RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADAMTS2O95450 1211 aa24.34■■□□□ 1.49
CCNDBP1-204ENST00000563065 CDCA8Q53HL2 280 aa24.34■■□□□ 1.49
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
CCNDBP1-204ENST00000563065 ALS2Q96Q42 1657 aa24.33■■□□□ 1.49
CCNDBP1-204ENST00000563065 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARHGEF10O15013 1369 aa24.33■■□□□ 1.48
CCNDBP1-204ENST00000563065 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
CCNDBP1-204ENST00000563065 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CCNDBP1-204ENST00000563065 ABTB2Q8N961 1025 aa24.32■■□□□ 1.48
CCNDBP1-204ENST00000563065 AKAP12Q02952 1782 aa24.31■■□□□ 1.48
CCNDBP1-204ENST00000563065 SSH2Q76I76 1423 aa24.31■■□□□ 1.48
CCNDBP1-204ENST00000563065 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CCNDBP1-204ENST00000563065 A0A1W2PP64 1363 aa24.3■■□□□ 1.48
CCNDBP1-204ENST00000563065 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.3■■□□□ 1.48
CCNDBP1-204ENST00000563065 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.3■■□□□ 1.48
CCNDBP1-204ENST00000563065 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.29■■□□□ 1.48
CCNDBP1-204ENST00000563065 C8orf37Q96NL8 207 aa24.27■■□□□ 1.48
CCNDBP1-204ENST00000563065 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.27■■□□□ 1.48
CCNDBP1-204ENST00000563065 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CCNDBP1-204ENST00000563065 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CCNDBP1-204ENST00000563065 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.26■■□□□ 1.47
CCNDBP1-204ENST00000563065 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
CCNDBP1-204ENST00000563065 NLRP6P59044 892 aa24.25■■□□□ 1.47
CCNDBP1-204ENST00000563065 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.24■■□□□ 1.47
CCNDBP1-204ENST00000563065 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.23■■□□□ 1.47
CCNDBP1-204ENST00000563065 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.23■■□□□ 1.47
CCNDBP1-204ENST00000563065 NME9Q86XW9 330 aa24.23■■□□□ 1.47
CCNDBP1-204ENST00000563065 MYOM1P52179 1685 aa24.23■■□□□ 1.47
CCNDBP1-204ENST00000563065 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.23■■□□□ 1.47
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
CCNDBP1-204ENST00000563065 NLRP13Q86W25 1043 aa24.22■■□□□ 1.47
CCNDBP1-204ENST00000563065 NGLY1Q96IV0 654 aa24.22■■□□□ 1.47
CCNDBP1-204ENST00000563065 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1-204ENST00000563065 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1-204ENST00000563065 PIK3C2AO00443 1686 aa24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1-204ENST00000563065 ABCA3Q99758 1704 aa24.2■■□□□ 1.46
CCNDBP1-204ENST00000563065 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CCNDBP1-204ENST00000563065 AFF2P51816 1311 aa24.2■■□□□ 1.46
CCNDBP1-204ENST00000563065 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.19■■□□□ 1.46
CCNDBP1-204ENST00000563065 USP19O94966 1318 aa24.18■■□□□ 1.46
CCNDBP1-204ENST00000563065 FAM83GA6ND36 823 aa24.18■■□□□ 1.46
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CCNDBP1-204ENST00000563065 SOX12O15370 315 aa24.16■■□□□ 1.46
CCNDBP1-204ENST00000563065 GCP02774 474 aa24.16■■□□□ 1.46
CCNDBP1-204ENST00000563065 PANK3Q9H999 370 aa24.16■■□□□ 1.46
CCNDBP1-204ENST00000563065 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.16■■□□□ 1.46
CCNDBP1-204ENST00000563065 POTEAQ6S8J7 498 aa24.15■■□□□ 1.46
CCNDBP1-204ENST00000563065 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
CCNDBP1-204ENST00000563065 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCDC7Q96M83 1385 aa24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1-204ENST00000563065 CHRNA2Q15822 529 aa24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1-204ENST00000563065 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1-204ENST00000563065 KIAA0232Q92628 1395 aa24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1-204ENST00000563065 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.12■■□□□ 1.45
CCNDBP1-204ENST00000563065 USP31Q70CQ4 1352 aa24.12■■□□□ 1.45
CCNDBP1-204ENST00000563065 FYB1O15117 783 aa24.12■■□□□ 1.45
CCNDBP1-204ENST00000563065 USP21Q9UK80 565 aa24.12■■□□□ 1.45
CCNDBP1-204ENST00000563065 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.1■■□□□ 1.45
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLIT3O75094 1523 aa24.09■■□□□ 1.45
CCNDBP1-204ENST00000563065 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
CCNDBP1-204ENST00000563065 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.08■■□□□ 1.45
CCNDBP1-204ENST00000563065 FBLN1P23142 703 aa24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1-204ENST00000563065 ILDR2Q71H61 639 aa24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1-204ENST00000563065 BTG4Q9NY30 223 aa24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLIT2O94813 1529 aa24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1-204ENST00000563065 COG3Q96JB2 828 aa24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1-204ENST00000563065 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.06■■□□□ 1.44
CCNDBP1-204ENST00000563065 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.06■■□□□ 1.44
CCNDBP1-204ENST00000563065 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.06■■□□□ 1.44
CCNDBP1-204ENST00000563065 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.05■■□□□ 1.44
CCNDBP1-204ENST00000563065 CPDO75976 1380 aa24.05■■□□□ 1.44
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.03■■□□□ 1.44
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.03■■□□□ 1.44
CCNDBP1-204ENST00000563065 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
CCNDBP1-204ENST00000563065 USP54Q70EL1 1684 aa24.02■■□□□ 1.44
CCNDBP1-204ENST00000563065 NFAT5O94916 1531 aa24.02■■□□□ 1.44
CCNDBP1-204ENST00000563065 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.01■■□□□ 1.43
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
CCNDBP1-204ENST00000563065 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24■■□□□ 1.43
CCNDBP1-204ENST00000563065 STRN4Q9NRL3 753 aa24■■□□□ 1.43
CCNDBP1-204ENST00000563065 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.99■■□□□ 1.43
CCNDBP1-204ENST00000563065 ATRNO75882 1429 aa23.99■■□□□ 1.43
CCNDBP1-204ENST00000563065 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa23.98■■□□□ 1.43
CCNDBP1-204ENST00000563065 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CCNDBP1-204ENST00000563065 RXRBP28702 533 aa23.98■■□□□ 1.43
CCNDBP1-204ENST00000563065 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.98■■□□□ 1.43
CCNDBP1-204ENST00000563065 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.97■■□□□ 1.43
CCNDBP1-204ENST00000563065 NWD2Q9ULI1 1742 aa23.97■■□□□ 1.43
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
CCNDBP1-204ENST00000563065 EVA1CP58658 441 aa23.95■■□□□ 1.42
CCNDBP1-204ENST00000563065 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
CCNDBP1-204ENST00000563065 VPS72Q15906 364 aa23.95■■□□□ 1.42
CCNDBP1-204ENST00000563065 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
CCNDBP1-204ENST00000563065 LMO7Q8WWI1 1683 aa23.95■■□□□ 1.42
CCNDBP1-204ENST00000563065 COL18A1P39060 1754 aa23.95■■□□□ 1.42
CCNDBP1-204ENST00000563065 NRAPQ86VF7 1730 aa23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms