RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570051.5

RNPS1-226, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 2

Gene RNPS1, Length 735 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-226	ENST00000570051	USP6	P35125	1406 aa		29.09	■■■□□ 2.25
RNPS1-226	ENST00000570051	AKAP12	Q02952	1782 aa		29.08	■■■□□ 2.25
RNPS1-226	ENST00000570051	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
RNPS1-226	ENST00000570051	SLC24A1	O60721	1099 aa		29.07	■■■□□ 2.24
RNPS1-226	ENST00000570051	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
RNPS1-226	ENST00000570051	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
RNPS1-226	ENST00000570051	NGLY1	Q96IV0	654 aa		29.06	■■■□□ 2.24
RNPS1-226	ENST00000570051	PLEKHG5	O94827	1062 aa		29.05	■■■□□ 2.24
RNPS1-226	ENST00000570051	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
RNPS1-226	ENST00000570051	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
RNPS1-226	ENST00000570051	SSH2	Q76I76	1423 aa		29.03	■■■□□ 2.24
RNPS1-226	ENST00000570051	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
RNPS1-226	ENST00000570051	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		29.02	■■■□□ 2.24
RNPS1-226	ENST00000570051	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
RNPS1-226	ENST00000570051	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		29.01	■■■□□ 2.24
RNPS1-226	ENST00000570051	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
RNPS1-226	ENST00000570051	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		29.01	■■■□□ 2.23
RNPS1-226	ENST00000570051	TMF1	P82094	1093 aa		29	■■■□□ 2.23
RNPS1-226	ENST00000570051	ABTB2	Q8N961	1025 aa		28.99	■■■□□ 2.23
RNPS1-226	ENST00000570051	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		28.98	■■■□□ 2.23
RNPS1-226	ENST00000570051	TMC1	Q8TDI8	760 aa		28.98	■■■□□ 2.23
RNPS1-226	ENST00000570051	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		28.97	■■■□□ 2.23
RNPS1-226	ENST00000570051	USP21	Q9UK80	565 aa		28.97	■■■□□ 2.23
RNPS1-226	ENST00000570051	SLIT2	O94813	1529 aa		28.97	■■■□□ 2.23
RNPS1-226	ENST00000570051	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
RNPS1-226	ENST00000570051	PIK3C2A	O00443	1686 aa		28.96	■■■□□ 2.23
RNPS1-226	ENST00000570051	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		28.96	■■■□□ 2.23
RNPS1-226	ENST00000570051	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		28.96	■■■□□ 2.23
RNPS1-226	ENST00000570051	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		28.96	■■■□□ 2.23
RNPS1-226	ENST00000570051	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.23
RNPS1-226	ENST00000570051	USP19	O94966	1318 aa		28.94	■■■□□ 2.22
RNPS1-226	ENST00000570051	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	28.94	■■■□□ 2.22
RNPS1-226	ENST00000570051	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		28.94	■■■□□ 2.22
RNPS1-226	ENST00000570051	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		28.93	■■■□□ 2.22
RNPS1-226	ENST00000570051	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
RNPS1-226	ENST00000570051		A0A1W2PP64	1363 aa		28.91	■■■□□ 2.22
RNPS1-226	ENST00000570051	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
RNPS1-226	ENST00000570051	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
RNPS1-226	ENST00000570051	NLRP13	Q86W25	1043 aa		28.91	■■■□□ 2.22
RNPS1-226	ENST00000570051	ATRN	O75882	1429 aa		28.91	■■■□□ 2.22
RNPS1-226	ENST00000570051	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		28.91	■■■□□ 2.22
RNPS1-226	ENST00000570051	FAM83G	A6ND36	823 aa		28.9	■■■□□ 2.22
RNPS1-226	ENST00000570051	CDCA8	Q53HL2	280 aa		28.9	■■■□□ 2.22
RNPS1-226	ENST00000570051	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
RNPS1-226	ENST00000570051	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		28.9	■■■□□ 2.22
RNPS1-226	ENST00000570051	RXRB	P28702	533 aa		28.88	■■■□□ 2.21
RNPS1-226	ENST00000570051	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
RNPS1-226	ENST00000570051	SLIT3	O75094	1523 aa		28.88	■■■□□ 2.21
RNPS1-226	ENST00000570051	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
RNPS1-226	ENST00000570051	NLRP6	P59044	892 aa		28.87	■■■□□ 2.21
RNPS1-226	ENST00000570051	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		28.87	■■■□□ 2.21
RNPS1-226	ENST00000570051	KIAA0232	Q92628	1395 aa		28.87	■■■□□ 2.21
RNPS1-226	ENST00000570051	MYOM1	P52179	1685 aa		28.86	■■■□□ 2.21
RNPS1-226	ENST00000570051	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
RNPS1-226	ENST00000570051	NRAP	Q86VF7	1730 aa		28.86	■■■□□ 2.21
RNPS1-226	ENST00000570051	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
RNPS1-226	ENST00000570051	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		28.85	■■■□□ 2.21
RNPS1-226	ENST00000570051	SOCS7	O14512	581 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RNPS1-226	ENST00000570051	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RNPS1-226	ENST00000570051	USP54	Q70EL1	1684 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RNPS1-226	ENST00000570051	GC	P02774	474 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RNPS1-226	ENST00000570051	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
RNPS1-226	ENST00000570051	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	28.83	■■■□□ 2.21
RNPS1-226	ENST00000570051	CPD	O75976	1380 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RNPS1-226	ENST00000570051	USP31	Q70CQ4	1352 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RNPS1-226	ENST00000570051	BTG4	Q9NY30	223 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RNPS1-226	ENST00000570051	NME9	Q86XW9	330 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RNPS1-226	ENST00000570051	RGS12	O14924	1447 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RNPS1-226	ENST00000570051	CHRNA2	Q15822	529 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RNPS1-226	ENST00000570051	GLI3	P10071	1580 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RNPS1-226	ENST00000570051	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		28.77	■■■□□ 2.2
RNPS1-226	ENST00000570051	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
RNPS1-226	ENST00000570051	VPS72	Q15906	364 aa		28.76	■■■□□ 2.19
RNPS1-226	ENST00000570051	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		28.76	■■■□□ 2.19
RNPS1-226	ENST00000570051	NFAT5	O94916	1531 aa		28.75	■■■□□ 2.19
RNPS1-226	ENST00000570051	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		28.73	■■■□□ 2.19
RNPS1-226	ENST00000570051	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		28.73	■■■□□ 2.19
RNPS1-226	ENST00000570051	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		28.73	■■■□□ 2.19
RNPS1-226	ENST00000570051	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		28.73	■■■□□ 2.19
RNPS1-226	ENST00000570051	COL18A1	P39060	1754 aa		28.7	■■■□□ 2.18
RNPS1-226	ENST00000570051	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		28.69	■■■□□ 2.18
RNPS1-226	ENST00000570051	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		28.69	■■■□□ 2.18
RNPS1-226	ENST00000570051	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
RNPS1-226	ENST00000570051	SOX12	O15370	315 aa		28.68	■■■□□ 2.18
RNPS1-226	ENST00000570051	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	28.68	■■■□□ 2.18
RNPS1-226	ENST00000570051	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		28.67	■■■□□ 2.18
RNPS1-226	ENST00000570051	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		28.66	■■■□□ 2.18
RNPS1-226	ENST00000570051	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		28.66	■■■□□ 2.18
RNPS1-226	ENST00000570051	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		28.65	■■■□□ 2.18
RNPS1-226	ENST00000570051	STRN4	Q9NRL3	753 aa		28.65	■■■□□ 2.18
RNPS1-226	ENST00000570051	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		28.65	■■■□□ 2.18
RNPS1-226	ENST00000570051	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		28.65	■■■□□ 2.18
RNPS1-226	ENST00000570051	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		28.65	■■■□□ 2.18
RNPS1-226	ENST00000570051	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	28.65	■■■□□ 2.18
RNPS1-226	ENST00000570051	ABCC6	O95255	1503 aa		28.63	■■■□□ 2.17
RNPS1-226	ENST00000570051	LTN1	O94822	1766 aa		28.62	■■■□□ 2.17
RNPS1-226	ENST00000570051	FYB1	O15117	783 aa		28.62	■■■□□ 2.17
RNPS1-226	ENST00000570051	COG3	Q96JB2	828 aa		28.62	■■■□□ 2.17
RNPS1-226	ENST00000570051	RGPD5	Q99666	1765 aa		28.6	■■■□□ 2.17
RNPS1-226	ENST00000570051	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17

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