RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-223ENST00000551137 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP16.42■□□□□ 0.22
CS-223ENST00000551137 TONSLQ96HA7 1378 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-223ENST00000551137 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
CS-223ENST00000551137 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-223ENST00000551137 NWD2Q9ULI1 1742 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-223ENST00000551137 FAM83GA6ND36 823 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-223ENST00000551137 CABP2Q9NPB3 220 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-223ENST00000551137 EVC2Q86UK5 1308 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-223ENST00000551137 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa16.39■□□□□ 0.21
CS-223ENST00000551137 VPS72Q15906 364 aa16.39■□□□□ 0.21
CS-223ENST00000551137 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa16.39■□□□□ 0.21
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CS-223ENST00000551137 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
CS-223ENST00000551137 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
CS-223ENST00000551137 CABP1Q9NZU7 370 aa16.37■□□□□ 0.21
CS-223ENST00000551137 PLCH1Q4KWH8 1693 aa16.37■□□□□ 0.21
CS-223ENST00000551137 GLI3P10071 1580 aa16.35■□□□□ 0.21
CS-223ENST00000551137 CARD11Q9BXL7 1154 aa16.35■□□□□ 0.21
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CS-223ENST00000551137 SSH2Q76I76 1423 aa16.34■□□□□ 0.21
CS-223ENST00000551137 EP400Q96L91 3159 aa16.33■□□□□ 0.21
CS-223ENST00000551137 ABTB2Q8N961 1025 aa16.33■□□□□ 0.2
CS-223ENST00000551137 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
CS-223ENST00000551137 BTG4Q9NY30 223 aa16.33■□□□□ 0.2
CS-223ENST00000551137 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa16.33■□□□□ 0.2
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CS-223ENST00000551137 NLRP13Q86W25 1043 aa16.32■□□□□ 0.2
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CS-223ENST00000551137 CPDO75976 1380 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-223ENST00000551137 PRDM11Q9NQV5 511 aa16.31■□□□□ 0.2
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CS-223ENST00000551137 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
CS-223ENST00000551137 KIAA0232Q92628 1395 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-223ENST00000551137 SLC24A1O60721 1099 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-223ENST00000551137 CCDC125Q86Z20 511 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-223ENST00000551137 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa16.28■□□□□ 0.2
CS-223ENST00000551137 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa16.28■□□□□ 0.2
CS-223ENST00000551137 GCP02774 474 aa16.28■□□□□ 0.2
CS-223ENST00000551137 NUTM2GQ5VZR2 741 aa16.28■□□□□ 0.2
CS-223ENST00000551137 NRKQ7Z2Y5 1582 aa16.27■□□□□ 0.2
CS-223ENST00000551137 SEPT12Q8IYM1 358 aa16.27■□□□□ 0.2
CS-223ENST00000551137 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CS-223ENST00000551137 TESK2Q96S53 571 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-223ENST00000551137 AKAP12Q02952 1782 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-223ENST00000551137 SLIT3O75094 1523 aa16.25■□□□□ 0.19
CS-223ENST00000551137 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa16.25■□□□□ 0.19
CS-223ENST00000551137 TTC21AQ8NDW8 1320 aa16.25■□□□□ 0.19
CS-223ENST00000551137 NLRP6P59044 892 aa16.25■□□□□ 0.19
CS-223ENST00000551137 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
CS-223ENST00000551137 CHRNA2Q15822 529 aa16.24■□□□□ 0.19
CS-223ENST00000551137 BRWD3Q6RI45 1802 aa16.24■□□□□ 0.19
CS-223ENST00000551137 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa16.23■□□□□ 0.19
CS-223ENST00000551137 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa16.23■□□□□ 0.19
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CS-223ENST00000551137 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa16.23■□□□□ 0.19
CS-223ENST00000551137 CD163L1Q9NR16 1453 aa16.22■□□□□ 0.19
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CS-223ENST00000551137 KRT27Q7Z3Y8 459 aa16.22■□□□□ 0.19
CS-223ENST00000551137 AATKQ6ZMQ8 1374 aa16.22■□□□□ 0.19
CS-223ENST00000551137 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
CS-223ENST00000551137 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
CS-223ENST00000551137 MON2Q7Z3U7 1717 aa16.2■□□□□ 0.18
CS-223ENST00000551137 BARGINQ6ZT62 677 aa16.2■□□□□ 0.18
CS-223ENST00000551137 KCNH5Q8NCM2 988 aa16.2■□□□□ 0.18
CS-223ENST00000551137 PCGF6Q9BYE7 350 aa16.2■□□□□ 0.18
CS-223ENST00000551137 USP31Q70CQ4 1352 aa16.2■□□□□ 0.18
CS-223ENST00000551137 NINLQ9Y2I6 1382 aa16.2■□□□□ 0.18
CS-223ENST00000551137 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa16.2■□□□□ 0.18
CS-223ENST00000551137 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
CS-223ENST00000551137 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa16.19■□□□□ 0.18
CS-223ENST00000551137 TERF2IPQ9NYB0 399 aa16.19■□□□□ 0.18
CS-223ENST00000551137 EVA1CP58658 441 aa16.18■□□□□ 0.18
CS-223ENST00000551137 ARHGEF25Q86VW2 580 aa16.18■□□□□ 0.18
CS-223ENST00000551137 STRN4Q9NRL3 753 aa16.18■□□□□ 0.18
CS-223ENST00000551137 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CS-223ENST00000551137 USP47Q96K76 1375 aa16.17■□□□□ 0.18
CS-223ENST00000551137 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CS-223ENST00000551137 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CS-223ENST00000551137 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CS-223ENST00000551137 USP54Q70EL1 1684 aa16.17■□□□□ 0.18
CS-223ENST00000551137 COL18A1P39060 1754 aa16.16■□□□□ 0.18
CS-223ENST00000551137 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CS-223ENST00000551137 TMC1Q8TDI8 760 aa16.16■□□□□ 0.18
CS-223ENST00000551137 A0A1W2PP64 1363 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-223ENST00000551137 TCP11L2Q8N4U5 519 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-223ENST00000551137 NFAT5O94916 1531 aa16.14■□□□□ 0.18
CS-223ENST00000551137 CRB1P82279 1406 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-223ENST00000551137 A0A0G2JS52 829 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-223ENST00000551137 TMF1P82094 1093 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-223ENST00000551137 MYT1Q01538 1121 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-223ENST00000551137 ABCC6O95255 1503 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-223ENST00000551137 AXIN2Q9Y2T1 843 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-223ENST00000551137 NME9Q86XW9 330 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-223ENST00000551137 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP16.12■□□□□ 0.17
CS-223ENST00000551137 CDCA8Q53HL2 280 aa16.11■□□□□ 0.17
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