RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555009.5

RPS6KL1-209, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RPS6KL1, Length 2,457 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-209ENST00000555009 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.61■■□□□ 1.37
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RPS6KL1-209ENST00000555009 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
RPS6KL1-209ENST00000555009 ALKQ9UM73 1620 aa23.59■■□□□ 1.37
RPS6KL1-209ENST00000555009 PRAM1Q96QH2 718 aa23.59■■□□□ 1.37
RPS6KL1-209ENST00000555009 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
RPS6KL1-209ENST00000555009 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
RPS6KL1-209ENST00000555009 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
RPS6KL1-209ENST00000555009 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.58■■□□□ 1.37
RPS6KL1-209ENST00000555009 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.58■■□□□ 1.37
RPS6KL1-209ENST00000555009 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.57■■□□□ 1.36
RPS6KL1-209ENST00000555009 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.57■■□□□ 1.36
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.57■■□□□ 1.36
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
RPS6KL1-209ENST00000555009 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.56■■□□□ 1.36
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RPS6KL1-209ENST00000555009 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.56■■□□□ 1.36
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RPS6KL1-209ENST00000555009 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
RPS6KL1-209ENST00000555009 NSD2O96028 1365 aa23.55■■□□□ 1.36
RPS6KL1-209ENST00000555009 A0A1W2PP64 1363 aa23.54■■□□□ 1.36
RPS6KL1-209ENST00000555009 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
RPS6KL1-209ENST00000555009 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
RPS6KL1-209ENST00000555009 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.52■■□□□ 1.36
RPS6KL1-209ENST00000555009 ADGRB2O60241 1585 aa23.52■■□□□ 1.36
RPS6KL1-209ENST00000555009 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
RPS6KL1-209ENST00000555009 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.5■■□□□ 1.35
RPS6KL1-209ENST00000555009 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.5■■□□□ 1.35
RPS6KL1-209ENST00000555009 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.49■■□□□ 1.35
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RPS6KL1-209ENST00000555009 TRIM27P14373 513 aa23.48■■□□□ 1.35
RPS6KL1-209ENST00000555009 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
RPS6KL1-209ENST00000555009 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.47■■□□□ 1.35
RPS6KL1-209ENST00000555009 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
RPS6KL1-209ENST00000555009 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.46■■□□□ 1.35
RPS6KL1-209ENST00000555009 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.46■■□□□ 1.35
RPS6KL1-209ENST00000555009 ABCC11Q96J66 1382 aa23.46■■□□□ 1.35
RPS6KL1-209ENST00000555009 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.45■■□□□ 1.35
RPS6KL1-209ENST00000555009 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.45■■□□□ 1.35
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RPS6KL1-209ENST00000555009 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.45■■□□□ 1.34
RPS6KL1-209ENST00000555009 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.45■■□□□ 1.34
RPS6KL1-209ENST00000555009 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
RPS6KL1-209ENST00000555009 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
RPS6KL1-209ENST00000555009 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.44■■□□□ 1.34
RPS6KL1-209ENST00000555009 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.44■■□□□ 1.34
RPS6KL1-209ENST00000555009 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.44■■□□□ 1.34
RPS6KL1-209ENST00000555009 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
RPS6KL1-209ENST00000555009 CDK19Q9BWU1 502 aa23.43■■□□□ 1.34
RPS6KL1-209ENST00000555009 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.43■■□□□ 1.34
RPS6KL1-209ENST00000555009 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.43■■□□□ 1.34
RPS6KL1-209ENST00000555009 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.43■■□□□ 1.34
RPS6KL1-209ENST00000555009 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
RPS6KL1-209ENST00000555009 MCM4P33991 863 aa23.4■■□□□ 1.34
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RPS6KL1-209ENST00000555009 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
RPS6KL1-209ENST00000555009 CABP1Q9NZU7 370 aa23.39■■□□□ 1.34
RPS6KL1-209ENST00000555009 FYB1O15117 783 aa23.39■■□□□ 1.33
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RPS6KL1-209ENST00000555009 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
RPS6KL1-209ENST00000555009 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.37■■□□□ 1.33
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RPS6KL1-209ENST00000555009 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.36■■□□□ 1.33
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RPS6KL1-209ENST00000555009 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.33■■□□□ 1.33
RPS6KL1-209ENST00000555009 KIF16BQ96L93 1317 aa23.33■■□□□ 1.33
RPS6KL1-209ENST00000555009 FSD2A1L4K1 749 aa23.33■■□□□ 1.32
RPS6KL1-209ENST00000555009 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
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RPS6KL1-209ENST00000555009 HSCBQ8IWL3 235 aa23.32■■□□□ 1.32
RPS6KL1-209ENST00000555009 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
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RPS6KL1-209ENST00000555009 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.32
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RPS6KL1-209ENST00000555009 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
RPS6KL1-209ENST00000555009 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.27■■□□□ 1.32
RPS6KL1-209ENST00000555009 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
RPS6KL1-209ENST00000555009 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.27■■□□□ 1.32
RPS6KL1-209ENST00000555009 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
RPS6KL1-209ENST00000555009 LNPKQ9C0E8 428 aa23.27■■□□□ 1.32
RPS6KL1-209ENST00000555009 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
RPS6KL1-209ENST00000555009 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.26■■□□□ 1.31
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