RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560622.5

USP3-AS1-207, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 508 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-207ENST00000560622 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
USP3-AS1-207ENST00000560622 DEFB132Q7Z7B7 95 aa23.76■■□□□ 1.39
USP3-AS1-207ENST00000560622 STAC3Q96MF2 364 aa23.76■■□□□ 1.39
USP3-AS1-207ENST00000560622 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
USP3-AS1-207ENST00000560622 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.75■■□□□ 1.39
USP3-AS1-207ENST00000560622 BTG4Q9NY30 223 aa23.74■■□□□ 1.39
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.74■■□□□ 1.39
USP3-AS1-207ENST00000560622 KRT27Q7Z3Y8 459 aa23.72■■□□□ 1.39
USP3-AS1-207ENST00000560622 RGPD1P0DJD0 1748 aa23.72■■□□□ 1.39
USP3-AS1-207ENST00000560622 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
USP3-AS1-207ENST00000560622 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.7■■□□□ 1.38
USP3-AS1-207ENST00000560622 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
USP3-AS1-207ENST00000560622 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa23.69■■□□□ 1.38
USP3-AS1-207ENST00000560622 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa23.69■■□□□ 1.38
USP3-AS1-207ENST00000560622 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
USP3-AS1-207ENST00000560622 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
USP3-AS1-207ENST00000560622 LMO7Q8WWI1 1683 aa23.69■■□□□ 1.38
USP3-AS1-207ENST00000560622 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
USP3-AS1-207ENST00000560622 LRP5O75197 1615 aa23.67■■□□□ 1.38
USP3-AS1-207ENST00000560622 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.67■■□□□ 1.38
USP3-AS1-207ENST00000560622 CDK19Q9BWU1 502 aa23.67■■□□□ 1.38
USP3-AS1-207ENST00000560622 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.67■■□□□ 1.38
USP3-AS1-207ENST00000560622 KIAA0232Q92628 1395 aa23.65■■□□□ 1.38
USP3-AS1-207ENST00000560622 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
USP3-AS1-207ENST00000560622 ACEP12821 1306 aa23.62■■□□□ 1.37
USP3-AS1-207ENST00000560622 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.62■■□□□ 1.37
USP3-AS1-207ENST00000560622 FAM182BQ5T319 152 aa23.62■■□□□ 1.37
USP3-AS1-207ENST00000560622 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa23.62■■□□□ 1.37
USP3-AS1-207ENST00000560622 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa23.6■■□□□ 1.37
USP3-AS1-207ENST00000560622 CHRNA2Q15822 529 aa23.6■■□□□ 1.37
USP3-AS1-207ENST00000560622 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.6■■□□□ 1.37
USP3-AS1-207ENST00000560622 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.6■■□□□ 1.37
USP3-AS1-207ENST00000560622 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.59■■□□□ 1.37
USP3-AS1-207ENST00000560622 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.59■■□□□ 1.37
USP3-AS1-207ENST00000560622 DISP2A7MBM2 1401 aa23.59■■□□□ 1.37
USP3-AS1-207ENST00000560622 CCDC61Q9Y6R9 512 aa23.58■■□□□ 1.37
USP3-AS1-207ENST00000560622 USP19O94966 1318 aa23.58■■□□□ 1.36
USP3-AS1-207ENST00000560622 COL18A1P39060 1754 aa23.55■■□□□ 1.36
USP3-AS1-207ENST00000560622 RREB1Q92766 1687 aa23.55■■□□□ 1.36
USP3-AS1-207ENST00000560622 A0A0G2JS52 829 aa23.55■■□□□ 1.36
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
USP3-AS1-207ENST00000560622 MYT1Q01538 1121 aa23.55■■□□□ 1.36
USP3-AS1-207ENST00000560622 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
USP3-AS1-207ENST00000560622 SSH2Q76I76 1423 aa23.55■■□□□ 1.36
USP3-AS1-207ENST00000560622 PIK3C2AO00443 1686 aa23.54■■□□□ 1.36
USP3-AS1-207ENST00000560622 CPDO75976 1380 aa23.54■■□□□ 1.36
USP3-AS1-207ENST00000560622 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.54■■□□□ 1.36
USP3-AS1-207ENST00000560622 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
USP3-AS1-207ENST00000560622 AKAP12Q02952 1782 aa23.52■■□□□ 1.36
USP3-AS1-207ENST00000560622 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
USP3-AS1-207ENST00000560622 WNK3Q9BYP7 1800 aa23.52■■□□□ 1.36
USP3-AS1-207ENST00000560622 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.51■■□□□ 1.35
USP3-AS1-207ENST00000560622 SLIT3O75094 1523 aa23.51■■□□□ 1.35
USP3-AS1-207ENST00000560622 BAG6P46379 1132 aa23.51■■□□□ 1.35
USP3-AS1-207ENST00000560622 PEAK1Q9H792 1746 aa23.5■■□□□ 1.35
USP3-AS1-207ENST00000560622 SBF2Q86WG5 1849 aa23.5■■□□□ 1.35
USP3-AS1-207ENST00000560622 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
USP3-AS1-207ENST00000560622 CABP2Q9NPB3 220 aa23.5■■□□□ 1.35
USP3-AS1-207ENST00000560622 STRN4Q9NRL3 753 aa23.5■■□□□ 1.35
USP3-AS1-207ENST00000560622 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
USP3-AS1-207ENST00000560622 RGPD5Q99666 1765 aa23.5■■□□□ 1.35
USP3-AS1-207ENST00000560622 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
USP3-AS1-207ENST00000560622 USP6P35125 1406 aa23.48■■□□□ 1.35
USP3-AS1-207ENST00000560622 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
USP3-AS1-207ENST00000560622 BARGINQ6ZT62 677 aa23.47■■□□□ 1.35
USP3-AS1-207ENST00000560622 ABTB2Q8N961 1025 aa23.47■■□□□ 1.35
USP3-AS1-207ENST00000560622 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.46■■□□□ 1.35
USP3-AS1-207ENST00000560622 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.45■■□□□ 1.34
USP3-AS1-207ENST00000560622 LRRC37A3O60309 1634 aa23.44■■□□□ 1.34
USP3-AS1-207ENST00000560622 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
USP3-AS1-207ENST00000560622 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
USP3-AS1-207ENST00000560622 GCP02774 474 aa23.43■■□□□ 1.34
USP3-AS1-207ENST00000560622 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
USP3-AS1-207ENST00000560622 TRIM37O94972 964 aa23.42■■□□□ 1.34
USP3-AS1-207ENST00000560622 USP35Q9P2H5 1018 aa23.42■■□□□ 1.34
USP3-AS1-207ENST00000560622 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.41■■□□□ 1.34
USP3-AS1-207ENST00000560622 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.41■■□□□ 1.34
USP3-AS1-207ENST00000560622 CABP1Q9NZU7 370 aa23.41■■□□□ 1.34
USP3-AS1-207ENST00000560622 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.4■■□□□ 1.34
USP3-AS1-207ENST00000560622 NLRP13Q86W25 1043 aa23.4■■□□□ 1.34
USP3-AS1-207ENST00000560622 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.39■■□□□ 1.33
USP3-AS1-207ENST00000560622 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
USP3-AS1-207ENST00000560622 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.38■■□□□ 1.33
USP3-AS1-207ENST00000560622 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
USP3-AS1-207ENST00000560622 CRB1P82279 1406 aa23.37■■□□□ 1.33
USP3-AS1-207ENST00000560622 EVA1CP58658 441 aa23.37■■□□□ 1.33
USP3-AS1-207ENST00000560622 USP54Q70EL1 1684 aa23.37■■□□□ 1.33
USP3-AS1-207ENST00000560622 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.37■■□□□ 1.33
USP3-AS1-207ENST00000560622 NFAT5O94916 1531 aa23.36■■□□□ 1.33
USP3-AS1-207ENST00000560622 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
USP3-AS1-207ENST00000560622 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.34■■□□□ 1.33
USP3-AS1-207ENST00000560622 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
USP3-AS1-207ENST00000560622 APBA3O96018 575 aa23.33■■□□□ 1.33
USP3-AS1-207ENST00000560622 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.33■■□□□ 1.33
USP3-AS1-207ENST00000560622 NLRP6P59044 892 aa23.32■■□□□ 1.32
USP3-AS1-207ENST00000560622 EVC2Q86UK5 1308 aa23.31■■□□□ 1.32
USP3-AS1-207ENST00000560622 PDE3BQ13370 1112 aa23.3■■□□□ 1.32
USP3-AS1-207ENST00000560622 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.3■■□□□ 1.32
USP3-AS1-207ENST00000560622 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.3■■□□□ 1.32
USP3-AS1-207ENST00000560622 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms