RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572936.5

MPDU1-211, Transcript of mannose-P-dolichol utilization defect 1, humanhuman

TSL 5

Gene MPDU1, Length 1,102 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPDU1-211ENST00000572936 CDK19Q9BWU1 502 aa26■■□□□ 1.75
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MPDU1-211ENST00000572936 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
MPDU1-211ENST00000572936 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
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MPDU1-211ENST00000572936 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.96■■□□□ 1.75
MPDU1-211ENST00000572936 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.95■■□□□ 1.74
MPDU1-211ENST00000572936 GLI3P10071 1580 aa25.95■■□□□ 1.74
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MPDU1-211ENST00000572936 MYT1Q01538 1121 aa25.94■■□□□ 1.74
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MPDU1-211ENST00000572936 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.92■■□□□ 1.74
MPDU1-211ENST00000572936 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa25.91■■□□□ 1.74
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MPDU1-211ENST00000572936 EVC2Q86UK5 1308 aa25.88■■□□□ 1.73
MPDU1-211ENST00000572936 PLCH1Q4KWH8 1693 aa25.87■■□□□ 1.73
MPDU1-211ENST00000572936 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
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MPDU1-211ENST00000572936 ACEP12821 1306 aa25.84■■□□□ 1.73
MPDU1-211ENST00000572936 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa25.83■■□□□ 1.73
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MPDU1-211ENST00000572936 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa25.79■■□□□ 1.72
MPDU1-211ENST00000572936 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa25.79■■□□□ 1.72
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MPDU1-211ENST00000572936 KIAA0232Q92628 1395 aa25.78■■□□□ 1.72
MPDU1-211ENST00000572936 CHRNA2Q15822 529 aa25.77■■□□□ 1.72
MPDU1-211ENST00000572936 AKAP12Q02952 1782 aa25.77■■□□□ 1.72
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MPDU1-211ENST00000572936 EVA1CP58658 441 aa25.74■■□□□ 1.71
MPDU1-211ENST00000572936 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
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MPDU1-211ENST00000572936 USP47Q96K76 1375 aa25.68■■□□□ 1.7
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MPDU1-211ENST00000572936 TESK2Q96S53 571 aa25.66■■□□□ 1.7
MPDU1-211ENST00000572936 SSH2Q76I76 1423 aa25.65■■□□□ 1.7
MPDU1-211ENST00000572936 SLC24A1O60721 1099 aa25.65■■□□□ 1.7
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MPDU1-211ENST00000572936 NLRP6P59044 892 aa25.62■■□□□ 1.69
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MPDU1-211ENST00000572936 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.57■■□□□ 1.68
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MPDU1-211ENST00000572936 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
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MPDU1-211ENST00000572936 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.54■■□□□ 1.68
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MPDU1-211ENST00000572936 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
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MPDU1-211ENST00000572936 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.51■■□□□ 1.67
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