RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572078.1

SPNS3-202, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS3, Length 463 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-202ENST00000572078 LRP5O75197 1615 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS3-202ENST00000572078 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS3-202ENST00000572078 GPRASP1Q5JY77 1395 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS3-202ENST00000572078 FAM182BQ5T319 152 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS3-202ENST00000572078 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SPNS3-202ENST00000572078 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SPNS3-202ENST00000572078 ITSN1Q15811 1721 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS3-202ENST00000572078 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SPNS3-202ENST00000572078 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS3-202ENST00000572078 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS3-202ENST00000572078 A0A0G2JS52 829 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS3-202ENST00000572078 MYT1Q01538 1121 aa20.11■□□□□ 0.81
SPNS3-202ENST00000572078 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SPNS3-202ENST00000572078 RGPD1P0DJD0 1748 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS3-202ENST00000572078 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa20.1■□□□□ 0.81
SPNS3-202ENST00000572078 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SPNS3-202ENST00000572078 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SPNS3-202ENST00000572078 KIAA0232Q92628 1395 aa20.08■□□□□ 0.8
SPNS3-202ENST00000572078 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SPNS3-202ENST00000572078 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SPNS3-202ENST00000572078 PRDM11Q9NQV5 511 aa20.06■□□□□ 0.8
SPNS3-202ENST00000572078 BAG6P46379 1132 aa20.05■□□□□ 0.8
SPNS3-202ENST00000572078 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SPNS3-202ENST00000572078 CHRNA2Q15822 529 aa20.05■□□□□ 0.8
SPNS3-202ENST00000572078 NRKQ7Z2Y5 1582 aa20.04■□□□□ 0.8
SPNS3-202ENST00000572078 HRCP23327 699 aa20.03■□□□□ 0.8
SPNS3-202ENST00000572078 NUTM2GQ5VZR2 741 aa20.03■□□□□ 0.8
SPNS3-202ENST00000572078 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa20.02■□□□□ 0.8
SPNS3-202ENST00000572078 DISP2A7MBM2 1401 aa20.02■□□□□ 0.8
SPNS3-202ENST00000572078 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
SPNS3-202ENST00000572078 CDK19Q9BWU1 502 aa20.01■□□□□ 0.79
SPNS3-202ENST00000572078 LMO7Q8WWI1 1683 aa20■□□□□ 0.79
SPNS3-202ENST00000572078 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20■□□□□ 0.79
SPNS3-202ENST00000572078 ACEP12821 1306 aa20■□□□□ 0.79
SPNS3-202ENST00000572078 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SPNS3-202ENST00000572078 STAC3Q96MF2 364 aa19.99■□□□□ 0.79
SPNS3-202ENST00000572078 STRN4Q9NRL3 753 aa19.99■□□□□ 0.79
SPNS3-202ENST00000572078 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa19.99■□□□□ 0.79
SPNS3-202ENST00000572078 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
SPNS3-202ENST00000572078 SSH2Q76I76 1423 aa19.97■□□□□ 0.79
SPNS3-202ENST00000572078 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
SPNS3-202ENST00000572078 NBPF8Q3BBV2 869 aa19.97■□□□□ 0.79
SPNS3-202ENST00000572078 NBPF1Q3BBV0 1214 aa19.96■□□□□ 0.79
SPNS3-202ENST00000572078 PLEKHG3A1L390 1219 aa19.95■□□□□ 0.78
SPNS3-202ENST00000572078 CAMKK2Q96RR4 588 aa19.95■□□□□ 0.78
SPNS3-202ENST00000572078 USP35Q9P2H5 1018 aa19.95■□□□□ 0.78
SPNS3-202ENST00000572078 RREB1Q92766 1687 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS3-202ENST00000572078 TRIM37O94972 964 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS3-202ENST00000572078 CCDC61Q9Y6R9 512 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS3-202ENST00000572078 USP19O94966 1318 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS3-202ENST00000572078 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
SPNS3-202ENST00000572078 NUP188Q5SRE5 1749 aa19.93■□□□□ 0.78
SPNS3-202ENST00000572078 CPDO75976 1380 aa19.92■□□□□ 0.78
SPNS3-202ENST00000572078 FAM196AQ6ZSG2 479 aa19.91■□□□□ 0.78
SPNS3-202ENST00000572078 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa19.91■□□□□ 0.78
SPNS3-202ENST00000572078 BARGINQ6ZT62 677 aa19.9■□□□□ 0.78
SPNS3-202ENST00000572078 ABTB2Q8N961 1025 aa19.9■□□□□ 0.78
SPNS3-202ENST00000572078 QRICH2Q9H0J4 1663 aa19.9■□□□□ 0.78
SPNS3-202ENST00000572078 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
SPNS3-202ENST00000572078 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
SPNS3-202ENST00000572078 CABP2Q9NPB3 220 aa19.88■□□□□ 0.77
SPNS3-202ENST00000572078 APBA3O96018 575 aa19.87■□□□□ 0.77
SPNS3-202ENST00000572078 PEAK1Q9H792 1746 aa19.87■□□□□ 0.77
SPNS3-202ENST00000572078 EVA1CP58658 441 aa19.86■□□□□ 0.77
SPNS3-202ENST00000572078 SLIT3O75094 1523 aa19.86■□□□□ 0.77
SPNS3-202ENST00000572078 PIK3C2AO00443 1686 aa19.85■□□□□ 0.77
SPNS3-202ENST00000572078 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
SPNS3-202ENST00000572078 GCP02774 474 aa19.85■□□□□ 0.77
SPNS3-202ENST00000572078 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
SPNS3-202ENST00000572078 TCP11L2Q8N4U5 519 aa19.85■□□□□ 0.77
SPNS3-202ENST00000572078 PARD3Q8TEW0 1356 aa19.84■□□□□ 0.77
SPNS3-202ENST00000572078 LRRC37A3O60309 1634 aa19.84■□□□□ 0.77
SPNS3-202ENST00000572078 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
SPNS3-202ENST00000572078 COL18A1P39060 1754 aa19.84■□□□□ 0.77
SPNS3-202ENST00000572078 USP6P35125 1406 aa19.84■□□□□ 0.77
SPNS3-202ENST00000572078 PDE3BQ13370 1112 aa19.83■□□□□ 0.77
SPNS3-202ENST00000572078 NLRP13Q86W25 1043 aa19.82■□□□□ 0.76
SPNS3-202ENST00000572078 CRB1P82279 1406 aa19.81■□□□□ 0.76
SPNS3-202ENST00000572078 WNK3Q9BYP7 1800 aa19.81■□□□□ 0.76
SPNS3-202ENST00000572078 CABP1Q9NZU7 370 aa19.8■□□□□ 0.76
SPNS3-202ENST00000572078 SBF2Q86WG5 1849 aa19.8■□□□□ 0.76
SPNS3-202ENST00000572078 PCGF6Q9BYE7 350 aa19.79■□□□□ 0.76
SPNS3-202ENST00000572078 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
SPNS3-202ENST00000572078 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS3-202ENST00000572078 ZBTB7CA1YPR0 619 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS3-202ENST00000572078 AATKQ6ZMQ8 1374 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS3-202ENST00000572078 NLRP6P59044 892 aa19.77■□□□□ 0.76
SPNS3-202ENST00000572078 PTF1AQ7RTS3 328 aa19.77■□□□□ 0.76
SPNS3-202ENST00000572078 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
SPNS3-202ENST00000572078 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
SPNS3-202ENST00000572078 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS3-202ENST00000572078 RGPD5Q99666 1765 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS3-202ENST00000572078 AXIN2Q9Y2T1 843 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS3-202ENST00000572078 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS3-202ENST00000572078 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS3-202ENST00000572078 OVOS2Q6IE36 1432 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS3-202ENST00000572078 AKAP12Q02952 1782 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS3-202ENST00000572078 L3MBTL2Q969R5 705 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS3-202ENST00000572078 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
SPNS3-202ENST00000572078 CASZ1Q86V15 1759 aa19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms