RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558550.1

EFTUD1P1-202, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD1P1, Length 418 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SBNO1A3KN83 1393 aa9.72□□□□□ -0.85
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CCDC7Q96M83 1385 aa9.72□□□□□ -0.85
EFTUD1P1-202ENST00000558550 JCADQ9P266 1359 aa9.72□□□□□ -0.85
EFTUD1P1-202ENST00000558550 USP6P35125 1406 aa9.72□□□□□ -0.85
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP9.71□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ABTB2Q8N961 1025 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 WASHC2AQ641Q2 1341 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 A0A1W2PP64 1363 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TNS3Q68CZ2 1445 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CD163L1Q9NR16 1453 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SHPRHQ149N8 1683 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ALS2Q96Q42 1657 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NUTM2GQ5VZR2 741 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ARHGEF10O15013 1369 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PNPLA6Q8IY17 1366 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NLRP6P59044 892 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TTC21AQ8NDW8 1320 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PANK3Q9H999 370 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NRKQ7Z2Y5 1582 aa9.68□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NLRP13Q86W25 1043 aa9.68□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SSH2Q76I76 1423 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NME9Q86XW9 330 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CABLES1Q8TDN4 633 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CARD14Q9BXL6 1004 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KIF20BQ96Q89 1820 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PIK3C2AO00443 1686 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NSD3Q9BZ95 1437 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KNSTRNQ9Y448 316 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ABCA3Q99758 1704 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CGNL1Q0VF96 1302 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ADAMTS2O95450 1211 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZRANB1Q9UGI0 708 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FYB1O15117 783 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SOX12O15370 315 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 COG3Q96JB2 828 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GGNBP2Q9H3C7 697 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZBTB7CA1YPR0 619 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GCP02774 474 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 USP31Q70CQ4 1352 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 USP19O94966 1318 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 USP54Q70EL1 1684 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KCNH5Q8NCM2 988 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NGLY1Q96IV0 654 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LRP6O75581 1613 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 C8orf37Q96NL8 207 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PRDM11Q9NQV5 511 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SLIT3O75094 1523 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 OVOS2Q6IE36 1432 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MORC1Q86VD1 984 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NSD2O96028 1365 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KIAA0232Q92628 1395 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LTN1O94822 1766 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FAM83GA6ND36 823 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CHRNA2Q15822 529 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PLCH1Q4KWH8 1693 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RGPD5Q99666 1765 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FBLN1P23142 703 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 AFF2P51816 1311 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NFAT5O94916 1531 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ARHGEF25Q86VW2 580 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CPDO75976 1380 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NWD2Q9ULI1 1742 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 AMPHP49418 695 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 EVA1CP58658 441 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 BTG4Q9NY30 223 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 USP21Q9UK80 565 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 COL18A1P39060 1754 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 AATKQ6ZMQ8 1374 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD1P1-202ENST00000558550 STRN4Q9NRL3 753 aa9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms