RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567987.5

INO80E-211, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene INO80E, Length 1,926 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-211ENST00000567987 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.26■■□□□ 1.63
INO80E-211ENST00000567987 PHF8Q9UPP1 1060 aa25.24■■□□□ 1.63
INO80E-211ENST00000567987 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
INO80E-211ENST00000567987 SSH2Q76I76 1423 aa25.23■■□□□ 1.63
INO80E-211ENST00000567987 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.23■■□□□ 1.63
INO80E-211ENST00000567987 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.22■■□□□ 1.63
INO80E-211ENST00000567987 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.22■■□□□ 1.63
INO80E-211ENST00000567987 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
INO80E-211ENST00000567987 COG3Q96JB2 828 aa25.22■■□□□ 1.63
INO80E-211ENST00000567987 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.2■■□□□ 1.62
INO80E-211ENST00000567987 FBLN1P23142 703 aa25.19■■□□□ 1.62
INO80E-211ENST00000567987 CFAP53Q96M91 514 aa25.18■■□□□ 1.62
INO80E-211ENST00000567987 ORAI2Q96SN7 254 aa25.18■■□□□ 1.62
INO80E-211ENST00000567987 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.18■■□□□ 1.62
INO80E-211ENST00000567987 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.18■■□□□ 1.62
INO80E-211ENST00000567987 ATF3P18847 181 aa25.18■■□□□ 1.62
INO80E-211ENST00000567987 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.18■■□□□ 1.62
INO80E-211ENST00000567987 INSRP06213 1382 aa25.17■■□□□ 1.62
INO80E-211ENST00000567987 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
INO80E-211ENST00000567987 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
INO80E-211ENST00000567987 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.15■■□□□ 1.62
INO80E-211ENST00000567987 DCCP43146 1447 aa25.15■■□□□ 1.62
INO80E-211ENST00000567987 SHPRHQ149N8 1683 aa25.15■■□□□ 1.62
INO80E-211ENST00000567987 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.15■■□□□ 1.62
INO80E-211ENST00000567987 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
INO80E-211ENST00000567987 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa25.14■■□□□ 1.61
INO80E-211ENST00000567987 OVOS2Q6IE36 1432 aa25.14■■□□□ 1.61
INO80E-211ENST00000567987 POLKQ9UBT6 870 aa25.14■■□□□ 1.61
INO80E-211ENST00000567987 MSH6P52701 1360 aa25.13■■□□□ 1.61
INO80E-211ENST00000567987 MST1RQ04912 1400 aa25.12■■□□□ 1.61
INO80E-211ENST00000567987 AATKQ6ZMQ8 1374 aa25.12■■□□□ 1.61
INO80E-211ENST00000567987 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
INO80E-211ENST00000567987 PSME1Q06323 249 aa25.12■■□□□ 1.61
INO80E-211ENST00000567987 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.11■■□□□ 1.61
INO80E-211ENST00000567987 PIK3C2AO00443 1686 aa25.11■■□□□ 1.61
INO80E-211ENST00000567987 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
INO80E-211ENST00000567987 FOXO3O43524 673 aa25.1■■□□□ 1.61
INO80E-211ENST00000567987 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.1■■□□□ 1.61
INO80E-211ENST00000567987 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
INO80E-211ENST00000567987 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
INO80E-211ENST00000567987 USP31Q70CQ4 1352 aa25.08■■□□□ 1.61
INO80E-211ENST00000567987 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.08■■□□□ 1.61
INO80E-211ENST00000567987 NLRP6P59044 892 aa25.07■■□□□ 1.6
INO80E-211ENST00000567987 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.07■■□□□ 1.6
INO80E-211ENST00000567987 ABTB2Q8N961 1025 aa25.07■■□□□ 1.6
INO80E-211ENST00000567987 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
INO80E-211ENST00000567987 NUTM2GQ5VZR2 741 aa25.06■■□□□ 1.6
INO80E-211ENST00000567987 KIF1AQ12756 1690 aa25.06■■□□□ 1.6
INO80E-211ENST00000567987 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
INO80E-211ENST00000567987 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
INO80E-211ENST00000567987 SOX12O15370 315 aa25.04■■□□□ 1.6
INO80E-211ENST00000567987 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
INO80E-211ENST00000567987 NUDCQ9Y266 331 aa25.03■■□□□ 1.6
INO80E-211ENST00000567987 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
INO80E-211ENST00000567987 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.02■■□□□ 1.6
INO80E-211ENST00000567987 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
INO80E-211ENST00000567987 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
INO80E-211ENST00000567987 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
INO80E-211ENST00000567987 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25■■□□□ 1.59
INO80E-211ENST00000567987 USP54Q70EL1 1684 aa25■■□□□ 1.59
INO80E-211ENST00000567987 APAF1O14727 1248 aa24.98■■□□□ 1.59
INO80E-211ENST00000567987 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
INO80E-211ENST00000567987 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
INO80E-211ENST00000567987 RUNDC1Q96C34 613 aa24.96■■□□□ 1.59
INO80E-211ENST00000567987 PEAK1Q9H792 1746 aa24.95■■□□□ 1.59
INO80E-211ENST00000567987 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.95■■□□□ 1.58
INO80E-211ENST00000567987 SLAIN2Q9P270 581 aa24.95■■□□□ 1.58
INO80E-211ENST00000567987 IL13P35225 146 aa24.94■■□□□ 1.58
INO80E-211ENST00000567987 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.94■■□□□ 1.58
INO80E-211ENST00000567987 BRINP3Q76B58 766 aa24.92■■□□□ 1.58
INO80E-211ENST00000567987 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.92■■□□□ 1.58
INO80E-211ENST00000567987 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.91■■□□□ 1.58
INO80E-211ENST00000567987 SBNO1A3KN83 1393 aa24.9■■□□□ 1.58
INO80E-211ENST00000567987 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.9■■□□□ 1.58
INO80E-211ENST00000567987 AMPHP49418 695 aa24.89■■□□□ 1.58
INO80E-211ENST00000567987 NEFLP07196 543 aa24.88■■□□□ 1.57
INO80E-211ENST00000567987 PDE3BQ13370 1112 aa24.88■■□□□ 1.57
INO80E-211ENST00000567987 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
INO80E-211ENST00000567987 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
INO80E-211ENST00000567987 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.88■■□□□ 1.57
INO80E-211ENST00000567987 FLT4P35916 1363 aa24.88■■□□□ 1.57
INO80E-211ENST00000567987 PLEKHG5O94827 1062 aa24.88■■□□□ 1.57
INO80E-211ENST00000567987 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.88■■□□□ 1.57
INO80E-211ENST00000567987 ALS2Q96Q42 1657 aa24.88■■□□□ 1.57
INO80E-211ENST00000567987 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.87■■□□□ 1.57
INO80E-211ENST00000567987 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.87■■□□□ 1.57
INO80E-211ENST00000567987 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
INO80E-211ENST00000567987 ZNF521Q96K83 1311 aa24.87■■□□□ 1.57
INO80E-211ENST00000567987 PXDNQ92626 1479 aa24.86■■□□□ 1.57
INO80E-211ENST00000567987 FCHSD2O94868 740 aa24.86■■□□□ 1.57
INO80E-211ENST00000567987 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
INO80E-211ENST00000567987 NFAT5O94916 1531 aa24.86■■□□□ 1.57
INO80E-211ENST00000567987 HMOX1P09601 288 aa24.86■■□□□ 1.57
INO80E-211ENST00000567987 NEUROD2Q15784 382 aa24.86■■□□□ 1.57
INO80E-211ENST00000567987 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.86■■□□□ 1.57
INO80E-211ENST00000567987 FKBP8Q14318 412 aa24.85■■□□□ 1.57
INO80E-211ENST00000567987 NGEFQ8N5V2 710 aa24.85■■□□□ 1.57
INO80E-211ENST00000567987 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.85■■□□□ 1.57
INO80E-211ENST00000567987 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
INO80E-211ENST00000567987 LTN1O94822 1766 aa24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms