RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-208ENST00000564966 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
PPP4C-208ENST00000564966 A0A0G2JS52 829 aa36.44■■■■□ 3.42
PPP4C-208ENST00000564966 MYT1Q01538 1121 aa36.44■■■■□ 3.42
PPP4C-208ENST00000564966 BTG4Q9NY30 223 aa36.44■■■■□ 3.42
PPP4C-208ENST00000564966 CCDC61Q9Y6R9 512 aa36.44■■■■□ 3.42
PPP4C-208ENST00000564966 ACEP12821 1306 aa36.41■■■■□ 3.42
PPP4C-208ENST00000564966 SEPT12Q8IYM1 358 aa36.41■■■■□ 3.42
PPP4C-208ENST00000564966 NUTM2GQ5VZR2 741 aa36.4■■■■□ 3.42
PPP4C-208ENST00000564966 PRDM11Q9NQV5 511 aa36.38■■■■□ 3.41
PPP4C-208ENST00000564966 NBPF8Q3BBV2 869 aa36.37■■■■□ 3.41
PPP4C-208ENST00000564966 CABP2Q9NPB3 220 aa36.37■■■■□ 3.41
PPP4C-208ENST00000564966 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
PPP4C-208ENST00000564966 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa36.36■■■■□ 3.41
PPP4C-208ENST00000564966 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
PPP4C-208ENST00000564966 QRICH2Q9H0J4 1663 aa36.34■■■■□ 3.41
PPP4C-208ENST00000564966 PLEKHG3A1L390 1219 aa36.33■■■■□ 3.41
PPP4C-208ENST00000564966 CCDC125Q86Z20 511 aa36.33■■■■□ 3.41
PPP4C-208ENST00000564966 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa36.33■■■■□ 3.41
PPP4C-208ENST00000564966 BRWD3Q6RI45 1802 aa36.31■■■■□ 3.4
PPP4C-208ENST00000564966 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
PPP4C-208ENST00000564966 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
PPP4C-208ENST00000564966 ABTB2Q8N961 1025 aa36.3■■■■□ 3.4
PPP4C-208ENST00000564966 NRAPQ86VF7 1730 aa36.3■■■■□ 3.4
PPP4C-208ENST00000564966 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa36.3■■■■□ 3.4
PPP4C-208ENST00000564966 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
PPP4C-208ENST00000564966 KIAA0232Q92628 1395 aa36.28■■■■□ 3.4
PPP4C-208ENST00000564966 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa36.28■■■■□ 3.4
PPP4C-208ENST00000564966 CHRNA2Q15822 529 aa36.28■■■■□ 3.4
PPP4C-208ENST00000564966 KRT27Q7Z3Y8 459 aa36.27■■■■□ 3.4
PPP4C-208ENST00000564966 EP400Q96L91 3159 aa36.27■■■■□ 3.4
PPP4C-208ENST00000564966 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
PPP4C-208ENST00000564966 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
PPP4C-208ENST00000564966 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
PPP4C-208ENST00000564966 STRN4Q9NRL3 753 aa36.24■■■■□ 3.39
PPP4C-208ENST00000564966 CABP1Q9NZU7 370 aa36.22■■■■□ 3.39
PPP4C-208ENST00000564966 EVC2Q86UK5 1308 aa36.22■■■■□ 3.39
PPP4C-208ENST00000564966 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
PPP4C-208ENST00000564966 ZRANB1Q9UGI0 708 aa36.2■■■■□ 3.39
PPP4C-208ENST00000564966 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa36.19■■■■□ 3.38
PPP4C-208ENST00000564966 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa36.19■■■■□ 3.38
PPP4C-208ENST00000564966 EVA1CP58658 441 aa36.17■■■■□ 3.38
PPP4C-208ENST00000564966 NLRP13Q86W25 1043 aa36.17■■■■□ 3.38
PPP4C-208ENST00000564966 ZBTB7CA1YPR0 619 aa36.14■■■■□ 3.38
PPP4C-208ENST00000564966 USP35Q9P2H5 1018 aa36.13■■■■□ 3.37
PPP4C-208ENST00000564966 NRKQ7Z2Y5 1582 aa36.12■■■■□ 3.37
PPP4C-208ENST00000564966 DEFB132Q7Z7B7 95 aa36.12■■■■□ 3.37
PPP4C-208ENST00000564966 TONSLQ96HA7 1378 aa36.12■■■■□ 3.37
PPP4C-208ENST00000564966 NLRP6P59044 892 aa36.09■■■■□ 3.37
PPP4C-208ENST00000564966 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
PPP4C-208ENST00000564966 USP19O94966 1318 aa36.08■■■■□ 3.37
PPP4C-208ENST00000564966 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa36.08■■■■□ 3.37
PPP4C-208ENST00000564966 USP6P35125 1406 aa36.08■■■■□ 3.37
PPP4C-208ENST00000564966 GCP02774 474 aa36.08■■■■□ 3.37
PPP4C-208ENST00000564966 FAM182BQ5T319 152 aa36.08■■■■□ 3.37
PPP4C-208ENST00000564966 CARD11Q9BXL7 1154 aa36.08■■■■□ 3.37
PPP4C-208ENST00000564966 CPDO75976 1380 aa36.03■■■■□ 3.36
PPP4C-208ENST00000564966 SSH2Q76I76 1423 aa36.03■■■■□ 3.36
PPP4C-208ENST00000564966 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
PPP4C-208ENST00000564966 BAG6P46379 1132 aa36.01■■■■□ 3.36
PPP4C-208ENST00000564966 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.36
PPP4C-208ENST00000564966 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa36■■■■□ 3.35
PPP4C-208ENST00000564966 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa36■■■■□ 3.35
PPP4C-208ENST00000564966 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
PPP4C-208ENST00000564966 SOX12O15370 315 aa35.95■■■■□ 3.35
PPP4C-208ENST00000564966 LMO7Q8WWI1 1683 aa35.94■■■■□ 3.34
PPP4C-208ENST00000564966 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa35.94■■■■□ 3.34
PPP4C-208ENST00000564966 PDE3BQ13370 1112 aa35.94■■■■□ 3.34
PPP4C-208ENST00000564966 TCP11L2Q8N4U5 519 aa35.94■■■■□ 3.34
PPP4C-208ENST00000564966 PIK3C2AO00443 1686 aa35.93■■■■□ 3.34
PPP4C-208ENST00000564966 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
PPP4C-208ENST00000564966 BARGINQ6ZT62 677 aa35.91■■■■□ 3.34
PPP4C-208ENST00000564966 TMC1Q8TDI8 760 aa35.91■■■■□ 3.34
PPP4C-208ENST00000564966 RGPD1P0DJD0 1748 aa35.91■■■■□ 3.34
PPP4C-208ENST00000564966 AKAP12Q02952 1782 aa35.89■■■■□ 3.34
PPP4C-208ENST00000564966 SLIT3O75094 1523 aa35.89■■■■□ 3.34
PPP4C-208ENST00000564966 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
PPP4C-208ENST00000564966 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
PPP4C-208ENST00000564966 FAM196AQ6ZSG2 479 aa35.88■■■■□ 3.33
PPP4C-208ENST00000564966 TTC21AQ8NDW8 1320 aa35.87■■■■□ 3.33
PPP4C-208ENST00000564966 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa35.87■■■■□ 3.33
PPP4C-208ENST00000564966 KCNH5Q8NCM2 988 aa35.86■■■■□ 3.33
PPP4C-208ENST00000564966 AATKQ6ZMQ8 1374 aa35.86■■■■□ 3.33
PPP4C-208ENST00000564966 TRIM37O94972 964 aa35.85■■■■□ 3.33
PPP4C-208ENST00000564966 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP35.85■■■■□ 3.33
PPP4C-208ENST00000564966 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
PPP4C-208ENST00000564966 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa35.84■■■■□ 3.33
PPP4C-208ENST00000564966 CRB1P82279 1406 aa35.83■■■■□ 3.33
PPP4C-208ENST00000564966 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
PPP4C-208ENST00000564966 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
PPP4C-208ENST00000564966 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa35.79■■■■□ 3.32
PPP4C-208ENST00000564966 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
PPP4C-208ENST00000564966 MON2Q7Z3U7 1717 aa35.77■■■■□ 3.32
PPP4C-208ENST00000564966 APBA3O96018 575 aa35.76■■■■□ 3.32
PPP4C-208ENST00000564966 ARHGEF25Q86VW2 580 aa35.76■■■■□ 3.32
PPP4C-208ENST00000564966 AXIN2Q9Y2T1 843 aa35.76■■■■□ 3.32
PPP4C-208ENST00000564966 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.31
PPP4C-208ENST00000564966 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa35.75■■■■□ 3.31
PPP4C-208ENST00000564966 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa35.75■■■■□ 3.31
PPP4C-208ENST00000564966 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
PPP4C-208ENST00000564966 TERF2IPQ9NYB0 399 aa35.73■■■■□ 3.31
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