RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532471.1

ME3-210, Transcript of malic enzyme 3, humanhuman

TSL 2

Gene ME3, Length 384 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3-210ENST00000532471 SLC24A1O60721 1099 aa32.55■■■□□ 2.8
ME3-210ENST00000532471 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
ME3-210ENST00000532471 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa32.54■■■□□ 2.8
ME3-210ENST00000532471 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa32.53■■■□□ 2.8
ME3-210ENST00000532471 ABTB2Q8N961 1025 aa32.52■■■□□ 2.8
ME3-210ENST00000532471 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP32.51■■■□□ 2.79
ME3-210ENST00000532471 UNC5CLQ8IV45 518 aa32.51■■■□□ 2.79
ME3-210ENST00000532471 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP32.51■■■□□ 2.79
ME3-210ENST00000532471 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.79
ME3-210ENST00000532471 ATAD2Q6PL18 1390 aa32.5■■■□□ 2.79
ME3-210ENST00000532471 ALS2Q96Q42 1657 aa32.49■■■□□ 2.79
ME3-210ENST00000532471 NUTM2GQ5VZR2 741 aa32.48■■■□□ 2.79
ME3-210ENST00000532471 BCL9LQ86UU0 1499 aa32.48■■■□□ 2.79
ME3-210ENST00000532471 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP32.48■■■□□ 2.79
ME3-210ENST00000532471 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa32.47■■■□□ 2.79
ME3-210ENST00000532471 FAM83GA6ND36 823 aa32.47■■■□□ 2.79
ME3-210ENST00000532471 NLRP13Q86W25 1043 aa32.46■■■□□ 2.79
ME3-210ENST00000532471 ATRNO75882 1429 aa32.45■■■□□ 2.79
ME3-210ENST00000532471 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP32.44■■■□□ 2.78
ME3-210ENST00000532471 SLIT2O94813 1529 aa32.44■■■□□ 2.78
ME3-210ENST00000532471 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP32.43■■■□□ 2.78
ME3-210ENST00000532471 TMC1Q8TDI8 760 aa32.41■■■□□ 2.78
ME3-210ENST00000532471 PRDM11Q9NQV5 511 aa32.4■■■□□ 2.78
ME3-210ENST00000532471 USP6P35125 1406 aa32.4■■■□□ 2.78
ME3-210ENST00000532471 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP32.39■■■□□ 2.78
ME3-210ENST00000532471 BTG4Q9NY30 223 aa32.38■■■□□ 2.77
ME3-210ENST00000532471 NLRP6P59044 892 aa32.37■■■□□ 2.77
ME3-210ENST00000532471 TESK2Q96S53 571 aa32.37■■■□□ 2.77
ME3-210ENST00000532471 ABCA3Q99758 1704 aa32.37■■■□□ 2.77
ME3-210ENST00000532471 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
ME3-210ENST00000532471 VPS72Q15906 364 aa32.36■■■□□ 2.77
ME3-210ENST00000532471 USP47Q96K76 1375 aa32.34■■■□□ 2.77
ME3-210ENST00000532471 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP32.34■■■□□ 2.77
ME3-210ENST00000532471 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
ME3-210ENST00000532471 RGS12O14924 1447 aa32.33■■■□□ 2.77
ME3-210ENST00000532471 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa32.32■■■□□ 2.76
ME3-210ENST00000532471 GCP02774 474 aa32.32■■■□□ 2.76
ME3-210ENST00000532471 TMF1P82094 1093 aa32.32■■■□□ 2.76
ME3-210ENST00000532471 TERF2IPQ9NYB0 399 aa32.32■■■□□ 2.76
ME3-210ENST00000532471 KIAA0232Q92628 1395 aa32.32■■■□□ 2.76
ME3-210ENST00000532471 TTC21AQ8NDW8 1320 aa32.31■■■□□ 2.76
ME3-210ENST00000532471 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa32.31■■■□□ 2.76
ME3-210ENST00000532471 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
ME3-210ENST00000532471 USP19O94966 1318 aa32.3■■■□□ 2.76
ME3-210ENST00000532471 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
ME3-210ENST00000532471 NWD2Q9ULI1 1742 aa32.3■■■□□ 2.76
ME3-210ENST00000532471 SSH2Q76I76 1423 aa32.29■■■□□ 2.76
ME3-210ENST00000532471 CHRNA2Q15822 529 aa32.29■■■□□ 2.76
ME3-210ENST00000532471 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
ME3-210ENST00000532471 CDCA8Q53HL2 280 aa32.28■■■□□ 2.76
ME3-210ENST00000532471 PLCH1Q4KWH8 1693 aa32.27■■■□□ 2.76
ME3-210ENST00000532471 EVA1CP58658 441 aa32.26■■■□□ 2.75
ME3-210ENST00000532471 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa32.26■■■□□ 2.75
ME3-210ENST00000532471 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP32.24■■■□□ 2.75
ME3-210ENST00000532471 NINLQ9Y2I6 1382 aa32.23■■■□□ 2.75
ME3-210ENST00000532471 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP32.23■■■□□ 2.75
ME3-210ENST00000532471 KCNH5Q8NCM2 988 aa32.23■■■□□ 2.75
ME3-210ENST00000532471 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
ME3-210ENST00000532471 CPDO75976 1380 aa32.22■■■□□ 2.75
ME3-210ENST00000532471 STRN4Q9NRL3 753 aa32.21■■■□□ 2.75
ME3-210ENST00000532471 AKAP12Q02952 1782 aa32.2■■■□□ 2.75
ME3-210ENST00000532471 ZBTB7CA1YPR0 619 aa32.2■■■□□ 2.75
ME3-210ENST00000532471 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP32.2■■■□□ 2.75
ME3-210ENST00000532471 SEPT12Q8IYM1 358 aa32.19■■■□□ 2.74
ME3-210ENST00000532471 A0A0G2JS52 829 aa32.18■■■□□ 2.74
ME3-210ENST00000532471 MYT1Q01538 1121 aa32.18■■■□□ 2.74
ME3-210ENST00000532471 GLI3P10071 1580 aa32.17■■■□□ 2.74
ME3-210ENST00000532471 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa32.17■■■□□ 2.74
ME3-210ENST00000532471 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa32.17■■■□□ 2.74
ME3-210ENST00000532471 NRKQ7Z2Y5 1582 aa32.15■■■□□ 2.74
ME3-210ENST00000532471 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
ME3-210ENST00000532471 CD163L1Q9NR16 1453 aa32.15■■■□□ 2.74
ME3-210ENST00000532471 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
ME3-210ENST00000532471 A0A1W2PP64 1363 aa32.13■■■□□ 2.73
ME3-210ENST00000532471 SOX12O15370 315 aa32.13■■■□□ 2.73
ME3-210ENST00000532471 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP32.13■■■□□ 2.73
ME3-210ENST00000532471 PIK3C2AO00443 1686 aa32.12■■■□□ 2.73
ME3-210ENST00000532471 NRAPQ86VF7 1730 aa32.12■■■□□ 2.73
ME3-210ENST00000532471 SLIT3O75094 1523 aa32.11■■■□□ 2.73
ME3-210ENST00000532471 NME9Q86XW9 330 aa32.11■■■□□ 2.73
ME3-210ENST00000532471 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa32.1■■■□□ 2.73
ME3-210ENST00000532471 MON2Q7Z3U7 1717 aa32.1■■■□□ 2.73
ME3-210ENST00000532471 AATKQ6ZMQ8 1374 aa32.09■■■□□ 2.73
ME3-210ENST00000532471 USP31Q70CQ4 1352 aa32.09■■■□□ 2.73
ME3-210ENST00000532471 KRT27Q7Z3Y8 459 aa32.08■■■□□ 2.73
ME3-210ENST00000532471 ARHGEF25Q86VW2 580 aa32.08■■■□□ 2.73
ME3-210ENST00000532471 ZRANB1Q9UGI0 708 aa32.08■■■□□ 2.73
ME3-210ENST00000532471 USP35Q9P2H5 1018 aa32.07■■■□□ 2.72
ME3-210ENST00000532471 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa32.07■■■□□ 2.72
ME3-210ENST00000532471 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
ME3-210ENST00000532471 CCDC125Q86Z20 511 aa32.06■■■□□ 2.72
ME3-210ENST00000532471 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa32.06■■■□□ 2.72
ME3-210ENST00000532471 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
ME3-210ENST00000532471 TCP11L2Q8N4U5 519 aa32.02■■■□□ 2.72
ME3-210ENST00000532471 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
ME3-210ENST00000532471 BARGINQ6ZT62 677 aa32.01■■■□□ 2.71
ME3-210ENST00000532471 COG3Q96JB2 828 aa32.01■■■□□ 2.71
ME3-210ENST00000532471 LMO7Q8WWI1 1683 aa31.99■■■□□ 2.71
ME3-210ENST00000532471 POLR3GLQ9BT43 218 aa31.99■■■□□ 2.71
ME3-210ENST00000532471 AXIN2Q9Y2T1 843 aa31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms