■■■□ 3.45
PITPNA-211ENST00000576761 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa36.6■■■■□ 3.45
PITPNA-211ENST00000576761 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
PITPNA-211ENST00000576761 SLIT3O75094 1523 aa36.59■■■■□ 3.45
PITPNA-211ENST00000576761 EVA1CP58658 441 aa36.59■■■■□ 3.45
PITPNA-211ENST00000576761 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa36.57■■■■□ 3.44
PITPNA-211ENST00000576761 TTC21AQ8NDW8 1320 aa36.55■■■■□ 3.44
PITPNA-211ENST00000576761 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
PITPNA-211ENST00000576761 MON2Q7Z3U7 1717 aa36.54■■■■□ 3.44
PITPNA-211ENST00000576761 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
PITPNA-211ENST00000576761 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
PITPNA-211ENST00000576761 USP35Q9P2H5 1018 aa36.49■■■■□ 3.43
PITPNA-211ENST00000576761 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
PITPNA-211ENST00000576761 ZBTB7CA1YPR0 619 aa36.48■■■■□ 3.43
PITPNA-211ENST00000576761 AATKQ6ZMQ8 1374 aa36.48■■■■□ 3.43
PITPNA-211ENST00000576761 BARGINQ6ZT62 677 aa36.47■■■■□ 3.43
PITPNA-211ENST00000576761 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
PITPNA-211ENST00000576761 KCNH5Q8NCM2 988 aa36.46■■■■□ 3.43
PITPNA-211ENST00000576761 TMC1Q8TDI8 760 aa36.46■■■■□ 3.43
PITPNA-211ENST00000576761 CD163L1Q9NR16 1453 aa36.44■■■■□ 3.42
PITPNA-211ENST00000576761 ZRANB1Q9UGI0 708 aa36.44■■■■□ 3.42
PITPNA-211ENST00000576761 COL18A1P39060 1754 aa36.44■■■■□ 3.42
PITPNA-211ENST00000576761 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa36.43■■■■□ 3.42
PITPNA-211ENST00000576761 SLC24A1O60721 1099 aa36.43■■■■□ 3.42
PITPNA-211ENST00000576761 TCP11L2Q8N4U5 519 aa36.43■■■■□ 3.42
PITPNA-211ENST00000576761 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
PITPNA-211ENST00000576761 DEFB132Q7Z7B7 95 aa36.42■■■■□ 3.42
PITPNA-211ENST00000576761 TESK2Q96S53 571 aa36.42■■■■□ 3.42
PITPNA-211ENST00000576761 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
PITPNA-211ENST00000576761 RGPD1P0DJD0 1748 aa36.42■■■■□ 3.42
PITPNA-211ENST00000576761 FAM182BQ5T319 152 aa36.41■■■■□ 3.42
PITPNA-211ENST00000576761 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa36.4■■■■□ 3.42
PITPNA-211ENST00000576761 CRB1P82279 1406 aa36.4■■■■□ 3.42
PITPNA-211ENST00000576761 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP36.39■■■■□ 3.42
PITPNA-211ENST00000576761 USP54Q70EL1 1684 aa36.39■■■■□ 3.42
PITPNA-211ENST00000576761 ARHGEF25Q86VW2 580 aa36.38■■■■□ 3.41
PITPNA-211ENST00000576761 TERF2IPQ9NYB0 399 aa36.38■■■■□ 3.41
PITPNA-211ENST00000576761 CLSPNQ9HAW4 1339 aa36.37■■■■□ 3.41
PITPNA-211ENST00000576761 NFAT5O94916 1531 aa36.36■■■■□ 3.41
PITPNA-211ENST00000576761 SOX12O15370 315 aa36.36■■■■□ 3.41
PITPNA-211ENST00000576761 USP31Q70CQ4 1352 aa36.36■■■■□ 3.41
PITPNA-211ENST00000576761 BAG6P46379 1132 aa36.35■■■■□ 3.41
PITPNA-211ENST00000576761 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.35■■■■□ 3.41
PITPNA-211ENST00000576761 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa36.35■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.9 ms