RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563645.1

GDE1-202, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 2

Gene GDE1, Length 769 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-202ENST00000563645 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GDE1-202ENST00000563645 SH3BP2P78314 561 aa8.55□□□□□ -1.04
GDE1-202ENST00000563645 CTDSPL2Q05D32 466 aa8.55□□□□□ -1.04
GDE1-202ENST00000563645 CYP4X1Q8N118 509 aa8.55□□□□□ -1.04
GDE1-202ENST00000563645 ZNF511Q8NB15 262 aa8.55□□□□□ -1.04
GDE1-202ENST00000563645 BAP1Q92560 729 aa8.55□□□□□ -1.04
GDE1-202ENST00000563645 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.55□□□□□ -1.04
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GDE1-202ENST00000563645 AP1G2O75843 785 aa8.54□□□□□ -1.04
GDE1-202ENST00000563645 RFC5P40937 340 aa8.54□□□□□ -1.04
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GDE1-202ENST00000563645 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
GDE1-202ENST00000563645 ALDH1A1P00352 501 aa8.45□□□□□ -1.06
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GDE1-202ENST00000563645 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.44□□□□□ -1.06
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GDE1-202ENST00000563645 NR3C2P08235 984 aa8.32□□□□□ -1.08
GDE1-202ENST00000563645 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
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GDE1-202ENST00000563645 ZBBXA8MT70 800 aa8.3□□□□□ -1.08
GDE1-202ENST00000563645 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GDE1-202ENST00000563645 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
GDE1-202ENST00000563645 FBXO45P0C2W1 286 aa8.29□□□□□ -1.08
GDE1-202ENST00000563645 TMEM132AQ24JP5 1023 aa8.29□□□□□ -1.08
GDE1-202ENST00000563645 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
GDE1-202ENST00000563645 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
GDE1-202ENST00000563645 POTECB2RU33 542 aa8.28□□□□□ -1.08
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