RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553277.5

LRP1-204, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP1, Length 1,693 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-204ENST00000553277 USP6P35125 1406 aa25.02■■□□□ 1.6
LRP1-204ENST00000553277 INSRP06213 1382 aa25.01■■□□□ 1.6
LRP1-204ENST00000553277 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.01■■□□□ 1.59
LRP1-204ENST00000553277 MST1RQ04912 1400 aa25.01■■□□□ 1.59
LRP1-204ENST00000553277 FYB1O15117 783 aa25.01■■□□□ 1.59
LRP1-204ENST00000553277 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25■■□□□ 1.59
LRP1-204ENST00000553277 NRKQ7Z2Y5 1582 aa25■■□□□ 1.59
LRP1-204ENST00000553277 ATF3P18847 181 aa25■■□□□ 1.59
LRP1-204ENST00000553277 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.99■■□□□ 1.59
LRP1-204ENST00000553277 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
LRP1-204ENST00000553277 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.97■■□□□ 1.59
LRP1-204ENST00000553277 NLRP13Q86W25 1043 aa24.97■■□□□ 1.59
LRP1-204ENST00000553277 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.97■■□□□ 1.59
LRP1-204ENST00000553277 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.96■■□□□ 1.59
LRP1-204ENST00000553277 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
LRP1-204ENST00000553277 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.94■■□□□ 1.58
LRP1-204ENST00000553277 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.94■■□□□ 1.58
LRP1-204ENST00000553277 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.94■■□□□ 1.58
LRP1-204ENST00000553277 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.93■■□□□ 1.58
LRP1-204ENST00000553277 KIF1AQ12756 1690 aa24.93■■□□□ 1.58
LRP1-204ENST00000553277 PPP2R1AP30153 589 aa24.93■■□□□ 1.58
LRP1-204ENST00000553277 NUDCQ9Y266 331 aa24.93■■□□□ 1.58
LRP1-204ENST00000553277 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
LRP1-204ENST00000553277 ORAI2Q96SN7 254 aa24.92■■□□□ 1.58
LRP1-204ENST00000553277 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.92■■□□□ 1.58
LRP1-204ENST00000553277 MORC1Q86VD1 984 aa24.91■■□□□ 1.58
LRP1-204ENST00000553277 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
LRP1-204ENST00000553277 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.9■■□□□ 1.58
LRP1-204ENST00000553277 NME9Q86XW9 330 aa24.88■■□□□ 1.57
LRP1-204ENST00000553277 USP31Q70CQ4 1352 aa24.87■■□□□ 1.57
LRP1-204ENST00000553277 MYT1Q01538 1121 aa24.87■■□□□ 1.57
LRP1-204ENST00000553277 SLAIN2Q9P270 581 aa24.86■■□□□ 1.57
LRP1-204ENST00000553277 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.85■■□□□ 1.57
LRP1-204ENST00000553277 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.85■■□□□ 1.57
LRP1-204ENST00000553277 USP54Q70EL1 1684 aa24.85■■□□□ 1.57
LRP1-204ENST00000553277 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.82■■□□□ 1.56
LRP1-204ENST00000553277 FOXO3O43524 673 aa24.82■■□□□ 1.56
LRP1-204ENST00000553277 PSME1Q06323 249 aa24.82■■□□□ 1.56
LRP1-204ENST00000553277 PIK3C2AO00443 1686 aa24.82■■□□□ 1.56
LRP1-204ENST00000553277 PDE3BQ13370 1112 aa24.81■■□□□ 1.56
LRP1-204ENST00000553277 COG3Q96JB2 828 aa24.81■■□□□ 1.56
LRP1-204ENST00000553277 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
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LRP1-204ENST00000553277 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.79■■□□□ 1.56
LRP1-204ENST00000553277 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.78■■□□□ 1.56
LRP1-204ENST00000553277 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
LRP1-204ENST00000553277 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.76■■□□□ 1.55
LRP1-204ENST00000553277 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
LRP1-204ENST00000553277 SBNO1A3KN83 1393 aa24.76■■□□□ 1.55
LRP1-204ENST00000553277 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
LRP1-204ENST00000553277 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
LRP1-204ENST00000553277 MTHFSP49914 203 aa24.75■■□□□ 1.55
LRP1-204ENST00000553277 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.75■■□□□ 1.55
LRP1-204ENST00000553277 PXDNQ92626 1479 aa24.75■■□□□ 1.55
LRP1-204ENST00000553277 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
LRP1-204ENST00000553277 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.73■■□□□ 1.55
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LRP1-204ENST00000553277 POLKQ9UBT6 870 aa24.73■■□□□ 1.55
LRP1-204ENST00000553277 ALS2Q96Q42 1657 aa24.72■■□□□ 1.55
LRP1-204ENST00000553277 NLRP6P59044 892 aa24.72■■□□□ 1.55
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LRP1-204ENST00000553277 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
LRP1-204ENST00000553277 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.68■■□□□ 1.54
LRP1-204ENST00000553277 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
LRP1-204ENST00000553277 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
LRP1-204ENST00000553277 CFAP53Q96M91 514 aa24.67■■□□□ 1.54
LRP1-204ENST00000553277 USP19O94966 1318 aa24.67■■□□□ 1.54
LRP1-204ENST00000553277 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
LRP1-204ENST00000553277 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.66■■□□□ 1.54
LRP1-204ENST00000553277 FBLN1P23142 703 aa24.66■■□□□ 1.54
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LRP1-204ENST00000553277 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.65■■□□□ 1.54
LRP1-204ENST00000553277 SLIT3O75094 1523 aa24.65■■□□□ 1.54
LRP1-204ENST00000553277 KIF24Q5T7B8 1368 aa24.65■■□□□ 1.54
LRP1-204ENST00000553277 SHPRHQ149N8 1683 aa24.64■■□□□ 1.54
LRP1-204ENST00000553277 NFAT5O94916 1531 aa24.64■■□□□ 1.53
LRP1-204ENST00000553277 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.62■■□□□ 1.53
LRP1-204ENST00000553277 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.62■■□□□ 1.53
LRP1-204ENST00000553277 ARHGEF10O15013 1369 aa24.62■■□□□ 1.53
LRP1-204ENST00000553277 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.62■■□□□ 1.53
LRP1-204ENST00000553277 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.62■■□□□ 1.53
LRP1-204ENST00000553277 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
LRP1-204ENST00000553277 TOM1O60784 492 aa24.61■■□□□ 1.53
LRP1-204ENST00000553277 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
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LRP1-204ENST00000553277 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
LRP1-204ENST00000553277 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.6■■□□□ 1.53
LRP1-204ENST00000553277 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
LRP1-204ENST00000553277 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.59■■□□□ 1.53
LRP1-204ENST00000553277 PEAK1Q9H792 1746 aa24.58■■□□□ 1.53
LRP1-204ENST00000553277 GCP02774 474 aa24.57■■□□□ 1.52
LRP1-204ENST00000553277 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.56■■□□□ 1.52
LRP1-204ENST00000553277 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
LRP1-204ENST00000553277 FLT4P35916 1363 aa24.56■■□□□ 1.52
LRP1-204ENST00000553277 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.55■■□□□ 1.52
LRP1-204ENST00000553277 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.55■■□□□ 1.52
LRP1-204ENST00000553277 RTL1A6NKG5 1358 aa24.55■■□□□ 1.52
LRP1-204ENST00000553277 CERKQ8TCT0 537 aa24.55■■□□□ 1.52
LRP1-204ENST00000553277 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.55■■□□□ 1.52
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