RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567017.5

RHOT2-216, Transcript of ras homolog family member T2, human

TSL 5

Gene RHOT2, Length 1,094 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RHOT2-216	ENST00000567017	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		32.99	■■■□□ 2.87
RHOT2-216	ENST00000567017	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	32.98	■■■□□ 2.87
RHOT2-216	ENST00000567017	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		32.98	■■■□□ 2.87
RHOT2-216	ENST00000567017	CCDC125	Q86Z20	511 aa		32.97	■■■□□ 2.87
RHOT2-216	ENST00000567017	ACE	P12821	1306 aa		32.97	■■■□□ 2.87
RHOT2-216	ENST00000567017	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		32.97	■■■□□ 2.87
RHOT2-216	ENST00000567017	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	32.96	■■■□□ 2.87
RHOT2-216	ENST00000567017	NRAP	Q86VF7	1730 aa		32.96	■■■□□ 2.87
RHOT2-216	ENST00000567017	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		32.95	■■■□□ 2.87
RHOT2-216	ENST00000567017	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		32.95	■■■□□ 2.87
RHOT2-216	ENST00000567017	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.86
RHOT2-216	ENST00000567017	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		32.95	■■■□□ 2.86
RHOT2-216	ENST00000567017	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
RHOT2-216	ENST00000567017	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		32.94	■■■□□ 2.86
RHOT2-216	ENST00000567017	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		32.92	■■■□□ 2.86
RHOT2-216	ENST00000567017	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
RHOT2-216	ENST00000567017	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		32.9	■■■□□ 2.86
RHOT2-216	ENST00000567017	NEUROD1	Q13562	356 aa		32.89	■■■□□ 2.86
RHOT2-216	ENST00000567017	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	32.89	■■■□□ 2.86
RHOT2-216	ENST00000567017	CABP2	Q9NPB3	220 aa		32.89	■■■□□ 2.86
RHOT2-216	ENST00000567017	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		32.88	■■■□□ 2.85
RHOT2-216	ENST00000567017	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
RHOT2-216	ENST00000567017	KIAA0232	Q92628	1395 aa		32.87	■■■□□ 2.85
RHOT2-216	ENST00000567017		A0A0G2JS52	829 aa		32.86	■■■□□ 2.85
RHOT2-216	ENST00000567017	MYT1	Q01538	1121 aa		32.86	■■■□□ 2.85
RHOT2-216	ENST00000567017	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		32.85	■■■□□ 2.85
RHOT2-216	ENST00000567017	CHRNA2	Q15822	529 aa		32.85	■■■□□ 2.85
RHOT2-216	ENST00000567017	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
RHOT2-216	ENST00000567017	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		32.84	■■■□□ 2.85
RHOT2-216	ENST00000567017	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		32.84	■■■□□ 2.85
RHOT2-216	ENST00000567017	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
RHOT2-216	ENST00000567017	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		32.82	■■■□□ 2.84
RHOT2-216	ENST00000567017	ABTB2	Q8N961	1025 aa		32.82	■■■□□ 2.84
RHOT2-216	ENST00000567017	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		32.8	■■■□□ 2.84
RHOT2-216	ENST00000567017	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		32.8	■■■□□ 2.84
RHOT2-216	ENST00000567017	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		32.8	■■■□□ 2.84
RHOT2-216	ENST00000567017	CABP1	Q9NZU7	370 aa		32.77	■■■□□ 2.84
RHOT2-216	ENST00000567017	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
RHOT2-216	ENST00000567017	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
RHOT2-216	ENST00000567017	STRN4	Q9NRL3	753 aa		32.76	■■■□□ 2.83
RHOT2-216	ENST00000567017	USP19	O94966	1318 aa		32.75	■■■□□ 2.83
RHOT2-216	ENST00000567017	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		32.75	■■■□□ 2.83
RHOT2-216	ENST00000567017	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		32.74	■■■□□ 2.83
RHOT2-216	ENST00000567017	NLRP13	Q86W25	1043 aa		32.72	■■■□□ 2.83
RHOT2-216	ENST00000567017	EVC2	Q86UK5	1308 aa		32.72	■■■□□ 2.83
RHOT2-216	ENST00000567017	FAM182B	Q5T319	152 aa		32.71	■■■□□ 2.83
RHOT2-216	ENST00000567017	USP6	P35125	1406 aa		32.7	■■■□□ 2.83
RHOT2-216	ENST00000567017	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		32.7	■■■□□ 2.83
RHOT2-216	ENST00000567017	CPD	O75976	1380 aa		32.7	■■■□□ 2.82
RHOT2-216	ENST00000567017	GC	P02774	474 aa		32.69	■■■□□ 2.82
RHOT2-216	ENST00000567017	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
RHOT2-216	ENST00000567017	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		32.68	■■■□□ 2.82
RHOT2-216	ENST00000567017	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		32.67	■■■□□ 2.82
RHOT2-216	ENST00000567017	EVA1C	P58658	441 aa		32.67	■■■□□ 2.82
RHOT2-216	ENST00000567017	SSH2	Q76I76	1423 aa		32.67	■■■□□ 2.82
RHOT2-216	ENST00000567017	USP35	Q9P2H5	1018 aa		32.66	■■■□□ 2.82
RHOT2-216	ENST00000567017	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		32.63	■■■□□ 2.81
RHOT2-216	ENST00000567017	NLRP6	P59044	892 aa		32.63	■■■□□ 2.81
RHOT2-216	ENST00000567017	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
RHOT2-216	ENST00000567017	BAG6	P46379	1132 aa		32.61	■■■□□ 2.81
RHOT2-216	ENST00000567017	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		32.58	■■■□□ 2.81
RHOT2-216	ENST00000567017	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		32.57	■■■□□ 2.8
RHOT2-216	ENST00000567017	SLIT3	O75094	1523 aa		32.56	■■■□□ 2.8
RHOT2-216	ENST00000567017	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
RHOT2-216	ENST00000567017	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		32.55	■■■□□ 2.8
RHOT2-216	ENST00000567017	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
RHOT2-216	ENST00000567017	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		32.55	■■■□□ 2.8
RHOT2-216	ENST00000567017	PIK3C2A	O00443	1686 aa		32.55	■■■□□ 2.8
RHOT2-216	ENST00000567017	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
RHOT2-216	ENST00000567017	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		32.53	■■■□□ 2.8
RHOT2-216	ENST00000567017	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		32.52	■■■□□ 2.8
RHOT2-216	ENST00000567017	TONSL	Q96HA7	1378 aa		32.52	■■■□□ 2.8
RHOT2-216	ENST00000567017	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		32.51	■■■□□ 2.79
RHOT2-216	ENST00000567017	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		32.51	■■■□□ 2.79
RHOT2-216	ENST00000567017	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
RHOT2-216	ENST00000567017	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		32.49	■■■□□ 2.79
RHOT2-216	ENST00000567017	TRIM37	O94972	964 aa		32.49	■■■□□ 2.79
RHOT2-216	ENST00000567017	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
RHOT2-216	ENST00000567017	AKAP12	Q02952	1782 aa		32.48	■■■□□ 2.79
RHOT2-216	ENST00000567017	PDE3B	Q13370	1112 aa		32.48	■■■□□ 2.79
RHOT2-216	ENST00000567017	DISP2	A7MBM2	1401 aa		32.47	■■■□□ 2.79
RHOT2-216	ENST00000567017	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
RHOT2-216	ENST00000567017	CRB1	P82279	1406 aa		32.46	■■■□□ 2.79
RHOT2-216	ENST00000567017	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		32.46	■■■□□ 2.79
RHOT2-216	ENST00000567017	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
RHOT2-216	ENST00000567017	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.79
RHOT2-216	ENST00000567017	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		32.45	■■■□□ 2.79
RHOT2-216	ENST00000567017	SOX12	O15370	315 aa		32.43	■■■□□ 2.78
RHOT2-216	ENST00000567017	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
RHOT2-216	ENST00000567017	COL18A1	P39060	1754 aa		32.42	■■■□□ 2.78
RHOT2-216	ENST00000567017	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		32.42	■■■□□ 2.78
RHOT2-216	ENST00000567017	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		32.42	■■■□□ 2.78
RHOT2-216	ENST00000567017	APBA3	O96018	575 aa		32.39	■■■□□ 2.78
RHOT2-216	ENST00000567017	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
RHOT2-216	ENST00000567017	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		32.39	■■■□□ 2.78
RHOT2-216	ENST00000567017	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		32.39	■■■□□ 2.78
RHOT2-216	ENST00000567017	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		32.38	■■■□□ 2.77
RHOT2-216	ENST00000567017	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
RHOT2-216	ENST00000567017	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		32.37	■■■□□ 2.77
RHOT2-216	ENST00000567017	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	32.37	■■■□□ 2.77

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