RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.27■■□□□ 1.8
CTU2-204ENST00000564105 USP6P35125 1406 aa26.26■■□□□ 1.79
CTU2-204ENST00000564105 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CTU2-204ENST00000564105 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CTU2-204ENST00000564105 BRINP3Q76B58 766 aa26.24■■□□□ 1.79
CTU2-204ENST00000564105 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CTU2-204ENST00000564105 FOXO3O43524 673 aa26.23■■□□□ 1.79
CTU2-204ENST00000564105 JCADQ9P266 1359 aa26.21■■□□□ 1.79
CTU2-204ENST00000564105 PSME1Q06323 249 aa26.21■■□□□ 1.79
CTU2-204ENST00000564105 PIK3C2AO00443 1686 aa26.19■■□□□ 1.78
CTU2-204ENST00000564105 SSH2Q76I76 1423 aa26.19■■□□□ 1.78
CTU2-204ENST00000564105 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.19■■□□□ 1.78
CTU2-204ENST00000564105 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.19■■□□□ 1.78
CTU2-204ENST00000564105 NPHP3Q7Z494 1330 aa26.18■■□□□ 1.78
CTU2-204ENST00000564105 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
CTU2-204ENST00000564105 ALS2Q96Q42 1657 aa26.18■■□□□ 1.78
CTU2-204ENST00000564105 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
CTU2-204ENST00000564105 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.17■■□□□ 1.78
CTU2-204ENST00000564105 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
CTU2-204ENST00000564105 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
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CTU2-204ENST00000564105 PXDNQ92626 1479 aa26.16■■□□□ 1.78
CTU2-204ENST00000564105 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
CTU2-204ENST00000564105 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.16■■□□□ 1.78
CTU2-204ENST00000564105 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa26.15■■□□□ 1.78
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CTU2-204ENST00000564105 SHPRHQ149N8 1683 aa26.14■■□□□ 1.78
CTU2-204ENST00000564105 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
CTU2-204ENST00000564105 NSD2O96028 1365 aa26.13■■□□□ 1.77
CTU2-204ENST00000564105 LRP6O75581 1613 aa26.12■■□□□ 1.77
CTU2-204ENST00000564105 FYB1O15117 783 aa26.12■■□□□ 1.77
CTU2-204ENST00000564105 ANP32CO43423 234 aa26.12■■□□□ 1.77
CTU2-204ENST00000564105 POTEAQ6S8J7 498 aa26.12■■□□□ 1.77
CTU2-204ENST00000564105 NME9Q86XW9 330 aa26.11■■□□□ 1.77
CTU2-204ENST00000564105 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.1■■□□□ 1.77
CTU2-204ENST00000564105 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
CTU2-204ENST00000564105 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
CTU2-204ENST00000564105 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.08■■□□□ 1.77
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CTU2-204ENST00000564105 ABTB2Q8N961 1025 aa26.07■■□□□ 1.76
CTU2-204ENST00000564105 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.06■■□□□ 1.76
CTU2-204ENST00000564105 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.06■■□□□ 1.76
CTU2-204ENST00000564105 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.05■■□□□ 1.76
CTU2-204ENST00000564105 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.05■■□□□ 1.76
CTU2-204ENST00000564105 RALBP1Q15311 655 aa26.04■■□□□ 1.76
CTU2-204ENST00000564105 MORC1Q86VD1 984 aa26.04■■□□□ 1.76
CTU2-204ENST00000564105 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.04■■□□□ 1.76
CTU2-204ENST00000564105 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.04■■□□□ 1.76
CTU2-204ENST00000564105 COG3Q96JB2 828 aa26.03■■□□□ 1.76
CTU2-204ENST00000564105 USP31Q70CQ4 1352 aa26.03■■□□□ 1.76
CTU2-204ENST00000564105 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.03■■□□□ 1.76
CTU2-204ENST00000564105 NLRP6P59044 892 aa26.02■■□□□ 1.76
CTU2-204ENST00000564105 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.02■■□□□ 1.76
CTU2-204ENST00000564105 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.02■■□□□ 1.76
CTU2-204ENST00000564105 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
CTU2-204ENST00000564105 LTN1O94822 1766 aa26.02■■□□□ 1.76
CTU2-204ENST00000564105 ABCA3Q99758 1704 aa26■■□□□ 1.75
CTU2-204ENST00000564105 MIER1Q8N108 512 aa26■■□□□ 1.75
CTU2-204ENST00000564105 ARHGEF10O15013 1369 aa25.99■■□□□ 1.75
CTU2-204ENST00000564105 NLRP13Q86W25 1043 aa25.99■■□□□ 1.75
CTU2-204ENST00000564105 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
CTU2-204ENST00000564105 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CTU2-204ENST00000564105 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CTU2-204ENST00000564105 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
CTU2-204ENST00000564105 SLIT3O75094 1523 aa25.95■■□□□ 1.74
CTU2-204ENST00000564105 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CTU2-204ENST00000564105 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CTU2-204ENST00000564105 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CTU2-204ENST00000564105 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CTU2-204ENST00000564105 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.94■■□□□ 1.74
CTU2-204ENST00000564105 PPP2R1AP30153 589 aa25.92■■□□□ 1.74
CTU2-204ENST00000564105 PLEKHG5O94827 1062 aa25.91■■□□□ 1.74
CTU2-204ENST00000564105 USP19O94966 1318 aa25.91■■□□□ 1.74
CTU2-204ENST00000564105 NFAT5O94916 1531 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU2-204ENST00000564105 RGPD5Q99666 1765 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU2-204ENST00000564105 AATKQ6ZMQ8 1374 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU2-204ENST00000564105 SOX12O15370 315 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU2-204ENST00000564105 FBLN1P23142 703 aa25.9■■□□□ 1.74
CTU2-204ENST00000564105 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
CTU2-204ENST00000564105 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU2-204ENST00000564105 PEAK1Q9H792 1746 aa25.87■■□□□ 1.73
CTU2-204ENST00000564105 CABLES1Q8TDN4 633 aa25.86■■□□□ 1.73
CTU2-204ENST00000564105 GCP02774 474 aa25.85■■□□□ 1.73
CTU2-204ENST00000564105 CCER2I3L3R5 266 aa25.84■■□□□ 1.73
CTU2-204ENST00000564105 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
CTU2-204ENST00000564105 MTHFSP49914 203 aa25.83■■□□□ 1.73
CTU2-204ENST00000564105 POLKQ9UBT6 870 aa25.83■■□□□ 1.73
CTU2-204ENST00000564105 AFF2P51816 1311 aa25.83■■□□□ 1.73
CTU2-204ENST00000564105 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
CTU2-204ENST00000564105 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.82■■□□□ 1.72
CTU2-204ENST00000564105 COL18A1P39060 1754 aa25.81■■□□□ 1.72
CTU2-204ENST00000564105 CCDC184Q52MB2 194 aa25.8■■□□□ 1.72
CTU2-204ENST00000564105 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.79■■□□□ 1.72
CTU2-204ENST00000564105 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
CTU2-204ENST00000564105 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
CTU2-204ENST00000564105 C8orf37Q96NL8 207 aa25.79■■□□□ 1.72
CTU2-204ENST00000564105 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
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