RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534518.1

TOMM20P1-201, Transcript of TOMM20 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOMM20P1, Length 427 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20P1-201ENST00000534518 TRIM37O94972 964 aa9.59□□□□□ -0.87
TOMM20P1-201ENST00000534518 APBA3O96018 575 aa9.59□□□□□ -0.87
TOMM20P1-201ENST00000534518 C1QTNF8P60827 252 aa9.59□□□□□ -0.87
TOMM20P1-201ENST00000534518 FAM182BQ5T319 152 aa9.59□□□□□ -0.87
TOMM20P1-201ENST00000534518 LMOD2Q6P5Q4 547 aa9.58□□□□□ -0.88
TOMM20P1-201ENST00000534518 PHF8Q9UPP1 1060 aa9.58□□□□□ -0.88
TOMM20P1-201ENST00000534518 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TOMM20P1-201ENST00000534518 ABCC11Q96J66 1382 aa9.57□□□□□ -0.88
TOMM20P1-201ENST00000534518 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TOMM20P1-201ENST00000534518 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TOMM20P1-201ENST00000534518 PLEKHG5O94827 1062 aa9.56□□□□□ -0.88
TOMM20P1-201ENST00000534518 ITSN1Q15811 1721 aa9.56□□□□□ -0.88
TOMM20P1-201ENST00000534518 MSH5O43196 834 aa9.55□□□□□ -0.88
TOMM20P1-201ENST00000534518 WAPLQ7Z5K2 1190 aa9.55□□□□□ -0.88
TOMM20P1-201ENST00000534518 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa9.54□□□□□ -0.88
TOMM20P1-201ENST00000534518 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TOMM20P1-201ENST00000534518 ANKARQ7Z5J8 1434 aa9.54□□□□□ -0.88
TOMM20P1-201ENST00000534518 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa9.54□□□□□ -0.88
TOMM20P1-201ENST00000534518 AKAP12Q02952 1782 aa9.53□□□□□ -0.88
TOMM20P1-201ENST00000534518 DLC1Q96QB1 1528 aa9.53□□□□□ -0.88
TOMM20P1-201ENST00000534518 PDE3BQ13370 1112 aa9.53□□□□□ -0.88
TOMM20P1-201ENST00000534518 SIRT1Q96EB6 747 aa9.53□□□□□ -0.88
TOMM20P1-201ENST00000534518 STK26Q9P289 416 aa9.53□□□□□ -0.88
TOMM20P1-201ENST00000534518 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TOMM20P1-201ENST00000534518 PEAK1Q9H792 1746 aa9.52□□□□□ -0.89
TOMM20P1-201ENST00000534518 WNK3Q9BYP7 1800 aa9.52□□□□□ -0.89
TOMM20P1-201ENST00000534518 GPRASP1Q5JY77 1395 aa9.51□□□□□ -0.89
TOMM20P1-201ENST00000534518 BARGINQ6ZT62 677 aa9.51□□□□□ -0.89
TOMM20P1-201ENST00000534518 PRDM11Q9NQV5 511 aa9.51□□□□□ -0.89
TOMM20P1-201ENST00000534518 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa9.5□□□□□ -0.89
TOMM20P1-201ENST00000534518 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TOMM20P1-201ENST00000534518 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TOMM20P1-201ENST00000534518 PIK3C2GO75747 1445 aa9.49□□□□□ -0.89
TOMM20P1-201ENST00000534518 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa9.49□□□□□ -0.89
TOMM20P1-201ENST00000534518 LMO7Q8WWI1 1683 aa9.48□□□□□ -0.89
TOMM20P1-201ENST00000534518 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa9.48□□□□□ -0.89
TOMM20P1-201ENST00000534518 PLSCR1O15162 318 aa9.48□□□□□ -0.89
TOMM20P1-201ENST00000534518 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa9.48□□□□□ -0.89
TOMM20P1-201ENST00000534518 LRRC37A3O60309 1634 aa9.48□□□□□ -0.89
TOMM20P1-201ENST00000534518 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa9.48□□□□□ -0.89
TOMM20P1-201ENST00000534518 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa9.48□□□□□ -0.89
TOMM20P1-201ENST00000534518 OVOS2Q6IE36 1432 aa9.48□□□□□ -0.89
TOMM20P1-201ENST00000534518 SSH2Q76I76 1423 aa9.48□□□□□ -0.89
TOMM20P1-201ENST00000534518 ATP7BP35670 1465 aa9.47□□□□□ -0.89
TOMM20P1-201ENST00000534518 ITGAEP38570 1179 aa9.47□□□□□ -0.89
TOMM20P1-201ENST00000534518 TMEM132EQ6IEE7 984 aa9.47□□□□□ -0.89
TOMM20P1-201ENST00000534518 SYT17Q9BSW7 474 aa9.47□□□□□ -0.89
TOMM20P1-201ENST00000534518 STRN4Q9NRL3 753 aa9.47□□□□□ -0.89
TOMM20P1-201ENST00000534518 SHANK3Q9BYB0 1731 aa9.47□□□□□ -0.89
TOMM20P1-201ENST00000534518 KIAA0232Q92628 1395 aa9.47□□□□□ -0.89
TOMM20P1-201ENST00000534518 TULP4Q9NRJ4 1543 aa9.46□□□□□ -0.89
TOMM20P1-201ENST00000534518 PTGER2P43116 358 aa9.46□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 QSER1Q2KHR3 1735 aa9.45□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 ZBTB7AO95365 584 aa9.45□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 EVA1CP58658 441 aa9.45□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 TCP11L2Q8N4U5 519 aa9.45□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 USP35Q9P2H5 1018 aa9.45□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 MAP3K5Q99683 1374 aa9.45□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa9.45□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa9.45□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 COL24A1Q17RW2 1714 aa9.45□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 CHRNA2Q15822 529 aa9.43□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 MTFR1LQ9H019 292 aa9.43□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 PRAM1Q96QH2 718 aa9.42□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 STK32BQ9NY57 414 aa9.42□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 RGL3Q3MIN7 710 aa9.41□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 POGKQ9P215 609 aa9.41□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 BCL9O00512 1426 aa9.4□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 CPDO75976 1380 aa9.4□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 NHSQ6T4R5 1651 aa9.4□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP9.4□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 SLC15A2Q16348 729 aa9.4□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 GPR162Q16538 588 aa9.4□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 ARXQ96QS3 562 aa9.4□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 SGIP1Q9BQI5 828 aa9.4□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 PAPPAQ13219 1627 aa9.4□□□□□ -0.9
TOMM20P1-201ENST00000534518 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
TOMM20P1-201ENST00000534518 CRB1P82279 1406 aa9.39□□□□□ -0.91
TOMM20P1-201ENST00000534518 AATKQ6ZMQ8 1374 aa9.39□□□□□ -0.91
TOMM20P1-201ENST00000534518 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TOMM20P1-201ENST00000534518 PRR36Q9H6K5 1346 aa9.38□□□□□ -0.91
TOMM20P1-201ENST00000534518 DDB1Q16531 1140 aa9.38□□□□□ -0.91
TOMM20P1-201ENST00000534518 RGPD5Q99666 1765 aa9.37□□□□□ -0.91
TOMM20P1-201ENST00000534518 WASLO00401 505 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
TOMM20P1-201ENST00000534518 TXNRD1Q16881 649 aa9.37□□□□□ -0.91
TOMM20P1-201ENST00000534518 PROM2Q8N271 834 aa9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.1 ms